黑龙江省自然科学基金(2004C0314)
- 作品数：4 被引量：26H指数：2
- 相关作者：徐德昌代翠红程大友卢曦元纪巍更多>>
- 相关机构：哈尔滨工业大学东北农业大学更多>>
- 发文基金：国家科技部科研院所技术开发研究专项黑龙江省科技攻关计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- miRNAs芯片数据的聚类分析与羽扇豆醇抗癌途径预测
- 2011年
- 羽扇豆醇是一种植物天然提取物,具有高效低毒的抗癌活性,对于药物开发领域有很高价值。目前对其抗癌机制还不是十分明确。使用TaqMan MicroRNA Assay芯片技术,从羽扇豆醇处理的hela细胞中miRNA的差异表达入手,探索扇豆醇抗癌分子途径。运用聚类分析等统计学方法和targetscan,RNAfold等序列分析工具进行信号组分的预测筛选,再结合对NC-BI,Gene Ontology等大型生物信息数据库的检索,最终在生物信息学层面上,分析得到hela细胞中羽扇豆醇抗癌的分子调控途径,即以受体酪氨酸激酶ERBB4介导的,hsa-miR-23b,hsa-miR-200b等几种miRNA参与的分子通路。
- 刘大川代翠红徐德昌
- 关键词：羽扇豆醇MIRNAERBB4生物芯片
- 环二肽生物活性的研究进展被引量：21
- 2011年
- 随着越来越多的天然产物环二肽被发现,人们对其各种生物活性的研究也随之增多。本文综述了近20年来,在环二肽及其类似物生物活性方面的研究进展,其中主要包括:胞间信息传递、抑制毒素、促癌细胞凋亡和镇痛作用等。
- 卢曦元徐德昌
- 关键词：毒素
- 基于同源搜索的甜菜miRNAs计算识别被引量：1
- 2008年
- microRNAs(miRNAs)是一类调控真核基因转录后表达的非编码小分子RNA,在调节生物功能方面起着重要的作用,采用基于同源搜索的计算方法预测未知miRNAs是当前发现和鉴定miRNAs的有效策略之一,甜菜是一种重要的制糖工业原料,其miRNAs的识别尚未见报道,本文根据公共数据库中的甜菜EST和GSS信息,采用Blastn同源搜索技术,预测了甜菜(Beta vul-garis)中的候选miRNAs。通过分析候选miRNAs的序列特征,包括碱基错配、二级结构、(A+U)含量、能量水平等,从中获得了54个miRNAs,其中,3个miRNAs与miRBase中已知的其他物种高度相似的序列,其余可能为新miRNAs。
- 徐德昌李勇程大友代翠红朱延明
- 关键词：MIRNAS生物信息学预测甜菜
- TaqMan探针荧光定量PCR检测甜菜低温胁迫相关miRNAs被引量：4
- 2008年
- 本项研究根据模式植物拟南芥中miR156,157,159,167,319,396在植物中所具有的广泛同源性及其在非生物胁迫环境下可能具有的共同调控机制,采用TaqMan探针实时荧光定量PCR技术检测低温胁迫下甜菜幼苗同源miRNAs的差异表达,以期揭示甜菜响应低温胁迫的可能分子机制。实验表明,甜菜中存在与拟南芥同源的miR156,157,159,167,319,396基因,miR159基因表达稳定,在本实验中用作定量内参,miR156,157,167,396明显下调,而miR319虽然被认为与miR159属于同一家族,但在甜菜幼苗低温胁迫下表现为明显上调,说明miR156,157,167,319,396是甜菜中响应低温信号的调控分子。本研究首次识别甜菜中存在与拟南芥同源的6个miRNAs,为进一步探索甜菜响应低温胁迫的分子机理奠定了技术。
- 徐德昌纪巍程大友代翠红朱延明
