国家自然科学基金(31201845)
- 作品数：4 被引量：44H指数：3
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- 利用SCoT分析柳枝稷遗传资源的多样性被引量：11
- 2014年
- 本研究利用SCoT标记对96份柳枝稷种质的亲缘关系和遗传变异进行了研究。筛选出20条引物对96份供试材料进行PCR扩增，共获得445条带，其中多态性条带402条，平均多态性条带比率（PPB）达90．31％，多态性信息含量（PIC）为0．166～0．410，平均值为0．332，标记指数（MI）为10．20。遗传相似系数（GS）为0．498～0．912，平均值为0．688。表明SCoT标记能够揭示柳枝稷种质间的遗传变异。通过UPGMA分析表明，96份种质资源聚为高地型和低地型两大类。经POPGENE1．32软件分析结果显示：96份柳枝稷基因多样性指数（H）为0．285，Shannon指数（I）为0．431，表明供试的种质间遗传多样性丰富，遗传多样性水平高。经AMOVA1．55方差分析揭示：96份柳枝稷生态型内的遗传变异占总变异的72．85％，生态型间遗传变异占总变异的27．15％，结果表明ScoT可用于柳枝稷遗传多样性研究，该研究结果可为柳枝稷种质资源的进一步开发利用提供重要信息。
- 蒋晓梅黄琳凯张新全张瑜聂刚杨盛婷赵欣欣严海东
- 关键词：柳枝稷
- 利用EST-SSR、IT-ISJ分子标记研究四倍体与八倍体柳枝稷的遗传多样性被引量：2
- 2016年
- 柳枝稷是重要的能源植物之一,为研究四倍体Alamo与通过秋水仙素加倍后的八倍体之间的遗传差异,本研究以65份四倍体Alamo与其诱变的八倍体为研究材料,通过EST-SSR与IT-ISJ两种分子标记进行遗传分析。结果表明,EST-SSR引物共扩增出245条带,多态性比率为99.59%,观测等位基因Na为1.9878,有效等位基因Ne为1.1718,基因多样性指数H为0.1308,Shannon信息指数I为0.2388,其中四倍体Alamo的各遗传参数(226条,88.93%,1.8816,1.1823,0.1349,0.2398)多高于八倍体Alamo(217条,92.24%,1.9184,1.1652,0.1228,0.2234)。IT-ISJ引物共扩增出165条条带,多态性比率为96.36%,观测等位基因Na为1.9878,有效等位基因Ne为1.5777,基因多样性指数H为0.3354,Shannon信息指数I为0.4999,四倍体Alamo各项指数(145条,94.55%,1.9333,1.6366,0.3602,0.5280)均高于八倍体Alamo(139条,84.24%,1.7515,1.4377,0.2573,0.3864)。通过UPGMA分析表明,65个柳枝稷材料中四倍体与八倍体没有明显区分开,表明其没有产生明显的遗传分化。通过AMOVA分析表明,EST-SSR和IT-ISJ的遗传变异分别有94.78%和80.76%发生在倍性内,有5.22%和19.24%发生在倍性间,表明柳枝稷倍性间没有明显的差异。
- 钟鸣周思凡张新全黄秀严海东张爱玲罗茜黄琳凯
- 关键词：柳枝稷EST-SSR分子标记
- 柳枝稷种质资源遗传多样性的ISSR分析被引量：4
- 2013年
- 应用ISSR标记对138份柳枝稷种质的遗传多样性和遗传结构进行研究,为资源保护利用提供理论依据和技术支持。研究结果显示,1)从100个ISSR引物中筛选出16个条带清楚且稳定的引物,共扩增出220条谱带,其中,多态性谱带196条,多态性比率(PPB)为89.09%,平均每个引物扩增条带数为13.75条。2)POPGENE 1.32软件分析结果显示,138份柳枝稷基因多样性指数(H)为0.2498,Shannon指数(I)为0.3880,表明供试的种质间遗传多样性较丰富,遗传多样性水平较高。3)AMOVA 1.55软件方差分析结果显示,43.40%的遗传变异存在于生态型之间,56.60%遗传变异存在于生态型之内,说明遗传结构的变异主要存在于生态型之内。4)NTsys-pc 2.1软件进行UPGMA聚类分析和主成分分析(PCA),供试138份柳枝稷种质间Dice遗传相似系数(GS)值为0.4000～0.8818,平均值0.7237,结果表明,低地型材料聚为一大类,高地型材料聚为一大类。
- 张瑜黄琳凯张新全蒋晓梅杨盛婷聂刚严海东
- 关键词：柳枝稷种质资源ISSR
