陕西省自然科学基金(SJ08C110)
- 作品数：5 被引量：7H指数：2
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- 相关机构：西北农林科技大学河南农业大学更多>>
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- 4株鸡肾型IBV陕西分离株3种主要结构蛋白基因的遗传变异分析被引量：3
- 2014年
- 采用RT—PCR方法对近年来本实验室分离的4株肾型IBV陕西分离株的纤突蛋白S1基因、膜蛋白基因（M）和核蛋白基因（N）分别进行扩增，测序后进行遗传变异分析。结果显示：与肾型疫苗株w93相比，各分离株S1基因均存在广泛的点突变，并且都存在基因插入现象，分离株之间氨基酸同源性为75．8％～99．4％；M基因除了存在点突变外，W09和WNl2在其5’端还存在9个核苷酸的缺失，分离株之间氨基酸同源性为91．0％～99．6％；N基N无插入和缺失，但存在基因点突变，分离株之间氨基酸同源性为99．3％～99．5％。4株IBV分离株在S1、M和N基因氨基酸系统进化树上分属于不同的进化群，且都与较早的肾型IBV陕西分离株w118遗传距离较远。结果表明，4株鸡肾型IBV流行毒株的s1、M和N基因均存在不同程度变异，这可能是免疫鸡群肾型鸡传染性支气管炎长期流行的主要原因．
- 杨涛张淑霞郝华芳刘青天陈胜利杨增岐王兴龙杜恩岐党如意
- 关键词：鸡肾型传染性支气管炎病毒S1基因M基因
- 肾型IBV陕西分离株CK/CH/Shaanxi/2009/H09全基因的克隆与序列分析
- 2013年
- 为了解鸡肾型传染性支气管炎病毒陕西流行株的分子生物学特征，参考DY07株全基因核苷酸序列设计22对引物，采用RT PCR方法对西北农林科技大学动物医学院禽病研究室分离的1株肾型IBV陕西分离株CK/CH/Shaanxi/2009/H09的全基因进行分段扩增并测序，将测序成功的各序列依次拼接，得到全基因序列后进行序列比对分析。研究结果表明，该分离株基因组全长27 675 bp，共有10个开放阅读框，其基因排序为5′cap Replicase S 3a 3b 3c M 5a 5b N poly（A）3′，纤突蛋白裂解位点为到536RRFRR540， 3a、5a和N基因的大小与参考毒株相比是保守的，但编码其他蛋白的基因长度存在差异；同源性分析结果显示，该毒株与48个参考毒株的同源性为85.2%~93.5%；系统进化树分析结果显示，该毒株与中国分离株ck/CH/LDL/091022、YX10株和DY07 株的亲缘关系较近，同属于中国近年来主要流行的血清型毒株，但在基因水平上已经产生一定程度的变异。
- 杨涛张淑霞杨增岐刘青天郝华芳陈胜利杜恩岐王兴龙党如意王晶钰
- 关键词：鸡肾型传染性支气管炎病毒全基因
- 鸡传染性支气管炎病毒HN99株膜蛋白基因的分子特征分析被引量：1
- 2010年
- 根据GenBank中已经公布的鸡传染性支气管炎病毒株M基因序列,设计并合成1对特异引物,利用RT-PCR方法扩增出IBV河南分离株HN99株M基因的全长片段,然后进行克隆、测序,获得了长度为669 bp的HN99株M基因全序列,编码M蛋白222个氨基酸残基,其N端的前60 nt为前导序列,近N端含有1个潜在的N-糖基化位点,M基因编码的膜蛋白中含有9个高度保守的半胱氨酸;HN99株M蛋白点突变较多,且突变位点呈散在分布遍及整个ORF,主要表现为碱基的插入和缺失,在Glu 21~Leu 37,Ser 45~Ile 68,Pro 74~Phe 94位氨基酸的区域内形成3个跨膜区域,在39 Try^43 Thr,171 Ile^176 Pro,183 Arg^193 Ser位氨基酸处含有3个潜在的抗原位点;与GenBank中的11个国内外参考毒株相比,IBV-HN99株M基因核苷酸同源性为87.0%~90.3%,推导的氨基酸同源性为89.7%~94.2%;在系统发生进化树中,HN99株M基因与其他参考毒株属于不同的分支,亲缘关系均较远.
- 贺秀媛张淑霞张志平张君涛陈红英王川庆崔保安王建华
- 关键词：传染性支气管炎病毒M基因分子特征
- 鸡传染性支气管炎病毒W株膜蛋白基因的分子特征被引量：3
- 2009年
- 【目的】研究鸡传染性支气管炎病毒（IBV）W侏膜蛋白基因的分子特征。【方法】根据GenBank中已发表的鸡传染性支气管炎病毒M基因序列，设计并合成1对特异性引物，利用RT-PCR技术成功扩增了IBV河南地方分离毒株W株M基因全长片段，然后进行克隆、测序，并与GenBank中发表的11株国内外参考毒株进行比较分析。【结果】获得的W株M基因全长为681bp，编码M蛋白226个氨基酸残基，其N端的前60nt为前导序列，近N端含有2个潜在的N-糖基化位点；3个跨膜区域分别位于21-37，45～68，74～94aa处，在171～176，183～193aa处有2个潜在的抗原位点，且M蛋白上有9个高度保守的半胱氨酸；与参考毒株相比，IBV-W株M基因的核苷酸同源性为88．2％～92．7％，推导的氨基酸同源性为91．1％～95．67％；M蛋白的突变主要发生在前16位氨基酸，其中第2位缺失1个氨基酸，第3～6位连续插入4个氨基酸，第8～9位缺失2个氨基酸，第14～16位的3个氨基酸发生连续突变，其他位点的氨基酸变异为点突变，M蛋白核苷酸序列的变异主要表现为静默突变，亲水区较疏水区更易变易；在系统发生进化树中，W株与BJ株处于同一个小的分支上，亲缘关系较近，而与其他参考株的亲缘关系较远。【结论】推测W株可能是一个新的变异株。
- 贺秀媛张淑霞张君涛陈红英王川庆崔保安王建华
- 关键词：M基因分子特征
- 鸡传染性支气管炎病毒SX-H09株膜蛋白基因的克隆及序列分析
- 2011年
- 对鸡传染性支气管炎病毒(IBV)陕西分离株SX-H09株膜蛋白(M)基因进行克隆和序列分析。根据GenBank发表的IBV基因序列设计1对特异性引物,RT-PCR扩增IBV M基因片段,并进行克隆、序列测定和分析。结果表明,SX-H09株M基因全长为678 bp,编码225个氨基酸。同源性比较可知,SX-H09株M基因与参考株M基因的核苷酸序列同源性为82.6%～99.6%,推导的氨基酸序列同源性为81.0%～99.6%。系统发育进化树表明,SX-H09株与参考株DY07和IBVSX7在同一个分支上,亲缘关系较近。
- 吴此玲张淑霞郝华芳杨增岐
- 关键词：鸡传染性支气管炎病毒M基因
