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北京市人才强教计划项目(PHR201107120)

作品数：11 被引量：81H指数：7
相关作者：张爱兵金倩杨聪慧韩辉林武春生更多>>
相关机构：首都师范大学东北林业大学中国科学院更多>>
发文基金：国家自然科学基金北京市人才强教计划项目北京市自然科学基金更多>>
相关领域：生物学农业科学天文地球更多>>

文献类型

  • 11篇中文期刊文章

领域

  • 10篇生物学
  • 2篇农业科学
  • 1篇天文地球

主题

  • 6篇DNA条形码
  • 5篇系统发育
  • 5篇系统发育树
  • 4篇夜蛾
  • 4篇昆虫
  • 3篇夜蛾科
  • 3篇鳞翅目
  • 3篇COI基因
  • 2篇物种
  • 2篇物种鉴定
  • 2篇鳞翅目昆虫
  • 2篇DNA条形码...
  • 1篇地理种群
  • 1篇东南
  • 1篇东南沿海
  • 1篇多角体
  • 1篇多角体病毒
  • 1篇学科
  • 1篇益鸟
  • 1篇鱼科

机构

  • 11篇首都师范大学
  • 4篇东北林业大学
  • 4篇中国科学院
  • 1篇北京林业大学
  • 1篇华东师范大学
  • 1篇华南师范大学
  • 1篇中国水产科学...

作者

  • 11篇张爱兵
  • 6篇金倩
  • 4篇杨聪慧
  • 4篇韩辉林
  • 4篇武春生
  • 3篇迟美妍
  • 2篇陈付强
  • 2篇杨帆
  • 2篇刘晓枫
  • 2篇李俊
  • 2篇高强
  • 1篇朱朝东
  • 1篇秦洁
  • 1篇雷光春
  • 1篇何利军
  • 1篇石志勇
  • 1篇黄立华

传媒

  • 4篇应用昆虫学报
  • 3篇昆虫学报
  • 1篇古生物学报
  • 1篇生物学通报
  • 1篇生态学杂志
  • 1篇生物安全学报...

