国家质检总局科技计划项目(2010IK256)
- 作品数：2 被引量：39H指数：2
- 相关作者：钱路常虹安榆林杨晓军郝德君更多>>
- 相关机构：江苏出入境检验检疫局南京林业大学更多>>
- 发文基金：国家质检总局科技计划项目国际科技合作与交流专项项目国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 小蠹科昆虫基因组DNA提取方法的比较研究被引量：7
- 2013年
- 为探讨小蠹科昆虫基因组DNA的提取方法,分别以单头削尾材小蠹、削尾材小蠹足部肌肉组织以及多年75%酒精浸渍标本为研究对象,采用经典的酚仿抽提法、改良的CTAB法、SDS法及动物组织/细胞基因组DNA提取试剂盒(即磁珠法)4种方法提取小蠹基因组DNA,对提取的基因组DNA进行分光光度值的测定以及COⅠ基因扩增。结果表明:4种方法均可从单头标本中提取总DNA;对于75%酒精浸渍2年的标本,4种方法均适用,大于2年的浸渍标本,仅磁珠法适用,且磁珠法适合微量组织总DNA的提取。
- 常虹郝德君杨晓军肖荣堂刘勇钱路安榆林
- 关键词：小蠹科基因组DNA分子鉴定
- 基于线粒体COⅠ基因的齿小蠹属昆虫DNA条形码研究被引量：32
- 2012年
- 齿小蠹属(鞘翅目:小蠹科)昆虫是植物检疫中经常截获的类群,为探讨线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因的特定区段作为DNA条形码快速准确鉴定齿小蠹种类的可行性,以齿小蠹属昆虫为研究对象,测定分析了线粒体COⅠ基因462bp碱基序列。序列分析结果显示:变异位点为259个,保守位点203个,简约信息位点181个,自裔位点78个。所有位点中,A,G,C和T碱基平均含量分别为30.7%,16.5%,17.0%和35.8%。A+T含量较高,为66.5%,明显高于G+C含量,表现明显的A+T碱基偏嗜,且A与T含量相当,符合昆虫线粒体基因碱基组成的基本特征。转换与颠换结果显示:该段序列未达到饱和,可以得到准确的进化分析。利用Kimura2-parameter模型分析遗传距离得到,同物种间的遗传距离介于0.002～0.007之间,不同种间的遗传距离介于0.056～0.431间,平均遗传距离为0.199,说明该段序列能够区分不同物种。基于COⅠ基因序列构建的邻接法系统发育树(NJ树)显示,同一物种聚为同一小支,且分支自展值均为100%;近缘种能聚集在一起,且置信度很高(≥97%)。结果表明应用基于COⅠ基因片段的DNA条形码进行齿小蠹属昆虫分类鉴定具有可行性。
- 常虹郝德君肖荣堂刘勇钱路安榆林杨晓军
- 关键词：齿小蠹属DNA条形码系统发育树
- 基于线粒体COⅠ基因齿小蠹属Ips昆虫DNA条形码研究
- 齿小蠹属(鞘翅目：小蠹科)昆虫是植物检疫中经常截获的类群,为探讨线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(CoⅠ)基因的特定区段作为DNA 条形码快速准确鉴定齿小蠹的可行性,以齿小蠹属昆虫为研究对象,采用磁珠法测定分析了线粒体CoⅠ...
- 常虹郝德君肖荣堂刘勇钱路安榆林杨晓军
- 关键词：齿小蠹属DNA条形码系统树
