国家自然科学基金(30370499) 作品数:16 被引量:28 H指数:3 相关作者: 彭国光 万金城 孙太欣 江思德 徐芙蓉 更多>> 相关机构: 重庆医科大学附属第一医院 重庆医科大学 北京电力医院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
帕金森病患者脑脊液差异蛋白组学研究 被引量:5 2008年 目的:通过比较帕金森病(Parkinson’s disease,PD)与头痛(正常对照组)患者脑脊液蛋白质谱,筛选和鉴定与帕金森病密切相关的疾病特异性蛋白(Disease-specific proteins,DSPs),探寻帕金森病诊断的生物标志物。方法:以固相pH梯度等电聚焦(IPG-IEF)为第一向,垂直平板十二烷基磺酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)为第二向进行脑脊液蛋白质分离;图像分析软件PDQUEST8.0分析电泳图谱寻找有意义的差异蛋白点;运用MALDI-TOF-MS质谱鉴定,分析其意义。结果:通过比较帕金森病与头痛(正常对照组)患者脑脊液蛋白质谱发现3个有意义的差异蛋白质点:蛋白(质)酪氨酸磷酸酶(Protein-tyrosine phosphatase1B,PTP-1B),载脂蛋白E(Apolipoprotein E),泛素连接酶E3(E3 ubiquitin-protein ligase)。结论:帕金森病患者与头痛(正常对照组)患者脑脊液蛋白表达存在差异,这些差异蛋白有可能是帕金森病的DSPs,并有可能成为PD诊断的分子标志物。 徐芙蓉 江思德 彭国光关键词:帕金森病 脑脊液 蛋白质组学 生物标志物 帕金森病患者脑脊液蛋白质的双向凝胶电泳图谱初步分析 被引量:5 2006年 目的用双向凝胶电泳(2D-PAGE)技术分析帕金森病患者脑脊液中蛋白质的变化。方法用丙酮沉淀法提取脑脊液中的蛋白质,以固相pH梯度等电聚焦(IPG-IEF)为第一向,十二烷基磺酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)为第二向进行2D-PAGE,蛋白点经银染后用图像分析软件对图谱进行分析。结果比较帕金森病组和对照组的2D-PAGE图谱显示:9个蛋白点在帕金森病患者脑脊液中含量减少,8个蛋白点消失,另有8个蛋白点含量上调,初步推测其中部分蛋白点可能为血浆铜蓝蛋白及其前体,结合珠蛋白β链,以及载脂蛋白J片断和前体。结论2D-PAGE技术可用于脑脊液蛋白质分离,反映蛋白质表达的差异。帕金森病患者脑脊液蛋白质与对照相比有显著差异. 张玉平 彭国光关键词:帕金森病 双向凝胶电泳 脑脊液 表面增强激光解离和激光离子化蛋白芯片技术与二维凝胶电泳质谱技术的比较 被引量:2 2005年 孙太欣 彭国光关键词:二维凝胶电泳 蛋白芯片技术 质谱技术 生命科学研究 疾病发展过程 病理条件 双向凝胶电泳脑脊液蛋白质提取方法的比较 被引量:8 2007年 目的对3种常用的双向凝胶电泳脑脊液蛋白质提取方法进行比较,优选脑脊液蛋白质提取方法。方法收集新诊断尚未经药物治疗的16例帕金森病患者和7例头痛患者的脑脊液,分别以3种不同的方法提取脑脊液中的蛋白质。①透析法:用PluseOne微透析试剂盒处理脑脊液样品。②丙酮沉淀法:以冷丙酮溶液处理脑脊液样品,丙酮的终浓度为80%。③三氯醋酸(TCA)/丙酮沉淀法:以4倍体积的10%TCA/丙酮溶液处理脑脊液样品,TCA的终浓度为8%,丙酮的终浓度为80%。取沉淀物进行双向凝胶电泳,用银染法对电泳后的凝胶进行染色,比较经3种不同方法提取的脑脊液蛋白质的双向凝胶电泳图谱。