年份

  • 1篇2016
  • 3篇2014
  • 3篇2013
  • 4篇2012
共 11 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
中国东南沿海弹涂鱼科常见鱼类的遗传多样性和DNA条形码被引量：15
2012年
为了探究中国东南沿海海岸线经济开发、海水污染等对该区域生物遗传多样性的潜在影响,本文使用COI基因作为DNA条形码,对从中国东南沿海广东汕头、福建东山、福建云霄、福建泉州、福建霞浦、上海崇明6个地点采集的大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)、弹涂鱼(Periophthalmus modestus)和青弹涂鱼(Scartelaos histophorus)进行种间和种内的遗传学分析。遗传多样性分析显示,青弹涂鱼的核苷酸多样性(0.0018)在3个种中最低;青弹涂鱼广东汕头种群的核苷酸多样性(0.0018)比福建云霄种群低;大弹涂鱼的上海崇明种群核苷酸多样性(0.0021)低于其他5个地理种群。物种水平分析表明,3个物种间分化明显,种间与种内遗传距离有明显差异;不同种的单倍型在系统发育树上聚成3个高度支持的独立分支。种群水平分析显示,大弹涂鱼的6个不同地理种群之间有共享单倍型,地理种群间与地理种群内的遗传距离重叠;各地理种群之间的基因流较频繁(Nm>4);青弹涂鱼的分析情况与大弹涂鱼基本一致。大弹涂鱼和青弹涂鱼的单倍型在系统发育树上均呈现多系或并系分布格局,并未按地理位置分成不同的单系群。本研究表明,应及时加强3种鱼类及其野生种群遗传多样性的保护,且COI基因对种一级的识别明确可靠,而在地理种群水平的识别则比较困难,有待进一步深入研究。
杨帆何利军雷光春张爱兵
关键词：COI基因物种鉴定地理种群
高通量转录组测序技术及其在鳞翅目昆虫上的应用被引量：20
2014年
转录组是指组织或者细胞在某一特定状态下转录出来的所有RNA的集合。高通量第2代测序技术使转录组学的研究模式发生了巨大的改变,所衍生出的转录组测序迅速成为研究非模式生物的先进技术。转录组测序能够在整体水平上探究细胞内基因表达的种类和数量,揭示在特定条件下机体生理生化发生过程以及其中的分子机理。本文简要阐述了转录组测序技术的基本概念、技术流程与原理,详细介绍了转录组测序在解决鳞翅目昆虫的分类、毒理、发育、与寄主互作以及非编码RNA调控等问题上做出的贡献,并对该技术现存的困难进行了系统的阐述并对其未来的发展趋势作出了简要的预测与剖析。
杨帆黄立华张爱兵
关键词：转录组转录组测序高通量测序鳞翅目
支持向量机和邻接法在夜蛾科昆虫条码研究中的应用被引量：1
2012年
【背景】鳞翅目夜蛾科昆虫种类繁多,目前已经超过3.5万种,绝大多数是农林生产的主要害虫。由于多数近缘属种形态相似,难以鉴定,给农林害虫的防治工作带了很大的困难。DNA条形码技术是一种快速、准确鉴定物种的方法。支持向量机作为一种新的机器学习方法,自1995年被提出以来已经在数据分类和高维模式识别等领域取得不错的效果。【方法】将北京妙峰山采集的58种夜蛾101个样品的COⅠ序列分成3套数据集,分别通过邻接法和支持向量机对其进行验证。【结果】通过对DNA条形码物种鉴定结果的验证表明,邻接法优于支持向量机。但DNA条形码在鉴定夜蛾科的一些近缘种上,效果不佳,如棉铃虫和烟青虫。【结论与意义】DNA条形码作为一种新兴的物种鉴定方法,在分类学上具有很高的应用价值。通过邻接法和支持向量机的比较,虽然支持向量机的成功率低于邻接法,但是其在DNA条形码中的应用是对数据问询方式的一种探索。
李俊韩辉林高强金倩迟美妍武春生张爱兵
关键词：DNA条形码夜蛾科支持向量机近缘种
分子钟假说的基本原理及在古生物等学科中的应用被引量：3
2016年
研究各个生物类群的起源时间是生物学、古生物学、地质学的重要研究范畴,然而由于化石记录的不完整性,仅仅通过化石无法准确地提供生物各门类的起源时间,更无法真实地反映各门类直接的演化关系,长期以来科学家们都希望能够找到新的突破口。分子钟假说可以在缺乏化石证据的条件下通过分子数据和统计学方法推算各类群间的分歧时间。文中将对分子钟假说的发展历程、基本原理、研究方法及存在的主要问题进行介绍,并就近期利用分子钟的若干研究示例进行分析,以期能对整个分子钟有个更为全面的论述。
刘晓枫张爱兵
以雾灵山夜蛾科为材料评估进化模型对DNA条码分类的影响被引量：2
2012年
