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甘肃省重点实验室建设计划(1106RTSA021)

作品数:4 被引量:8H指数:1
相关作者:马尧沈玉琳金能智张海蓉彭天蜀更多>>
相关机构:甘肃省计算中心更多>>
发文基金:甘肃省重点实验室建设计划陇原青年创新人才扶持计划甘肃省应用技术研究与开发专项计划项目更多>>
相关领域:生物学理学自动化与计算机技术更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 2篇生物学
  • 1篇自动化与计算...
  • 1篇理学

主题

  • 1篇形式化
  • 1篇形式化语义
  • 1篇神经氨酸酶
  • 1篇生物序列
  • 1篇生物序列比对
  • 1篇酸酶
  • 1篇领域本体
  • 1篇流感
  • 1篇流感病毒
  • 1篇描述逻辑
  • 1篇进化分析
  • 1篇进化树
  • 1篇服务本体
  • 1篇本体
  • 1篇GPGPU
  • 1篇病毒

机构

  • 3篇甘肃省计算中...

作者

  • 2篇金能智
  • 2篇沈玉琳
  • 2篇马尧
  • 1篇王小龙
  • 1篇张其斌
  • 1篇章恒
  • 1篇彭天蜀
  • 1篇张海蓉

传媒

  • 1篇病毒学报
  • 1篇软件
  • 1篇生物信息学

年份

  • 1篇2014
  • 2篇2013
4 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
面向GMA目录服务的领域本体建模研究被引量:1
2013年
提出构建目录服务本体对GMA目录服务组件维护的网格资源信息提供语义一致的描述,从而弥补使用关系数据库或XML组织信息时产生的语义缺陷。结合国家网格甘肃计算节点的实际情况基于描述逻辑进行本体建模,对支持任意实际运行的网格的目录服务本体及其语义进行形式化分析,提出了可以满足这类本体的模型。基于OWL-dl构建了一个目录服务本体的实例,使用sparql语言进行查询,验证了目录服务本体的正确性及可行性。
王小龙张其斌章恒
关键词:描述逻辑形式化语义
GPGPU加速生物序列比对研究进展
2013年
序列比对是生物信息学中最常用和最经典的研究手段。生物序列比对需要有强大计算能力的硬件支撑,而近年快速发展起来的GPGPU正好可堪此任。本文首先介绍GPGPU的发展过程,进而讲述GPGPU硬件设备与其编程环境,然后对GPGPU做科学计算时需要的数学库函数做一介绍,最后综述近年来国内外基于GPGPU的生物序列比对软件和相关研究工作,并总结和展望其辉煌前景。
沈玉琳金能智孙一桐者建武马尧
关键词:GPGPU
A/H7N9流感病毒神经氨酸酶进化分析被引量:7
2014年
世界卫生组织报道2013年在中国出现首例人感染H7N9流感病毒病例,这在我国一定的范围内造成了危害,引起了恐慌,因此利用生物信息技术对其进行研究显得十分必要。神经氨酸酶NA是流感病毒最重要的抗原之一,也是抗流感药物的重要作用靶点。从美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)数据库下载A/H7N9流感病毒NA基因核酸序列及其编码蛋白序列,利用MEGA5.0软件对核苷酸编码序列构建系统进化树,利用BioEdit软件进行比对,分别作核苷酸与氨基酸同源性计算,继而分析NA基因重要位点变异情况,结果显示H7N9流感病毒传播呈现一定的地域关系和时间关系,2013年流行的中国的毒株属于亚欧型,其NA茎区发生了比较明显的变异,这也许是该病毒感染人类的原因之一。这些分析结果对于研究H7N9流感病毒基因的进化关系和变异趋向具有重要的参考价值。
孙一桐金能智张海蓉沈玉琳马尧彭天蜀
关键词:流感病毒神经氨酸酶进化树
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