国家科技基础条件平台建设计划(2005DKA21207) 作品数:9 被引量:31 H指数:4 相关作者: 朴春根 李永 郭民伟 田国忠 汪来发 更多>> 相关机构: 中国林业科学研究院 四川农业大学 中国农业大学 更多>> 发文基金: 国家科技基础条件平台建设计划 国家自然科学基金 国家社会公益研究专项计划 更多>> 相关领域: 农业科学 更多>>
尖峰岭抗逆性根瘤菌的筛选及其16S rDNA序列的测定 被引量:3 2010年 为了探讨木本豆科植物根瘤菌对不良环境的抵抗能力,对分离自海南尖峰岭国家自然保护区的9株根瘤菌进行了初步研究。结果发现:9株根瘤菌最适生长pH值均为7,最适NaCl含量均为10.0 g.kg-1;菌株CAF224的最适生长温度为37℃,菌株CAF416、CAF438和CAF279的最适温度为20-28℃,其余5株为28℃。9株根瘤菌均可在pH值4-11、NaCl 20.0 g.kg-1、37℃条件下生长,其中CAF224和CAF276菌株耐受pH值3;CAF226可以在40.0 g.kg-1NaCl培养基中生长;CAF276可耐受20 min 50℃、10 min 60℃高温。不同宿主、不同生态条件下的根瘤菌株具有不同的抗逆性,通过综合分析,筛选出4株高抗菌株(CAF226、CAF276、CAF224、CAF414)。16S rDNA序列系统发育分析表明:9菌株在系统进化树上与GenBank中序列号为EF054889的Rhizobium tropiciClone H12(热带根瘤菌)聚为一族,相似度为99.4%,初步确定9株根瘤菌为热带根瘤菌。 彭玉红 焦如珍 牟新涛关键词:抗逆性 RDNA序列 长春花花叶病病原物的分离和鉴定 2008年 长春花病原物采自海南省琼海市博鳌镇和广东省广州市星海公园,症状表现为系统花叶与畸形,对其进行染病外植体组织培养、鉴别寄主反应、传播方式鉴定、病毒粒体形态观察和血清学反应及病叶双链RNA(dsRNA)分析。引起长春花花叶病的病原物鉴定为黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV),克隆该病毒分离物外壳蛋白基因核苷酸序列,并对该核苷酸序列进行生物信息学分析,结果显示侵染我国长春花引起长春花花叶和畸形的CMV分离物应初步划归在CMVIB亚组。 曹言勇 施艳 范在丰 宋丽敏 田国忠关键词:花叶病 黄瓜花叶病毒 臭矢菜丛枝病植原体的分子鉴定研究 被引量:4 2009年 本实验采用DAPI荧光显微镜、PCR、克隆和测序等技术,对海南臭矢菜丛枝病样进行了检测和鉴定。以染病臭矢菜总DNA为模板应用3对植原体特异性引物进行PCR扩增,获得PCR产物为16S rDNA(1 430 bp)、16S-23S rDNA(358bp)、rpDNA(1 294 bp)。应用DNA回收试剂盒获得了3个PCR扩增片断的纯化产物,并克隆到DH5α大肠杆菌中测序。应用DNAMAN和MEGA软件对获得的序列与NCBI数据库中植原体序列进行同源性分析和构建系统发育树。结果显示臭矢菜丛枝病植原体与花生丛枝病植原体序列同源性最高,16S rDNA的序列同源性为99.9%,16S-23S rDNA高达100%,rp为99.7%,因而将臭矢菜丛枝病植原体归为花生丛枝组(16SrⅡ),根据16S rDNA的RFLP分析,将其归为16SrⅡ-A亚组。 李永 田国忠 徐启聪 朴春根 汪来发 郭民伟关键词:植原体 分子鉴定 处理松材线虫病病死松树伐桩木腐菌的筛选 被引量:9 2008年 测试了木腐菌对松材线虫繁殖的影响以及对马尾松木块和松材线虫病病死树伐桩的分解能力,结果表明,供试菌株除裂褶菌菌株外,其他菌株都能抑制松材线虫的繁殖,其中松材线虫在松生拟层孔菌菌株W10、W11,硫磺菌菌株5452、6600,粗皮侧耳菌株6221,虎掌菌菌株6320,茯苓菌株6284,灵芝菌株6501菌落上完全不能存活。对马尾松木块的分解试验结果表明,松生拟层孔菌菌株W10、W11、硫磺菌菌株6600、杂色云芝菌株6923、茯苓菌株6284对马尾松木块具有较强的分解能力。田间接种硫磺菌菌株6600、杂色云芝菌株6923、松生拟层孔菌菌株W11、茯苓菌株6284和粗皮侧耳菌株6221处理松材线虫病病死树伐桩70 d后,硫磺菌菌株6600和杂色云芝菌株6923表现出对松材线虫病病死树伐桩较强的分解能力,这2个菌株可作为今后利用木腐菌处理松材线虫病病死树伐桩的潜力菌株。 