云南省应用基础研究基金(2008CC021)
- 作品数：7 被引量：16H指数：3
- 相关作者：史荔史磊褚嘉祐姚宇峰黄小琴更多>>
- 相关机构：中国医学科学院北京协和医学院昆明医学院更多>>
- 发文基金：云南省应用基础研究基金国家自然科学基金美国中华医学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 中国壮族和裕固族群体HLA Ⅰ类区域Alu插入多态性及其与HLA-A位点的相关性被引量：2
- 2011年
- 近年来研究发现：位于HLAI类基因区域的Alu插入是研究不同群体HLAI类基因区域祖先单倍型和HLAI类基因多样性产生、进化和重组的理想工具。文章对中国壮族和裕固族群体HLAI类基因区域5个Alu插入多态性（AluMICB、AluTF、AluHJ、AluHG和Alu月-进行研究，结合HL4基因分型数据，分析壮族、裕固族、哈尼族、布朗族和傣族5个民族群体中Alu插入与m4卅等位基因的关系。研究结果显示：（1）壮族和裕固族人群中5个Alu插入频率范围分别为1．5％～35．8％和9．2～34．8％，AluMICB、AIuTF和AluHF插入频率在这两个群体中有统计学差异（P〈0．05）；（2）在5个研究的群体中，AluHG插入与H幽卅＊02的不同亚型关联；AluHJ插入与HLA-A＊2402在5个群体中都关联，但AluHJ与HLA-A＊1101和HLA-A＊2407只在布朗族中关联。表明不同群体HLAI类基因区域内Alu插入具有各自的特征，且Alu插入与不同的m4卅等位基因相关联。这种Alu插入及其与肌爿．爿的关联特征可作为研究群体中HLAI类基因和单倍型系谱变化的重要遗传标记。
- 史磊姚宇峰史荔陶玉芬于亮黄小琴林克勤易文孙浩杨昭庆褚嘉祐
- 关键词：HLA
- 中国傈僳族和怒族群体HLAⅠ类区域Alu插入多态性研究
- 位于HLAⅠ基因区域的Alu插入是研究不同群体HLAⅠ类基因区域祖先单倍型,HLAⅠ类基因多样性的产生、进化和重组的理想工具。本文对中国两个隔离群体(傈僳族和怒族)HLAⅠ类基因区域5个Alu插入多态性位点(AluMIC...
- 董兆梅姚宇峰史磊陶玉芬林克勤褚嘉祐史荔
- 文献传递
- 中国4个民族群体HLA-G基因14bp插入/缺失多态的分布特征及其HLA-A位点的相关性被引量：4
- 2013年
- 近年来,位于HLA-G基因第8外显子3′UTR的一个14 bp插入/缺失多态位点与复发性流产、自身免疫性疾病和肝癌等疾病相关而引起广泛关注。本实验室前期的研究表明,不同群体的HLA-G基因14 bp插入/缺失频率具有群体语系分布特点。文章对土族、裕固族、傈僳族和怒族进行HLA-G基因14 bp插入/缺失的基因分型,结合HLA-A基因分型数据,分析土族、裕固族、傈僳族和怒族4个民族群体中14 bp插入/缺失与HLA-A等位基因的关系。研究结果显示:(1)尽管HLA-G基因14 bp插入频率在不同群体中的分布具有各自群体的特点,但遵循着按语系及语族分布的规律,除汉藏语系汉语族与阿尔泰语系蒙古语族无差异外,语族间差异明显;(2)不同群体中,14 bp插入与不同的HLA-A等位基因相关联。
- 张华陶玉芬史磊姚宇峰向昊林克勤黄小琴褚嘉祐史荔
- 关键词：HLA-G基因语系HLA-A基因
- 基诺族、毛南族和佤族人类白细胞抗原C等位基因及Ⅰ类区域内C-B和A-C-B单倍型的分布特征
- 2011年
- 目的研究中国西南地区基诺族、佤族和毛南族中人类自细胞抗原（human leukocyte antigen．HLA）C等位基因及HLAI类区域内C—B和A—C—B单倍型分布特点。方法采用聚合酶链反应一序列特异性寡核苷酸分型技术（polymerase chain reaction sequence specific oligonucleotide, PCR SSO）对中国西南地区基诺族99名、佤族U5名和毛南族85名进行HLAC高分辨率基因分型，结合前期发表的HLA—A、B分型结果，构建HLAI类区域内HLAA，-B和-C位点的单倍型。结果3个群体中共检出HLA—C等位基因18种，其中基诺族中17种、毛南族中13种和佤族中15种。