结果经透析法处理样品的电泳图谱显示的蛋白点较清晰、较圆,条纹较少,但所见几乎都是高丰度蛋白,低丰度蛋白很难显现;经丙酮沉淀法处理样品的电泳图谱显示横竖条纹均较多,大部分蛋白堆积在凝胶的上部,下面的点也显示不清晰,蛋白点出现横向漂移;经TCA/丙酮沉淀法处理样品的电泳图谱显示横条纹相对较少,低丰度蛋白能较清晰显现,样品中所含高丰度蛋白明显少于以上两种方法处理的样品。结论以TCA/丙酮沉淀法提取蛋白质进行双向凝胶电泳时聚焦效果较好,而且同时去除了大部分白蛋白,使低丰度蛋白能很好地显现出来,优于丙酮沉淀法和透析法。 孙太欣 彭国光关键词:脑脊髓液 蛋白质组学 GLP-1蛋白可能是帕金森病诊治密切相关的靶点 被引量:1 2014年 目的应用不同剂量的左旋多巴腹腔注射治疗帕金森病(Pakinson's disease,PD)小鼠模型,在对其模型大脑纹状体蛋白质组学进行研究,从蛋白质水平上揭示PD的本质,有助于全面探讨其病理机制,发现药物治疗靶点。方法构建鱼藤酮诱导的慢性PD小鼠模型,行为学及免疫组化证明模型成功,同时应用不同剂量左旋多巴腹腔内注射,提取小鼠脑纹状体蛋白质,双向电泳技术分离蛋白,用质谱进行分析,统计学分析。结果 GLP-1蛋白(胰高血糖素样肽-1)在鱼藤酮PD模型中表达明显下调(P<0.05),经左旋多巴治疗症状好转,GLP-1蛋白在PD小鼠纹状体中蛋白表达左旋多巴治疗剂量上调(P<0.05),中毒剂量仍然下调(P<0.05),GLP-1对神经元细胞的保护作用。结论本研究新鉴定出一个蛋白:GLP-1蛋白为目前神经退行性疾病的研究热点,GLP-1蛋白对神经元细胞有保护作用,与帕金森病诊治密切相关。 龙汉春 龙汉春 徐珊 万金城 彭国光关键词:胰高血糖素样肽-1 帕金森病 蛋白质组学 线粒体相关疾病蛋白质组学研究进展 被引量:1 2007年 作为后基因时代的一门新学科,蛋白质组学研究技术为线粒体蛋白质组的研究提供了有力的支持,使得从整体上研究线粒体蛋白质组在生理、病理过程中的变化成为可能本文回顾了近年来国外学者应用蛋白质组学研究方法揭示相关疾病线粒体蛋白质存在相应的变化,以及通过对线粒体蛋白质组的研究去发现线粒体蛋白质在疾病发生发展中的作用,从而为寻找与疾病密切相关的疾病特异性蛋白提供线索. 涂文斌 彭彦 彭国光关键词:线粒体 疾病 蛋白质组学 帕金森病脑脊液蛋白质组学研究 2008年 目的寻找头痛和帕金森病(PD)患者用药前、后脑脊液差异蛋白质点,确定PD疾病特异性蛋白(DSPs)和药物治疗对蛋白质表达谱的影响。方法收集2004-2006年重庆医科大学附属第一医院神经内科收治的24例PD患者及12例对照组头痛患者脑脊液。用双向凝胶电泳(2D-PAGE)分离蛋白质,银染染色,分析图像寻找有意义的差异蛋白点;进行质谱(MS)鉴定。结果脑脊液蛋白质点主要集中在pH4~7,头痛组与帕金森用药前后脑脊液电泳图谱蛋白质点分布基本一致,符合临床脑脊液生化常规检查,甲状腺激素结合蛋白、载脂蛋白E在PD患者用药前后相对于对照组都消失,血清转铁蛋白在PD患者用药前后相对于对照组都明显上调。结论用药前后PD患者脑脊液蛋白质点与头痛组脑脊液蛋白质点存在差异,药物治疗对PD患者脑脊液蛋白质表达谱影响不明显。 江思德 彭国光 张玉平 徐芙蓉 王加才 王少君 黄德胜关键词:帕金森病 脑脊液 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 双向凝胶电泳 帕金森病患者脑脊液蛋白质组学分析 被引量:2 2010年 帕金森病(Parkinson′s disease,PD)是一种中枢神经系统慢性进展性疾病.本研究采用双向凝胶电泳(two-dimensional gel electrophoresis,2-DE)分离脑脊液(cerebrospinal fluid,CSF)蛋白,获得2-DE图谱,通过ImageMaster 2D Elite软件分析寻找两组的差异蛋白点.