国家自然科学基金(31160134)
- 作品数:7 被引量:11H指数:2
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- 大赖草ISSR-PCR反应体系的优化及引物筛选被引量:2
- 2016年
- 本试验的目的在于建立大赖草最佳的ISSR-PCR反应体系。以大赖草基因组DNA为模板,利用单因子实验相结合正交试验设计的方法,对PCR体系的各因素(d NTPs,DNA及引物等)进行优化试验,同时筛选出扩增条带清晰、稳定性好的ISSR引物并确定其退火温度。试验表明,经优化后的PCR体系:在25μL体系中,DNA用量为50 ng、Taq DNA聚合酶用量为1.0 U、引物的浓度为0.4μmol/L、d NTPs的浓度为0.3 mmol/L、和Mg2+的浓度为2.5 mmol/L。体系验证试验表明该体系稳定、可靠,另外筛选出10条较好的引物,可用于后续的大赖草遗传多样性分析及亲缘关系分析、基因定位与克隆、连锁图谱构建等方面的研究,并对其它近缘作物有指导意义。
- 代培红周贵玲苏秀娟李月刘超吾买尔夏提.塔汉
- 关键词:大赖草ISSR-PCR单因子试验正交设计引物筛选
- 不同居群大赖草醇溶蛋白分析
- 2016年
- 【目的】研究新疆大赖草[Leymus racemosus (Lam.) Tzvel]不同居群种子醇溶蛋白,探讨大赖草种质在居群间和居群内的差异及遗传多样性。【方法】采用酸性聚丙烯酰胺凝胶电泳(A-PAGE)技术对采集到的5个居群间及居群内大赖草种子醇溶蛋白进行遗传多样性研究。【结果】5份居群间材料共分离出19条带纹,只有2条是共有带,多态率为8947%。居群内共分离出17条谱带,7条为共同带,多态率为5882%,小于居群间;材料间的Shannon指数范围是0346 7~0400 0,平均值为0372 7。Nei-Li遗传相似系数(GS)的变异范围为1583 7~1738 5,平均值1659 4。相似系数GS值变异范围是0429~0733,平均为0554。进一步聚类分析表明,在GS值为062的水平上供试材料可聚成3个大类,生境相似的居群聚为一类,表现出一定的分布规律。【结论】大赖草种子遗传多样性在居群间差异明显,而居群内不明显。醇溶蛋白凝胶电泳可以作为指纹图谱,用于研究同一物种不同居群间及居群内的差异是可行的。
- 薛晓东代培红吾买尔夏提.塔汉周桂玲
- 关键词:大赖草不同居群醇溶蛋白聚类分析
- 不同居群大赖草的核型研究被引量:1
- 2015年
- 以新疆阿勒泰地区5个居群的大赖草为材料,采用光学显微镜观察了各居群材料的染色体,同时又观察了一个居群内不同个体的染色体,对观测所得数据进行了居群间和居群内的核型分析。结果显示,5个居群的染色体核型相似,核型类型都属于2A型,其中3个居群有随体,核型公式分别为:居群1(P1):2n=4x=28=24m(2SAT)+4sm(2SAT)、居群4(P4):2n=4x=28=20m(2SAT)+8sm及居群5(P5):2n=4x=28=20m+8sm(2SAT),其余2个居群核型公式分别为:居群2(P2):2n=4x=28=26m+2sm和居群3(P3):2n=4x=28=22m+6sm。5个不同居群的差别不仅在随体的有无上,平均臂比、染色体长度比和不对称系数指标上也存在差异。居群内核型公式为:2n=4x=28=22m+6sm,其中中部着丝粒染色体11对,近中部着丝粒染色体3对,无随体,核型类型均为2A型。结果表明,新疆阿勒泰地区不同居群大赖草在核型上发生了一定的变化,而居群内核型差异较小。
- 薛晓东吾买尔夏提.塔汉代培红周桂玲
- 关键词:大赖草不同居群染色体核型
- 大赖草种群遗传多样性的AFLP分析被引量:2
- 2017年
- 采用荧光AFLP标记对大赖草(Leymus racemosus(Lam.)Tzvel)的6个天然种群进行了遗传多样性和遗传结构进行分析,6对选择性扩增引物共扩增出1269条清晰的条带,其中多态性位点1203个(PPL=80.61%)。在物种水平上,Nei’s遗传多样性指数H=0.188,Shannon多态性信息指数I=0.313;在种群水平上,H=0.177;I=0.288。遗传分化系数Fst为0.1009,表明有10.09%的遗传变异存在于种群之间,基因流Nm为4.4554>1,说明种群间基因交流可以阻止由于遗传漂变导致的遗传分化,遗传分化呈现均质化的趋势。PCo A聚类结果表明,大赖草种群间的遗传距离与地理距离有一定的相关性,但未达到显著水平。该研究结果显示,遗传多样性水平不仅与物种本身特性和研究方法有关,濒危植物并不一定表现为遗传变异水平的降低而濒危,还与人类活动与气候环境密切相关。
