福建省自然科学基金(2010J05048)
- 作品数：9 被引量：33H指数：4
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- 2个番木瓜多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因的克隆与分析被引量：1
- 2011年
- 采用RT-PCR扩增获得了2个番木瓜果实多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIP)基因cDNA和DNA全长序列,将其命名为CpPGIP1和CpPGIP2。CpPGIP1基因全长为984 bp,编码325个氨基酸;CpPGIP2基因全长为1 025 bp,编码326个氨基酸。2基因均没有内含子序列,核苷酸序列有66.54%的相似性,氨基酸序列有63.53%的相似性。2基因均含有植物PGIP基因编码蛋白特有的亮氨酸重复保守序列LXXLXXLXXLXLXXNXLXGXIPXX。对PGIP基因在不同成熟度番木瓜果实表达量分析发现,2基因4个时期均有表达,而且基本呈现同一表达趋势,绿色期表达量最高,随着果实成熟表达量逐渐降低。
- 申艳红陈晓静李荣荣卢秉国何玮毅
- 关键词：番木瓜基因克隆
- 番木瓜GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶基因的克隆及分析被引量：3
- 2011年
- 采用cDNA末端快速扩增方法,获得了番木瓜果实GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶(GMP)基因的cDNA全长序列,将其命名为CpGMP,GenBank登录号为FJ489652.然后,根据拼接序列设计开放性阅读框上、下游引物,扩增得到了CpGMP基因的开放性阅读框序列和DNA序列.ORF序列编码361个氨基酸,DNA序列包含4个外显子和3个内含子.序列分析表明,番木瓜GMP与大果黄褥花、桃、番茄、拟南芥、水稻GMP的同源性分别为90.30%、89.47%、88.92%、88.09%、85.87%.半定量RT-PCR分析表明,CpGMP基因随着番木瓜果实的成熟表达量逐渐增加,软化时又逐渐降低.
- 申艳红陈晓静卢秉国何玮毅
- 关键词：番木瓜CDNA末端快速扩增半定量RT-PCR
- 番木瓜诱导型基因CpPGIP2启动子的克隆与分析被引量：1
- 2016年
- 【目的】获得诱导型基因Cp PGIP2启动子,并分析该启动子的功能。【方法】以番木瓜Cp PGIP2基因c DNA序列(HQ660394)搜索番木瓜基因组DNA序列,获得一段约2 000 bp的5’端上游DNA序列(ABIM01005077),参照该序列设计PCR特异引物,以番木瓜叶片DNA为模板克隆该启动子,并进行生物信息学分析。将3个启动子片段替换p CAMBIA1301载体中的Ca MV 35S启动子,构建缺失启动子表达载体,以GUS瞬时表达检测缺失启动子表达活性。【结果】获得了Cp PGIP2起始密码子上游长为1 981 bp的调控序列,经分析该序列含有真菌、脱落酸、赤霉素、光照等多种响应元件,为诱导型启动子。构建了1个启动子全长表达载体和2个5’端缺失启动子表达载体,分别命名为p D0-1981、p D1-1204和p D2-261。启动子在番木瓜果肉中的瞬时表达显示,长度为1 204 bp的启动子表达活性最强。并且,该启动子在根、茎、叶、果肉和愈伤组织中均有不同程度的表达,在近外果皮的果肉处和根部表达最明显。【结论】本研究获得了Cp PGIP2启动子序列,确定了表达活性最强的启动子长度,初步分析了启动子的表达模式和顺式作用元件,为进一步深入研究Cp PGIP2基因功能以及将该启动子应用于植物基因工程育种奠定了基础。
- 申艳红陈晓静戴志林
- 关键词：番木瓜多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白启动子调控元件
- 番木瓜半胱氨酸蛋白酶基因CpCP的分离及表达分析被引量：6
- 2015年
- 采用cDNA-AFLP技术分离了一个与番木瓜果实成熟衰老相关的差异片段,经生物信息学分析证实该片段属于半胱氨酸蛋白酶(Cysteine Protease,CP)基因。将差异片段序列在NCBI中的番木瓜基因组序列中搜索,获得了半胱氨酸蛋白酶基因DNA序列。设计开放型阅读框上、下游引物,以木瓜果肉RNA逆转录的cDNA为模板扩增该基因全长cDNA序列,命名为CpCP(登录号:JN689334)。该基因属于C1肽酶家族中的C1A亚家族,编码471个氨基酸,含有家族特有的催化三联体:Cys166-His302-Asn322。Real-time PCR结果显示CpCP在果实中大量表达,是根、茎、叶、花中表达量的几十倍;CpCP受乙烯处理诱导,受1-MCP处理抑制,表达模式与番木瓜果实成熟衰老进程一致,说明CpCP参与了番木瓜果实成熟衰老进程。
