教育部“新世纪优秀人才支持计划”(NCET-06-0810)
- 作品数：12 被引量：56H指数：5
- 相关作者：杨足君任正隆刘成李光蓉周建平更多>>
- 相关机构：电子科技大学四川农业大学西昌学院更多>>
- 发文基金：教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家自然科学基金四川省教育厅重点项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学电子电信更多>>
- 小麦族物种澳冰草的α醇溶蛋白基因的分子克隆与进化分析
- 用酸性聚丙烯酰胺(A-PAGE)分析结果表明,与其他小麦族物种相比,澳冰草 (Australopyrum retrofractum)表现独特的α-醇溶蛋白(α-gliadin)的特征带。利用澳冰草的基因组 DNA 为模板...
- 李光蓉张韬雷孟平曾子贤曾雪任正隆杨足君
- 关键词：小麦族
- 文献传递
- 水稻基因组MSAP指纹图谱构建及DNA甲基化修饰位点分离、鉴定
- 本研究采用 EcoR Ⅰ和 Hpa Ⅱ/Msp Ⅰ双酶切建立适合于水稻基因组的"甲基化敏感扩增多态性"(methylation-sensitive amplification polymorphism。MSAP)分析体系...
- 张勇邓科君张韬杨足君彭金华李光蓉任正隆
- 关键词：水稻表观遗传MSAP
- 文献传递
- 非洲黑麦染色体特异性标记的建立与应用被引量：3
- 2008年
- 以非洲黑麦、小麦-非洲黑麦双二倍体、安岳排灯麦等为材料筛选100条ISSR引物。其中,引物UBC815可在非洲黑麦中扩增出1条长561bp的特异性片段(命名为pSaUBC815561),而小麦对照均未扩出该片段。引物UBC815同样能在黑麦属的瓦维洛夫黑麦(Secale vavilovii Grossh.)、森林黑麦(Secale sylvestre Host.)等5个种扩增出pSaUBC815561。根据pSaUBC815561设计特异PCR引物U815-F、U815-R,对小麦族多物种进行扩增,表明pSaUBC815561为黑麦属特有。进而利用一套中国春-Imperial黑麦二体附加系及小麦-黑麦异源材料进行扩增,结果显示,pSaUBC815561分布在黑麦整套染色体上,并且所有后代材料都能扩增出pSaUBC815561,表明pSaUBC815561可作为特异性标记用来检测小麦背景中的黑麦染色质。
- 曾雪杨足君李光蓉雷孟平刘成贾举庆任正隆
- 关键词：ISSR分子标记特异PCR
- 用电喷雾质谱和特异PCR初步鉴定粳稻GluB蛋白突变体
- 2008年
- 用十二烷基硫酸钠.聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)方法对采集于中国、日本、印尼、老挝的42份特异粳稻资源进行了分析。结果显示,在编号为 B104的粳稻中有谷蛋白亚家族 GluB 基因沉默现象。将对照材料 B90的对应蛋白进行回收染色、原位酶解,然后利用电喷雾-四极杆飞行时间质谱(ESI-Q-TOF-MS)技术进行鉴定分析。用 MASCOT 数据库进行比对的结果显示,该蛋白的推测分子量为54kD,被包括 GluB2、GluB4、GluB7等基因在内的 GluB 亚家族基因编码。为了深入探讨 GluB 蛋白的突变机制,设计了2对特异引物,以 B90为对照,用基因组 PCR 方法来钓取并鉴定其中的 GluB4和 GluB7基因。鉴定结果表明 GluB7基因在 DNA 水平上未发生变化,而 GluB4基因发生了点突变,导致一个氨基酸的变异。研究证实,电喷雾电离质谱(ESI-MS)可以用来辅助解析植物蛋白质的复合体。
- 刘成蔡光泽杨足君刘新宇周建平雷孟平李霜蓉任正隆
- 关键词：粳稻谷蛋白突变体点突变质谱分析特异PCR
- 两个黑麦特异序列的分离、定位与应用
- 小麦近缘种属中含有丰富的抗病基因,人们通过常规远缘杂交和染色体工程的方法,诱导外源基因渗入小麦遗传背景中,创制了小麦外源染色体的附加、代换和易位系材料,并在生产上得
- 贾举庆李光蓉刘成周建平杨足君
- 文献传递
- 用SON-PCR快速获得长鞭红景天CHS基因全长及其序列分析被引量：4
- 2008年
- 采用单侧寡聚核苷酸嵌套PCR(SON-PCR)方法,从长鞭红景天中扩增得到查尔酮合成酶基因(chalcone synthase,CHS),命名为Rhchs,其序列全长为2 443 bp,包括682 bp的启动子区、957 bp的开放阅读框和3′UTR区。预测序列编码381个氨基酸,其氨基酸组成与其他已知的高等植物的查尔酮合成酶具有很高的同源性,与葡萄、山茶花、杜鹃和牵牛的同源性分别为87%、87%、86%和85%。且大部分氨基酸序列保守。序列分析表明,在启动子区域也找到了TATA-box、W-box、G-box like等顺式作用元件。
