四川省“十一五”农作物及畜禽育种攻关项目(2006YZGG12-3)
- 作品数：2 被引量：67H指数：2
- 相关作者：何涛刘静淳泽更多>>
- 相关机构：中国科学院成都生物研究所中国科学院研究生院更多>>
- 发文基金：四川省“十一五”农作物及畜禽育种攻关项目国家科技支撑计划国家级星火计划更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 基于ITS序列的中国药用石斛及其混伪品的分子鉴定被引量：25
- 2009年
- 目的：通过测定17种药用石斛的rDNA ITS全序列,构建分子系统树,在分子水平对待检种进行鉴别,为石斛的分子鉴定提供依据。方法：采用改良的CTAB法提取石斛叶片DNA,PCR扩增rDNAITS区全序列,产物回收纯化后直接测序,运用Bioedit,MEGA4.0等软件分析石斛属植物的rDNA ITS序列的特征。结果：建立了17种药用石斛rDNA ITS区碱基全序列数据库,其中,ITS1的长度为228-234 bp,GC量为45.7%-53.0%,变异位点167个,占总位点67.34%,信息位点106个,占总位点42.74%;ITS2长度为241-247 bp,GC量为44.8%-55.7%,变异位点165个,占总位点66.27%,信息位点115个,占总位点46.18%。属间的遗传距离为0.295,石斛种间的平均遗传距离为0.142,种内各居群间的平均遗传距离为0.002。结论：利用17种石斛的全序列数据库及遗传分析软件,通过对待检种rDNA ITS区进行序列测定,可以在分子水平对石斛不同种质进行鉴别,为石斛的分子鉴定提供依据。
- 刘静何涛淳泽
- 关键词：石斛属ITS序列分子鉴定
- 药用石斛的叶绿体matK基因序列分析及鉴别被引量：46
- 2009年
- 比较22份(包括待检材料4份)共计12种药用石斛及密花石豆兰(1份)的叶绿体DNA matK基因序列差异,从分子水平对药用石斛进行鉴定。采用改良的CTAB法提取石斛基因组DNA,PCR扩增,克隆测序法对叶绿体DNA matK基因全序列进行测定,运用BioEdit、MEGA4.0等软件分析序列,构建分子系统树。测得石斛属12种植物的叶绿体matK基因长1410bp,变异位点51个,信息位点11个。除了存在碱基替换的遗传变异外,还存在碱基的插入和缺失。石斛种间以及种内不同居群(品种)间均能在NJ树中明显分化开来,种间平均遗传距离为0.008,种间最大遗传距离为0.014,最小遗传距离为0.003,碱基相差8～20个。种内不同居群(品种)遗传距离为0.001,相差1～5个碱基。并成功地对4种待检种进行了鉴定。利用12种石斛的matK基因全序列数据库及遗传分析软件,通过对待检种的matK基因全序列进行测定,可以在分子水平对石斛不同种及种内不同居群(品种)进行鉴别,为石斛的分子鉴定提供依据。
- 刘静何涛淳泽
- 关键词：石斛分子鉴定