- 申艳红陈晓静蔡雪玲叶一江耿姣姣杨菲颖
- 关键词：番木瓜半胱氨酸蛋白酶基因克隆CDNA-AFLP荧光定量PCR
- 番木瓜酪氨酸氨基转移酶基因CpTAT的分离与分析被引量：1
- 2016年
- 番木瓜酪氨酸氨基转移酶(Tyrosine aminotransferase,TAT)是维生素E合成途径中的一个关键酶。在已有番木瓜果实成熟差异基因片段序列的基础上,采用RACE技术克隆了TAT基因的全长c DNA序列,命名为Cp TAT。该基因全长包含5′非编码区98 bp,3′非编码区232 bp,开放性阅读框1 266 bp,编码421个氨基酸。序列分析表明,该基因为谷草转氨酶超家族成员,催化活性位点为第253位的赖氨酸,编码蛋白与毛果杨、野草莓、桃、拟南芥和水稻的TAT蛋白同源性分别为83.69%、81.09%、80.76%、78.87%、54.67%。荧光定量分析表明,Cp TAT基因在根中的表达量最高,在茎和果实中的表达较低,在叶中的表达量最低。与对照相比,外源乙烯处理能诱导番木瓜果实中Cp TAT基因表达量升高,而1-MCP处理则抑制了该基因表达,在果实衰老期表达量升高,该基因可能在番木瓜果实成熟衰老中起作用。
- 申艳红陈永萍杨菲颖鲁娜
- 关键词：番木瓜基因克隆RACE维生素E
- 番木瓜DNA提取与性别分子鉴定——遗传学综合性实验
- 2013年
- 为了更好培养大学本科学生的实践动手能力、创新设计能力和科学研究能力,设计了"番木瓜DNA提取与性别分子鉴定"的综合性实验。以番木瓜叶片为试材,进行DNA快速提取、PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳,利用SCAR分子标记鉴别番木瓜性别。锻炼了学生的分子遗传学实验操作技能,激发了学生的学习兴趣。
- 申艳红陈晓静
- 关键词：遗传学实验番木瓜DNA提取性别鉴定
- 番木瓜肌动蛋白CpActin基因的克隆及其在果肉中的表达被引量：7
- 2010年
- 以番木瓜果肉为试材,提取总RNA,反转录为双链cDNA。采用cDNA末端快速扩增方法(RACE),获得了番木瓜果肉Actin基因的全长cDNA序列,将其命名为CpActin,Genbank登录号为FJ696416。CpActin全长cDNA为1533bp,含有一个1134bp的开放阅读框,编码377个氨基酸,与毛白杨、葡萄、水稻、拟南芥的Actin同源性分别为98.94%、98.67%、96.29%、94.69%。利用邻接法构建了部分高等植物、哺乳动物和真菌的Actin系统进化树,结果表明番木瓜与葡萄的Actin进化距离最小。采用半定量RT-PCR技术分析CpActin基因在不同成熟度番木瓜果实中的表达情况,发现该基因的表达水平没有明显差异,表明CpActin基因可以作为内参,进行番木瓜其他果实基因差异表达的研究。
- 申艳红陈晓静何玮毅卢秉国
- 关键词：番木瓜肌动蛋白克隆
- 番木瓜胚性愈伤组织的诱导及体胚发生被引量：8
- 2011年
- 以番木瓜的幼胚、下胚轴、叶片和子叶作为外植体,研究不同的激素配比、附加物以及培养方式和条件对胚性愈伤组织和体胚的诱导效果.结果表明,幼胚是胚性愈伤组织和体胚发生的好材料.幼胚最佳诱导培养基为:改良MS+10 mg·L-1 2,4-D+5 mg·L-1 NAA+2 mg·L-1 KT+0.5 mg·L-1 BA;最适合的增殖培养基为:改良MS+10 mg·L-1 2,4-D+2.5mg·L-1 NAA+1 mg·L-1 KT+0.5 mg·L-1 BA;最佳体胚诱导培养基为:改良MS+10 mg·L-1 2,4-D+2 mg·L-1 KT;子叶较难诱导愈伤组织,叶片和下胚轴愈伤组织的诱导率较高,但愈伤组织质量较差,体胚发生率极低.
- 蔡雪玲陈晓静申艳红何玮毅
- 关键词：番木瓜愈伤组织体胚发生幼胚
- 番木瓜果实成熟相关基因的cDNA-AFLP分析及克隆被引量：8
- 2011年
- 为了探讨番木瓜果实成熟机理,利用cDNA-AFLP技术对破色期和半黄期的番木瓜果实进行基因差异表达分析,获得了50个与果实成熟相关的差异基因片段,其中28个与GenBank数据库中的功能基因同源,分别参与了果实成熟过程中基因表达调控,DNA与蛋白质合成及运输,蛋白质降解,能量代谢,营养物质代谢和逆境胁迫反应等过程。在差异片段序列基础上设计特异引物,采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术成功克隆了4条差异基因cDNA全长,分别命名为CpGMP、CpPAA1、CpPOD和CpMYB。半定量RT-PCR分析结果表明,随着果实的成熟衰老,4个基因的表达量相应变化,说明其可能参与果实的成熟过程。
- 申艳红陈晓静卢秉国何玮毅
- 关键词：番木瓜果实CDNA-AFLPRACE
