国家教育部博士点基金(200805370002)
- 作品数：17 被引量：82H指数：6
- 相关作者：袁哲明谭显胜谭泗桥熊兴耀王志明更多>>
- 相关机构：湖南农业大学湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室湖南人文科技学院更多>>
- 发文基金：国家教育部博士点基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”湖南省自然科学杰出青年基金更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术理学农业科学更多>>
- 运用PDB中的同源信息提高NetTurnP的蛋白质β转角预测精度(英文)被引量：1
- 2012年
- β转角作为一种蛋白质二级结构类型在蛋白质折叠、蛋白质稳定性、分子识别等方面具有重要作用.现有的β转角预测方法,没有将PDB等结构数据库中先前存在的同源序列的结构信息映射到待预测的蛋白质序列上.PDB存储的结构已超过70 000,因此对一条新确定的序列,有较大可能性从PDB中找到其同源序列.本文融合PDB中提取的同源结构信息(对每一待测序列,仅使用先于该序列存储于PDB中的同源信息)与NetTurnP预测,提出了一种新的β转角预测方法BTMapping,在经典的BT426数据集和本文构建的数据集EVA937上,以马修斯相关系数表示的预测精度分别为0.56、0.52,而仅使用NetTurnP的为0.50、0.46,以Qtotal表示的预测精度分别为81.4%、80.4%,而仅使用NetTurnP的为78.2%、77.3%.结果证实同源结构信息结合先进的β转角预测器如NetTurnP有助于改进β转角识别.BTMapping程序及相关数据集可从http://www.bio530.weebly.com获得.
- 钱刚王海燕袁哲明
- 关键词：PDB
- 饲料配方优化设计研究进展被引量：4
- 2014年
- 饲料配方的优化技术是饲料行业生存生产的关键技术之一,同时配方的优劣直接关系产品的市场竞争力,因此,正确合理的配方设计显得尤为重要。本文从配方的实验设计和数学建模出发对饲料优化设计中涉及的具体方法及后续分析方法进行详细综述。
- 田珂曾辉谭泗桥
- 关键词：设计方法
- 基于支持向量回归的非线性变量筛选用于酚类化合物QSAR建模的研究被引量：1
- 2014年
- 首先基于支持向量回归(SVR)依均方根误差最小原则确定最优核函数,再以最优核函数为基础,进行SVR非线性自变量筛选,最后以所选自变量进行建模预测。将该方法应用于酚类化合物的QSAR研究,最优核函数确定为径向基核,最终保留自变量为疏水性参数(lgP)与拓扑指数(Am3)。结果表明:基于SVR进行变量筛选能有效地剔除无关自变量,进一步改进SVR对小样本数据的建模预测能力。该方法在农业环境毒性污染物的QSAR研究领域有较广泛的应用前景。
- 徐镜善王凯袁哲明
- 关键词：支持向量回归定量构效关系酚类化合物
- 基于均匀设计与支持向量回归的棉铃虫幼虫全纯人工饲料配方优化被引量：6
- 2012年
- 昆虫全纯人工饲料配方是精细研究昆虫营养生理的前提。本研究以棉铃虫Helicoverpa armigera幼虫为供试对象,以本研究室前期发展的多因素多水平配方优化实验设计与分析方法UD-SVR为指导,以略加修改的苹浅褐卷蛾Epiphyas postvittana幼虫全纯人工饲料为初始配方,先优化20种天然氨基酸,再优化蔗糖等其他8种非氨基酸营养组分,经4轮97个处理组合,获得一个棉铃虫幼虫全纯人工饲料满意配方,平均蛹重、化蛹率分别由初始配方的0.160g和10.4%高效增至满意配方的0.255g和97.9%。该全纯人工饲料满意配方的获得,不但再次证实了UD-SVR方法的有效性,同时为进一步深入研究棉铃虫营养需求与营养代谢奠定了基础。
- 周世豪李俊姚润贤张星袁哲明
- 关键词：棉铃虫均匀设计支持向量回归
- 基于均匀设计与支持向量回归的发酵配方优化被引量：15
- 2009年
- 结合均匀设计与支持向量回归,提出了一种新的配方优化实验设计与分析方法UD-SVR.将其应用于优化产谷氨酸脱羧酶大肠杆菌诱变株的培养基配方与发酵条件,在考虑9因素时仅通过2轮28个实验,酶活性(吸光度OD630)即由初始的1.528高效提升至2.303,明显优于二次多项式偏最小二乘回归等经验风险最小参比模型.UD-SVR为多因素多水平配方优化实验设计与分析提供了一套预测精度高、指导性强、可解释性好、优化高效的整体解决方案.
