广东省自然科学基金(S2012010010206)
- 作品数：2 被引量：0H指数：0
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- 基于特征融合的选择性剪切外显子预测
- 2014年
- 基因在转录的过程中,mRNA前体常常会经过一个选择性剪切的过程,它包括多种选择性剪切形式。选择性剪切的鉴别在生命科学的研究和医学上都有重要意义。由于选择性剪切的内在限制,同类的预测选择性剪切的模型或者算法只能预测出特殊的选择性剪切事件的类别。本文在研究序列本身特征的基础上,考虑了碱基的保守性,并结合支持向量机建立的预测模型对选择性剪切外显子进行预测。性能测试结果显示,相比同类预测模型该方法在性能方面有了一定提高。
- 袁芳范金坪
- 关键词：支持向量机
- 基于功能相似性预测疾病基因
- 2012年
- 如何从连锁定位区域中的众多基因中有效选取疾病候选基因是疾病诊断治疗和预防的基础。基于基因功能注释信息,设计和实现了一种新的基于基因功能相似性的疾病基因预测工具DGP,分析候选基因和已知疾病基因的GO之间的相似性,对候选疾病基因进行打分排序。从OMIM数据库中提取一个包含1 045个已知疾病基因、涉及305种疾病的数据集来测试DGP的性能,其中56.7%的疾病基因在候选基因中排名前5%,68.5%的疾病基因位于前10%,结果显示DGP具有很高的准确率,能够从某个染色体区间中有效地识别出疾病基因。
- 袁芳李靖
- 关键词：候选基因基因本体