基因频率〉10％的等位基因在这3个群体中的分布为：基诺族中从高到低依次为C＊08：01、C＊01：02、C：＊03：04和C＊07：02；毛南族中依次为C＊03：04、C＊01：02、C＊07：02和C＊08：01；佤族依次为C＊12：03、C＊08：01、C＊07：02和c＊04：01。基诺族中优势AC—B单倍型包括A＊02：07-C＊01：02-B＊46：01、A＊11：01-C＊08：01-B＊15：02和A＊11：01-C＊03：04-B＊13：01；毛南族中包括A＊11：01-C＊03：04B＊13：01、A＊02：07-C＊01：02-B＊46：01、A＊11：01-C＊08：01-B＊15：02和A＊02：03-C＊07：02-B＊38：02；佤族中包括A＊11：01C＊08：01B＊15：02、A＊11：01—C＊12：03-B＊15：32和A＊11：01-C＊04：01—B＊35：01。结论基诺族、佤族、毛南族中HI。A—C等位基因与HLA—A、B位点构建的单倍型具有各自的分布特点，但单倍型C＊08：01B＊15：02和A＊11：01-C＊08：01-B＊15：02在3个群体中共有并呈高频分布。推测这两种单倍型可能是中国南方群体的祖先单倍型。另外，在基诺族、佤族和毛南族中各自具有其独特的优势单倍型。因此，HLA基因型和单倍型分布特点对这些群体的起源、迁徙、进化和疾病关联研究具有参考价值。
- 史磊陶玉芬史荔姚宇峰于亮林克勤黄小琴易文孙浩褚嘉祐
- 关键词：单倍型基诺族毛南族佤族
- 云南傣族、汉族HLA-G基因14bp插入/缺失多态性研究被引量：8
- 2010年
- 14bp插入/缺失多态性是指存在于HLA-G基因第8外显子3′非翻译区(3′UTR)的一个插入/缺失多态,因其能影响HLA-GmRNA的稳定性,并进一步影响HLA-G蛋白的翻译而受到广泛关注。文章采用PCR和电泳技术对云南傣族和汉族两个人群进行了HLA-G基因14bp插入/缺失多态性的检测分析,结果显示傣族和汉族人群+14bp等位基因频率分别为31.97%和40.87%,+14bp/+14bp基因型频率分别为8.20%和17.31%,+14bp/-14bp基因型频率分别为47.54%和47.11%。与国内外已报道的其他人群的数据比较表明:云南汉族群体中HLA-G基因14bp插入/缺失的分布与其他群体相似;傣族则有自己独特的基因型和等位基因分布特点,推测其可能受到了遗传漂变的作用,但不排除自然选择作用的影响。
- 陈金宝史磊姚宇峰史荔于亮林克勤陶玉芬易文黄小琴孙浩褚嘉祐
- 关键词：HLA-G基因自然选择
- 中国傈僳族和怒族群体人类白细胞抗原Ⅰ类基因区Alu插入多态性研究被引量：1
- 2012年
- 目的研究中国两个隔离群体（傈僳族和怒族）人类白细胞抗原（human leukocyte antigen，HLA）Ⅰ类基因区域内5个HLA—Alu插入多态性（AluMICB、AluTF、AluHJ、AluHG和AluHF）的分布特征。方法应用聚合酶链反应技术对中国两个隔离群体傈僳族（107人）和怒族（104人）进行HLA-Alu多态性分型。结合HLA基因分型数据，分析这两个群体中HLA—Alu插入与HLA—A、HLA—B和HLA—C基因的关系。根据HLA-Alu频率计算各群体间遗传距离，构建系统进化树。结果AluTF和AluHF插入的频率在这两个群体间的差异有统计学意义（P〈0．05），其余位点差异无统计学意义。HLA-Alu插入与HLA的关联程度在两个群体中有差异，如AluTF＊2与HLA-B＊56：01均有关联，但在傈僳族中呈强关联（74．0％），在怒族中仅存在中等程度的关联（30．7％）。傈僳族和怒族群体中，HLA-Alu插入与HLA基因的不同亚型具有关联，如AluHG＊2与HLA—A＊02的不同亚型存在关联。系统进化树显示中国傈僳族和怒族与我国南方群体及泰国人群聚为一支。结论不同群体中HLA-Alu插入与HLA不同等位基因的关联程度存在差异，这种差异性为研究HLAⅠ类基因多样性的产生和进化、祖先单倍型的形成以及该区域内连锁不平衡和重组提供了新的线索。
- 董兆梅姚宇峰史磊陶玉芬林克勤黄小琴杨昭庆褚嘉祐史荔