- 袁哲明左斌谭泗桥谭显胜熊兴耀
- 关键词：均匀设计支持向量回归
- 混沌时间序列预测模型参数的联合优化被引量：5
- 2011年
- 为了提高混沌时间序列预测模型的预测精度,提出了一种相空间重构和最小二乘支持向量机(LSSVM)参数的联合优化方法.联合优化方法的核心思想是首先采用均匀设计对相空间重构和LSSVM参数进行联合设计,然后采用自调用LSSVM进行参数联合优化,最后利用混沌时间序列对联合优化方法进行验证性测试.实验结果表明,联合优化方法预测精度明显优于其它优化方法,且优化速度更快.
- 向昌盛袁哲明周子英
- 关键词：混沌时间序列相空间重构支持向量机均匀设计
- 改进支持向量机在棉铃虫人工饲料配方优化中的应用
- 发展新的实验设计与分析方法,通过实施尽可能少的实验获得满意配方对动植物营养、发酵工程等复杂多因素多水平寻优问题极为重要.结合均匀设计(Uniform Design,UD)与支持向量回归(Support Vector Re...
- 李俊谭显胜谭泗桥袁哲明熊兴耀
- 关键词：棉铃虫人工饲料均匀设计支持向量回归
- 改进支持向量机在棉铃虫人工饲料配方优化中的应用被引量：11
- 2010年
- 发展新的实验设计与分析方法,通过实施尽可能少的实验而获得满意配方对动植物营养、发酵工程等复杂多因素多水平寻优问题极为重要。本研究结合均匀设计(uniform design,UD)与支持向量回归(support vector regression,SVR),提出了一种新的配方优化实验设计与分析方法UD-SVR,将其应用于棉铃虫Helicoverpa armigera(Hbner)幼虫人工饲料配方优化。结果表明:在考虑6因素时仅通过2轮22个实验,表征配方优劣的指标———平均蛹重即由初始的0.2436g高效提升至0.3044g,明显优于二次多项式偏最小二乘回归等经验风险最小参比模型。UD-SVR预测精度高、指导性强、可解释性好、优化高效,有望在多因素多水平配方优化中得到广泛应用。
- 李俊谭显胜谭泗桥袁哲明熊兴耀
- 关键词：棉铃虫人工饲料均匀设计支持向量回归
- 抗菌肽的研究进展被引量：4
- 2009年
- 抗菌肽是一类抗细菌、真菌、病毒、寄生虫及肿瘤细胞的小分子多肽,是生物抵御自然界中有害微生物侵染的重要因素,且具抗菌谱广、无免疫原性、作用机制独特、耐热性好等特性,有望成为抗生素的替代品。本文着重介绍了抗菌肽的性质、种类、作用机理等方面的研究进展,同时对其应用、目前存在的问题进行了讨论。
- 谭显胜李巍巍王志明袁哲明
- 关键词：抗菌肽
- 支持向量回归的改进及其在QSAR中的应用
- 2009年
- 支持向量回归(SVR)存在诸多缺陷。本文基于均方误差(MSE)最小原则与留一法发展了自动筛选最优核函数与自变量的方法,对SVR进行了改进并构建了SVR的基本应用模型,该模型有效性在定量构效关系(QSAR)研究中得到验证。
- 谭泗桥龙陈锋代志军谭显胜林雪梅
- 关键词：支持向量回归解释性