为了探究进化模型对DNA条形码分类的影响,本研究以雾灵山夜蛾科44个种的标本为材料,获得COI基因序列。使用邻接法(neighbor-joining)、最大简约法(maximum parsimony)、最大似然法(maximum likelihood)以及贝叶斯法(Bayesian inference)构建系统发育树,并且对邻接法的12种模型、最大似然法的7种模型、贝叶斯法的2种模型进行模型成功率的评估。结果表明,邻接法的12种模型成功率相差不大,较稳定;最大似然法及贝叶斯法的不同模型成功率存在明显差异,不稳定;最大简约法不基于模型,成功率比较稳定。邻接法及最大似然法共有6种相同的模型,这6种模型在不同的方法中成功率存在差异。此外,分子数据中存在单个物种仅有一条序列的情况,显著降低了模型成功率,表明在DNA条形码研究中,每个物种需要有多个样本。
迟美妍韩辉林高强杨聪慧金倩李俊陈付强武春生张爱兵
关键词：夜蛾科COI基因进化模型系统发育树
昆虫DNA条形码分析中的距离方法被引量：8
2013年
本文介绍了DNA条形码分析中常用的距离方法,包括简单的距离方法、基于阈值的距离方法和基于模糊成员关系的距离方法,并且以松毛虫属7个近缘种的COⅠ数据为例,运用基于阈值的距离方法进行演示分析。
金倩张爱兵
关键词：DNA条形码昆虫
昆虫系统发育重建的常用方法及步骤被引量：1
2013年
本文介绍了昆虫系统发育重建研究的步骤,常用方法及相关软件的使用,指出了不同研究方法的优缺点及适用范围,分析了系统发育重建存在的问题,从而为相关研究的开展提供了参考。
秦洁张爱兵
关键词：系统发育树
DNA条形码技术在北京百花山地区夜蛾科物种鉴定中的应用被引量：17
2012年
为了探讨DNA条形码技术在夜蛾物种鉴定中的可行性,本研究利用条形码通用引物扩增了北京百花山地区43种夜蛾75个样本的线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(mitochondrial cytochrome c oxidase subunitI,COI)基因序列,以Kimura双参数模型进行种内种间遗传距离分析、使用邻接法(neighbor-joining,NJ)和最大简约法(maximumparsimony,MP)分别构建系统发育树,并利用分子序列差异阈值对样本进行分子可操作分类单元(molecular defined operational taxonomic units,MOTU)划分。结果表明:所有夜蛾种类通过系统发育树可以成功区分;种内平均遗传距离(0.03%)远远小于种间平均遗传距离(11.29%);采用较为保守的1%的序列差异阈值将75个夜蛾样本分为42个MOTU,正确率为95%,除了MOTU04包含2个物种外,剩余41个MOTU与形态种呈现一一对应的关系。结果显示,基于COI基因的DNA条形码对于本研究中所涉及的夜蛾具有较好的区分,可以作为一种有效的工具在夜蛾科昆虫物种鉴定中进行应用。
杨聪慧韩辉林迟美妍金倩武春生朱朝东张爱兵
关键词：夜蛾分子分类DNA条形码系统发育树
松毛虫的生物防治被引量：10
2014年
松毛虫是我国针叶林危害最为严重的害虫,其周期性的爆发对我国林业造成了巨大的经济损失。近年来在松毛虫防治中多采用化学方法,虽取得了一定成效,但化学防治方法却带来了一系列环境问题。因此,生物防治方法越来越受到重视。在总结了松毛虫习性的基础上,将国内常用的生物防治措施(寄生蜂、白僵菌、苏云金杆菌、质型多角体病毒及利用益鸟)进行了概述。
宋韶彬杨聪慧张爱兵
关键词：松毛虫生物防治赤眼蜂白僵菌质型多角体病毒益鸟
DNA条形码技术在河北保定、廊坊地区鳞翅目昆虫上的应用及小型区域数据库的构建被引量：9
2014年
【目的】为了探究DNA条形码技术和小型区域数据库在蛾类鉴定上的可行性,本研究利用条形码通用引物扩增了采自河北保定、廊坊地区10种夜蛾82个样本的线粒体细胞色素c氧化酶亚基I(Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I,COⅠ)基因序列。【方法】基于进化树、距离、阈值和特征的方法。【结果】虽然整体分类效果较好,但基于进化树、距离、阈值的方法都无法将二点委夜蛾Athetis lepigone进行较好的分类;样本LF110802.008总是被分入标瑙夜蛾Maliattha signifera类群,与形态学分类结果发生分歧。基于特征的方法运用核基因28S进行分析,结果与形态分类一致。同时还探讨了基于特征方法得到的诊断特征数目与样本数量之间的关系,发现两者密切相关;基于特征的方法对小样本量的鉴定也比较有效。本研究建立了小型区域的DNA条形码数据库,使物种识别具有更强的针对性,有利于提高地区性蛾类病虫害防治效果。【结论】在蛾类鉴定中,DNA条形码有很好的分类效果,小型区域数据库很有实际应用价值。
宋韶彬石志勇金倩韩辉林刘晓枫郝梦迪张爱兵
关键词：鳞翅目夜蛾DNA条形码系统发育树
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