公益性行业科研专项(201303037-5)
- 作品数:16 被引量:41H指数:4
- 相关作者:孟庆玲乔军陈创夫王国超才学鹏更多>>
- 相关机构:石河子大学中国农业科学院兰州兽医研究所更多>>
- 发文基金:公益性行业科研专项国际科技合作与交流专项项目兵团博士基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 牛乳头瘤病毒基因2型流行株全基因组的克隆及序列分析被引量:8
- 2013年
- 为了解牛乳头瘤病毒(Bovine Papillomavirus,BPV)新疆流行株基因型及其基因组遗传变异情况,用乳头瘤病毒L1基因简并引物FAP59/FAP64对新疆沙湾县奶牛皮肤肿瘤组织样品进行PCR扩增,测序后确定,BPV基因型;设计6对BPV基因型特异性引物,经扩增、测序、拼接后获得BPV流行株全长基因组序列。L1基因序列分析表明,BPV2-SW01流行株为BPV-2基因型;该毒株基因组全长7 944bp,包括E6、E7、E1、E8、E2、E4、E3、E5、L2和L1 10个开放阅读框(ORF)。遗传进化树分析显示,BPV2-SW01归于Delta乳头瘤病毒属,与BPV-1和BPV-13进化关系最近。
- 贺志昊孟庆玲乔军刘昱成杨海波王国超才学鹏陈创夫
- 关键词:全基因组序列遗传进化分析
- 少孢节丛孢菌丝氨酸蛋白酶家族基因的克隆及生物信息学分析被引量:1
- 2015年
- 本研究在国内首次对少孢节丛孢菌新疆分离株(XJ-A1)丝氨酸蛋白酶家族相关基因P12、P186和P233进行了扩增、克隆及测序,对其编码蛋白信号肽、疏水性与亲水性、高级结构、功能域进行预测和分析。结果显示:3个不同的丝氨酸蛋白酶均含有信号肽和天冬氨酸(D)、组氨酸(H)和丝氨酸(S)3个活性位点,表明它们均属于胞外分泌性Subtilase家族;同时,都含有2个潜在的N末端糖基化位点及2个与底物结合的S1区。系统发生分析发现,P12、P186和P233与其他不同地域、不同种属的丝氨酸蛋白酶基因亲缘性较远。本研究为研发预防动物消化道线虫的生物防控奠定了前期基础。
- 赵海龙孟庆玲乔军陈双庆谢堃罗建勋才学鹏
- 关键词:少孢节丛孢菌丝氨酸蛋白酶基因克隆生物信息学
- BVDV-2 E2基因的克隆及其在毕赤酵母中的表达
- 根据GenBank登录的BVDV-2 E2基因序列,设计特异性引物,对BVDV-2新疆SW分离株E2基因进行RT-PCR扩增,克隆入T载体中测序,然后亚克隆入酵母(P.Pastoris)分泌型表达载体pPIC9K中,构建...
- 刘昱成王国超孟庆玲乔军才学鹏贺志昊杨海波陈创夫
- 关键词:BVDVE2基因真核表达
- 文献传递
- 石河子垦区犬瘟热病毒流行株H基因遗传变异分析被引量:1
- 2013年
- 为了解石河子垦区的CDV流行株H基因遗传变异特点,设计2对特异性引物,通过RTPCR方法对29份临床疑似犬瘟热的病料进行检测,对于检测CDV阳性的病料进行流行株H基因克隆、测序和序列分析,结果检测出7份阳性病料。序列分析发现,7个流行株H基因之间的同源率在91.0%~98.9%,与疫苗株(FJ461699.1)的同源率为86.9%~91.7%,存在一定的变异。糖基化位点及抗原表位预测分析发现,与参考株Onderstepoort相比,7个流行株推导的H蛋白糖基化位点、抗原表位均有不同程度的改变。遗传进化分析显示,CDVshzCDVshz6亲缘关系较近,它们与CDVshz7相距较远。研究结果提示,石河子垦区发病犬中存在cDV变异株。
- 王国超赵春光乔军孟庆玲陈双庆陈创夫
- 关键词:石河子垦区犬瘟热病毒H基因
- 捕食线虫性真菌的分离鉴定及氨基酸对其捕食器诱导效应被引量:1
- 2014年
- 为了解新疆阿勒泰地区的捕食线虫性真菌分布情况,采用玉米粉琼脂培养基(CMA)培养分离阿勒泰地区土壤中的捕食线虫性真菌,通过对纯化后菌株的形态学观察和分子生物学分析,鉴定出5株少孢节丛孢属真菌和1株圆锥节丛孢菌。另外用质量浓度分别为0.5,0.05,0.005 g/L的L-苯丙氨酸、L-色氨酸、L-蛋氨酸和L-缬氨酸对已分离的圆锥节丛孢菌AS3株进行捕食器生成的诱导反应,发现各组氨基酸对捕食器的产生均有诱导效应,但质量浓度为0.05 g/L的L-苯丙氨酸诱导产生的捕食器总数最多。为利用捕食线虫性真菌进行生物防控奠定了理论基础。
- 陈双庆孟庆玲乔军赵海龙王俊伟王为升罗建勋才学鹏
- 关键词:捕食线虫性真菌氨基酸
- 羊口疮病毒新疆流行株的分离鉴定及其遗传进化分析被引量:11
- 2015年