- 蔡小霞吾买尔夏提.塔汉代培红加尔肯.切木森
- 关键词:大赖草
- 沙生植物-大赖草克隆多样性被引量:1
- 2017年
- 为了解大赖草在沙漠中种群结构维持稳定的机制,以便更有效地保护和利用其野生植物资源,本试验利用ISSR标记技术对两个典型生境(沙地及沙丘)的大赖草种群的克隆多样性及克隆结构进行了初步研究。NTSYS分析表明:(1)两个种群(共170个样本)均为多克隆种群,共包含98个基因型,且均为局限基因型,群体间的克隆分化较大;(2)大赖草的克隆多样性较高,Simpson指数(D)平均为0.882,基因型比率(PD)平均为0.562,其中克隆多样性表现为HBX>HBN,大赖草能够以根状茎进行克隆繁殖,而保持较高的克隆多样性,这主要与该物种兼性克隆繁殖及多克隆起源有关;(3)两个居群的克隆结构也有明显差异,HBX种群(生长在沙本文地)的克隆生长空间格局表现为游击型,而HBN种群(生长在沙丘)的克隆结构则表现为密集型,这可能是由于大赖草适应异质性生境;(4)进一步对影响大赖草克隆多样性的因素进行了分析,并提出了保护策略。
- 蔡小霞吾买尔夏提.塔汉代培红
- 关键词:沙生植物大赖草ISSR-PCR克隆结构克隆多样性
- 新疆阿勒泰地区5个大赖草种群的表型多样性分析被引量:3
- 2016年
- 为了解大赖草种群﹝Leymus racemosus ( Lam.) Tzvel.﹞的表型变异规律及多样性特征,对分布于新疆阿勒泰地区的5个大赖草种群(分别位于阿勒泰市、福海县、布尔津县和哈巴河县)的16个表型性状进行了测定;在此基础上,对各表型性状进行了Shannon-Weaver指数( H')分析和主成分分析。结果表明:各种群间的16个表型性状均存在较大差异,其中分布于哈巴河县的2个种群各表型性状的平均值均较高。种群内各表型性状的变异系数为5.97%-40.05%,差异较大;其中,穗下第一节间长度的变异系数在各种群内均较大(17.16%-40.05%);总体上看,种群内与营养生长有关的性状(如穗下第一节间长度、剑叶长度和宽度等)变异较大,而与繁殖有关的性状变异较小。在种群间,穗下第一节间长度、剑叶长度和宽度的变异系数均较大,分别为31.85%、26.87%和27.85%;而小穗和外颖长度以及穗节数的变异系数均较小,分别为15.21%、16.53%和16.91%。5个种群间16个表型性状的H'值均有较大差异,并且,种群内各表型性状的H'平均值(1.660)明显高于种群间(0.239)。主成分分析结果显示:前5个主成分的累计贡献率为80.210%,其中,第1主成分中与营养器官相关的性状(如株高、穗下第一节间长度、剑叶长度和宽度、茎节数)载荷较大,第2至第4主成分中与繁殖器官相关的性状(如穗长度和宽度、外颖和内颖长度、小穗长度和宽度以及外稃长度)载荷较大,表明这12个性状为大赖草种群表型性状变异的主要因子。研究结果显示:大赖草种群间的表型多样性低于种群内,且营养器官的表型变异是导致大赖草种群表型多样性的主要因子。
- 薛晓东吾买尔夏提.塔汉代培红周桂玲
- 关键词:表型性状主成分分析
- 大赖草基因组DNA提取方法比较分析被引量:3
- 2015年
- 为了研究不同提取方法对大赖草[Leymus racemosus(Lam.)Tzvel]基因组DNA提取质量的影响,以大赖草的嫩叶为材料,采用CTAB法、CTAB改良法、SDS法、SDS-CTAB法4种提取方法提取大赖草叶片基因组DNA,对提取的基因组DNA进行琼脂糖凝胶电泳及紫外分光光度计法检测,获得最佳大赖草DNA提取方法 ,并利用ISSR标记验证其质量。结果表明,改良的CTAB法提取的大赖草基因组DNA纯度较高、完整性较好,ISSR扩增条带清晰,多态性高。最终确定CTAB改良法为最佳提取方法,完全适合于进一步的分子生物学研究。
- 寇小霞代培红罗淑萍李玮璐吾买夏提.塔汗曲云壮
- 关键词:CTABSDS法