- 肖燕杨足君李光蓉任正隆
- 关键词：长鞭红景天
- 小麦抗条锈基因Yr17的新SCAR标记的建立与应用被引量：13
- 2010年
- 为深入了解四川小麦新品种(系)中抗条锈病基因的组成,并为开展分子标记辅助育种提供依据,以小麦抗条锈病基因Yr17的近等基因系以及抗条锈病品系L15与感条锈病材料SY95-71的杂交F2代群体为材料,采用集群分离分析法(BSA)结合SSR分子标记进行分析,发现1条由引物Xgwm415扩增的与抗条锈基因Yr17连锁的特异带。对该特异带克隆测序发现,该序列长390 bp,与栽培大麦中的一个序列表达标签(EST)有90%的相似性,与水稻基因组中的一个"核苷酸结合位点(NBS)-富亮氨酸重复(LRR)"型抗病基因的编码区有70%的相似性。根据该序列设计特异引物,建立SCAR标记,命名为SC-372。利用SC-372对54个四川省近年育成的小麦品种(系)进行检测,发现在15个抗病品种(系)中能特异扩增。进一步利用SC-372及前人报道的Yr17连锁标记VENTRUP/LN2对Yr17近等基因系及偏凸山羊草进行扩增比较发现,本实验建立的SCAR标记对小麦背景中的Yr17基因有更好的检测效率。因此可将SC-372用于分子标记聚合小麦抗条锈病基因的育种实践中。
- 贾举庆雷孟平刘成李光蓉杨足君
- 关键词：小麦抗条锈基因SCAR标记
- 小麦族中含St染色体组物种的特异分子标记的建立被引量：13
- 2007年
- 以拟鹅观草(Pseudoroegneria spicata)、偏凸山羊草(Aegilops ventricosa)、二倍体簇毛麦(Dasypyrum villosum)、荆州黑麦(Secale cereale cv.Jingzhou rye)、普通小麦中国春(Chinese Spring)等15个物种为材料,用200条10碱基随机引物进行RAPD分析,筛选到拟鹅观草基因组中1个542 bp的特异DNA片段(GenBank登录号为DQ992032),命名为OPH11542。根据OPH11542设计特异引物,对小麦族物种进行PCR扩增,发现拟鹅观草可以扩增出OPH11542以及分子量分别为742 bp(GenBank登录号为DQ992033,记为OPH11742)和743 bp(GenBank登录号为EF014218,记为OPH11743)的DNA片段,而其他材料均未扩增出这3个片段。经序列比对结合多个软件的分析结果认为该3个片段为同一类新重复序列。利用特异引物对15份含St染色体的物种进行扩增,发现含StY染色体组的物种均能扩增出OPH11742或OPH11743,而含StH染色体组的物种均能扩增出OPH11542。这表明St染色体组在与其它染色体组组合形成多倍体的过程中往往会出现不同程度的重组或修饰。OPH11542、OPH11742和OPH11743可以作为检测St染色体的分子标记。
- 刘成杨足君刘畅李光蓉任正隆
- 关键词：分子标记特异PCR小麦族
- 黑麦染色体组中一个新重复序列的发现、定位与应用被引量：6
- 2007年
- 【目的】寻找黑麦基因组中新的重复序列作为特异PCR标记。【方法】以普通小麦中国春、川农18、育成品系R111、绵阳11为对照,以荆州黑麦、秦岭黑麦、非洲黑麦、森林黑麦为材料,用RAPD法筛选到黑麦基因组中的一个高拷贝DNA片段OPD15940,将OPD15940输入到NCBI的BLAST框中进行比对。根据OPD15940设计特异PCR引物D15F和D15R,利用这对引物对小麦族物种进行扩增,验证OPD15940的特异性。进而利用原位杂交技术定位pScD15940在染色体上的位置。【结果】序列比对后发现OPD15940与重复序列Sukkula中近60个53bp的小片段有较高的同源性,但又不同于Sukkula,是一类新的重复序列。通过特异PCR确定仅含黑麦染色质的物种能扩增出OPD15940,因而OPD15940为黑麦所特有。原位杂交结果显示除端部区域外,pScD15940弥散状分布在黑麦整套染色体上。【结论】OPD15940可以作为分子标记检测导入到小麦背景中的黑麦染色体。
- 刘成杨足君冯娟迟世华周建平任正隆
- 关键词：黑麦原位杂交特异PCR
- 应用MSAP分析节节麦同源四倍体化过程中发生的表观遗传变异
- 多倍体化是高等植物的主要进化模式,植物染色体组的多倍体化过程可以诱发基因组产生广泛的遗传和表观遗传变异,其中包括基因组 DNA 序列的改变和基因组 DNA 甲基化程度及修饰模式的变异。本研究以中国河南节节麦(Aegilo...
- 曾子贤张勇胡利君任正隆杨足君
- 关键词：节节麦同源四倍体表观遗传MSAP
- 文献传递