- 【目的】研究羊口疮病毒(Orf virus,ORFV)新疆流行株的遗传变异情况。【方法】采集新疆石河子地区疑似感染ORFV的羔羊唇部结痂病料,通过PCR扩增、Vero传代细胞分离培养、电镜观察、动物回归试验等方法,检测、分离和鉴定ORFV毒株,对分离鉴定的3株ORFV毒株保护性抗原基因B2L和F1L及毒力基因VIR、GIF和VEGF分别进行克隆、测序及遗传进化分析。【结果】从病料中分离鉴定出3株ORFV新疆流行株(ORFV-SHZ1、ORFV-SHZ2和ORFV-SHZ3)。分析结果显示,ORFV分离株保护性抗原基因B2L、F1L相对保守,B2L和F1L基因编码氨基酸序列与其他参考株的同源性分别为88.6%~97.9%和86.7%~97.4%;3个毒力基因的变异相对较大,尤其是VEGF基因。VIR、GIF和VEGF基因编码氨基酸序列与其他参考株的同源性分别为91.8%~97.3%,85.2%~97.0%和71.5%~98.5%。基于B2L和VIR基因的遗传进化树分析表明,ORFV-SHZ1和ORFV-SHZ2分离株均与台湾分离株的亲缘关系最近。【结论】试验分离的ORFV新疆流行株可能是由台湾株与其他毒株重组后产生的,且其毒力基因发生了较大的变异。
- 杨海波孟庆玲乔军才学鹏贺志昊刘昱成彭叶龙王国超陈创夫都曼.努尔坎杰
- 关键词:羊口疮病毒遗传进化分析
- 细粒棘球蚴Eg HSP20蛋白基因的分子特征、表达及其反应原性研究
- 2018年
- 【目的】本文构建细粒棘球蚴(Echinococcus granulosus,Eg)HSP20基因的重组表达载体并表达、纯化重组蛋白,研究其反应原性。【方法】根据Gen Bank中Eg HSP20蛋白基因c DNA序列设计特异性引物,以细粒棘球蚴Eg头节总RNA为模板,进行RTPCR扩增,将PCR产物克隆至p MD19-T载体,测序验证后,将Eg HSP20抗原基因亚克隆至表达载体p ET-32a中,再将其转化至大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞内,用IPTG进行诱导表达,并对表达的蛋白进行纯化及反应原性分析。【结果】Eg HSP20 c DNA全长945个核苷酸,编码314个氨基酸。该多肽含有1个N端糖基化位点,1个CAMP磷酸化位点,5个PKC磷酸化位点,10个CKⅡ磷酸化位点;抗原表位区集中在39~53位和120~168位。SDS-PAGE检测显示,重组菌可表达分子量为51 k Da的重组蛋白;Western blot结果显示,表达的重组蛋白Eg HSP20抗原能与Eg阳性血清发生特异性反应。【结论】证实Eg HSP20蛋白具有较强的反应原性,为进一步利用Eg HSP20重组蛋白作为Eg感染诊断中候选标识分子奠定了前期基础。
- 陈英乔军孟庆玲钟文强刘田莉贡莎莎王熙凤黄运福才学鹏
- 关键词:细粒棘球蚴EG反应原性
- BVDV-2 E2基因的原核表达及重组蛋白反应原性的研究被引量:4
- 2013年
- 为了对BVDV进行诊断,根据GenBank登录的BVDV-2E2基因序列,设计特异性引物,对BVDV-2新疆分离株SW E2基因进行扩增,克隆入T载体中测序,然后亚克隆入BL21(DE3)表达载体pET-28a中,构建重组表达载体pET-28a-E2,并转化入大肠埃希氏菌中。用IPTG进行诱导重组菌,SDS-PAGE和Western blot分析表达产物。SDSPAGE分析证实表达的重组融合蛋白相对分子量为32ku;Western blot分析表明该重组蛋白可与BVDV-2多克隆抗体发生特异性血清学反应,证实表达的重组E2蛋白具有良好的反应原性,为BVDV-2诊断试剂研发奠定基础。
- 刘昱成孟庆玲乔军王国超张倩贺志昊杨海波陈创夫
- 关键词:BVDVE2基因原核表达
- 新疆塔城地区绵羊细粒棘球蚴流行株基因分型研究被引量:1
- 2014年
- 为了探明新疆塔城地区绵羊细粒棘球蚴流行株基因型,根据GenBank公布的12S rRNA基因和CO1基因分别设计特异性引物,对58个绵羊细粒棘球蚴包囊进行PCR检测,再通过CO1特异性引物对检测阳性病料进行PCR扩增、测序及基因分型。通过12SrRNA基因检测发现58份样品均为阳性;对所测得的58条CO1基因序列分析,发现新疆塔城地区绵羊细粒棘球蚴流行株基因型均为G1型,且CO1基因序列存在多态性,为塔城地区绵羊细粒棘球蚴病的防控提供了科学依据。
- 宋雪梅程子兵王辉胜刘田莉乔军孟庆玲张金生陈创夫
- 关键词:细粒棘球蚴基因型绵羊
- 奶牛乳头状瘤病理学诊断及病原分子检测研究被引量:5
- 2013年
- 2012年6月新疆沙湾县某奶牛养殖场爆发疑似牛乳头状肿瘤病,为了确诊该病,本研究采取皮肤病变组织进行病理切片检查;设计牛乳头状瘤病毒简并引物BPV P1/BPV P2对皮肤肿瘤组织样品进行PCR扩增,扩增产物克隆至pMD18-T载体中进行测序、序列分析及遗传进化树构建。结果表明:遗传进化树分析显示新疆沙湾县爆发的牛乳头状肿瘤病是由2型牛乳头瘤病毒所引起,与BPV-1、BPV-13进化关系最近。本研究为新疆地区牛乳头状瘤的科学防控提供了理论依据。
- 贺志昊刘贤侠乔军孟庆玲张再超杨海波陈创夫都曼.努尔坎杰
- 关键词:流行株分子分型