结果显示,PD患者CSF中有4个蛋白点丰度下降,22个蛋白点丰度上升.还利用电喷雾质谱(electrospray ionization-tandem mass spectrometric,ESI-MS)对差异蛋白点进行鉴定,发现丰度上升的蛋白点有电压依赖性钙通道α2/δ1亚基,结合珠蛋白,β2-微球蛋白和阿朴脂蛋白A-IV前体,丰度下降的蛋白点为转铁蛋白和转甲状腺蛋白.研究发现,PD患者与对照组CSF蛋白质表达有明显差异,对差异蛋白进行质谱鉴定并了解它们的功能,为以后进一步研究他们在PD发病机制和病程进展中的作用奠定基础. 孙太欣 彭国光 薛鹏 杨福全关键词:帕金森病 脑脊液 蛋白质组学 双向凝胶电泳 质谱 鱼藤酮和MPTP慢性帕金森病小鼠黑质共同差异蛋白研究 被引量:2 2011年 目的通过比较鱼藤酮和1-甲基-4-苯基-1,2,3,6-四氢吡啶(1-methyl-4-phenyl-1,2,3,6-tetrahydropyridine,MPTP)两种慢性帕金森病(Parkinson’s disease,PD)模型小鼠与对照组小鼠黑质蛋白表达谱,找出两种PD模型小鼠共同的差异蛋白,探索筛选出PD的疾病特异性蛋白。方法构建鱼藤酮和MPTP慢性PD小鼠模型组以及其各自的对照组1和对照组2,并进行行为学评价以及黑质酪氨酸羟化酶(tyrosine hydroxylase,TH)免疫组化。分别挖取黑质,提取总蛋白,进行双向凝胶电泳。运用PDQuest 8.0图像分析软件对鱼藤酮组与对照组1、MPTP与对照组2的电泳图谱分别进行分析,找出各自的差异表达蛋白。差异蛋白酶切后,MALDI-TOF-MS进行质谱鉴定。最后将所得到的肽质量指纹图(PMF)进行数据库搜索以及生物信息学分析。结果鱼藤酮组与对照组1、MPTP组与对照组2小鼠间行为学差异具有统计学意义(P<0.05),且黑质TH阳性细胞计数差异也具有统计学意义(P<0.05)。鱼藤酮组与对照组1比较发现有22个差异蛋白,MPTP组与对照组2比较发现有28个差异蛋白,其中有7个为共同的差异蛋白。我们成功鉴定其中3个共同的差异蛋白:PPP2R1A、吡哆醛激酶、peroxiredoxin-2。结论鉴定出3个在PD蛋白质组学中少见报道的蛋白。这些蛋白水平的上调或下调可能与PD的发病密切相关,可作为PD的疾病特异性蛋白。 周长青 杨旭 杨云鹏 万金城 赵臣勇 彭国光关键词:蛋白质组学 小鼠黑质双向凝胶电泳技术的优化 被引量:3 2010年 为了优化小鼠黑质双向凝胶电泳(2-DE)技术,比较了不同样品预处理方法、不同胶条和不同上样量对凝胶电泳结果的影响。研究发现,两种样品预处理方法均可顺利升至最高等电聚焦(IEF)电压(10000V)。与Clean-upkit法相比,TAC/丙酮沉淀法预处理后蛋白得率较低,同时丢失了样品中的部分中、小分子蛋白质。pH3-10L胶条中蛋白点主要分布在中间区域;pH3-10NL胶条对中间区域的蛋白点的分离有所改善;pH4-7胶条中蛋白点分布均匀,横条纹较少。80μg上样量的图谱背景干净,但点数最少(411);180μg上样量的图谱蛋白点较多(883),且圆润、清晰,背景干净,分辨率高;300μg上样量的图谱蛋白点虽然最多(904),但背景较深,部分蛋白点融合,横条纹也较多。研究表明,对于小鼠黑质蛋白质,使用Clean-upkit法对样品进行预处理,选取pH4-7的胶条,采用180μg的上样量能获得背景干净、分辨率高的双向电泳图谱,为帕金森病的生物标志物和药物靶点的研究打下了基础。 周长青 龙汉春 陈莹 万金城 马英 彭国光关键词:黑质 双向电泳 蛋白质组学