陈瑶 汪来发 朴春根 朱天辉 申相澈 郑荣镇关键词:木腐菌 松材线虫病 伐桩 猪屎豆丛枝病植原体的分子检测与鉴定 被引量:3 2010年 Crotalaria witches’-broom phytoplasma (CrWB) collected from Hainan Province,was classified and identified by sequencing techniques and Virtual RFLP.Two different type universal primer pairs of phytoplasma were used to amplify a 1.8 kb fragment of 16S rDNA and a 1.3 kb fragment of rp gene.The PCR-amplified products were cloned and sequenced.The results of sequencing and homologuous comparison with other phytoplasmas showed that Crotalaria witches’-broom phytoplasma shared 99.9 % similarity with peanut witches’-broom phytoplasma in 16S rRNA gene and 99.9% in rp gene.Crotalaria witches’-broom phytoplasma is sorted into Peanut witches’-broom group(16SrII),16SrII-A,according to the results of Virtual RFLP of 16S rDNA,phylogenetic analysis of 16S rRNA and rp gene,which is related to Ca.Phytoplasma australasiae. 李永 徐启聪 田国忠 郭民伟 朴春根关键词:植原体 分子鉴定 灰叶丛枝病病原的分子鉴定及系统发育分析 被引量:2 2011年 实验应用PCR扩增i、PhyClassifer分析、序列同源性及系统发育分析等方法对海南省灰叶丛枝病病害进行了分子检测及其病原的鉴定、系统进化研究。iPhyClassifer结果显示:灰叶丛枝病植原体为花生丛枝组(16SrⅡ组)16SrⅡ-A成员。序列同源性分析结果表明:灰叶丛枝病植原体与16SrⅡ、16SrⅡ-A成员同源性最高,如与花生丛枝病植原体16S rDNA的序列同源性为99.9%r,p基因为99.9%。基于16S rRNA和rp两基因构建的系统发育树显示:灰叶丛枝病植原体与花生丛枝病植原体、甘薯丛枝病植原体起源相同,且关系相当接近。根据以上结果,灰叶丛枝病植原体归为花生丛枝组(16SrII组)16SrⅡ-A亚组,与Candidatus Phytoplasma australasiae候选种相关。 李永 田国忠 朴春根 郭民伟 林乐民关键词:植原体 分子鉴定 系统发育 北京市杨树人工林微生物区系分析 被引量:5 2010年 选取107杨、108杨和毛白杨3种杨树人工林,采用分子生物学鉴定方法对人工林中叶面、皮部和土壤中可培养的微生物的数量变化和优势种群动态变化进行分析。结果表明:细菌的数量在107杨与108杨、107杨与毛白杨之间的差异均显著,而在108杨与毛白杨之间的差异不显著;叶面、皮部和土壤的细菌数量差异均显著,107杨夏季和秋季的细菌数量占有优势地位,毛白杨冬季和春季的细菌数量占有优势地位;107杨秋季的细菌数量最高,108杨和毛白杨的较低,季节变化直接影响着细菌数量的变化,是细菌区系变化的主要影响因素;细菌的优势种群以假单胞菌和芽孢杆菌等为主;真菌的数量在107杨与108杨、107杨与毛白杨之间的差异均显著,而在108杨与毛白杨之间的差异不显著,这与细菌的变化规律相似;秋季真菌的数量与其他3季相比差异显著;季节的变化对叶面真菌数量的影响相对较大,而对皮部真菌数量的变化影响相对较小;季节变化对土壤中真菌数量的变化有显著影响,但在春季和秋季差异不大;真菌的优势种群以杨盘二孢菌和棘壳孢等为主,其中棘壳孢在杨树人工林的叶面、皮部和土壤中均占有较高比例,是杨树人工林中真菌的主要类群。 田柳 任桂芳 李永 郭民伟 朴春根关键词:杨树人工林 微生物区系 一株分离自含羞草的β-根瘤菌的生物学特性研究 被引量:1 2010年 从海南尖峰岭自然保护区巴西含羞草的根瘤中分离到一株根瘤菌,编号为caf324,经过16S rDNA全序列测定和系统发育分析,发现caf324与β-根瘤菌含羞草伯克霍尔德菌PAS44(AY752958)的亲缘关系很近,相似度达到99.7%。通过部分生理生化测定发现,caf324接触酶、氧化酶和硝酸盐还原试验均为阳性,不能利用明胶和淀粉,不能利用葡萄糖发酵产酸,不能水解酪素,不能产生吲哚和3-酮基乳糖;抗逆性研究表明,caf324的生长范围广,可耐2%的NaCl,耐酸碱(pH4~11),最高生长温度45℃。 彭玉红 焦如珍 牟新涛关键词:抗逆性 生物学特性 海南省猪屎豆丛枝病植原体的鉴定 <正>猪屎豆(Crotalaria pallida Ait)是我国南方地区的多年生小灌木,茎叶可做绿肥和饲料。最早于1979年在我国广东博罗县猪屎豆上发现丛枝病的发生,并通过电镜观察证明在病叶脉筛管内存在大小为90~10... 李永 田国忠 朴春根 徐启聪 赖帆 汪来发 刘志昕 陈慕容文献传递 不同来源植原体组织培养苗的长期保藏研究 <正>由于植原体为韧皮部专性寄生菌,不能人工离体培养,给这类病害研究带来了许多困难。比如毒源的采集与保存、病菌的纯化、病理学研究、抗病性鉴定等常受到季节、采样地点、环境人为条件等的限制。本研究试图将不同地区、各种植物上采... 田国忠 李建民 朴春根 李永 黄金光 赖帆 徐启聪 黄钦才 郑翠文献传递