国家自然科学基金(31201996)
- 作品数：14 被引量：62H指数：7
- 相关作者：王中铎郭昱嵩廖健刘楚吾张顺更多>>
- 相关机构：广东海洋大学更多>>
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- 相关领域：农业科学生物学环境科学与工程更多>>
- 湖栖鳍虾虎鱼微卫星DNA标记的开发与群体遗传多样性分析被引量：3
- 2020年
- 为研究雷州半岛湖栖鳍虾虎鱼(Gobiopterus lacustris)遗传多样性,对湖栖鳍虾虎鱼雌雄性腺进行转录组测序,采用MISA软件进行微卫星分析,共获得25 452个微卫星标记,其中包含14 708个单碱基重复类型,6 175个2碱基重复类型,3、4、5和6碱基重复类型数目分别为4 223、327、15和4。随机选取50个微卫星位点设计引物,能够扩增出清晰稳定条带的有39对,其中,11个位点表现出不同程度的多态,28个位点呈现单态。利用11个具有多态性的微卫星位点分析湖栖鳍虾虎鱼在廉江市高桥镇红树林保护区、湛江东海岛、雷州市附城镇和雷州市九龙山红树林国家湿地公园4个野生群体中的遗传多样性及遗传结构,11个微卫星位点呈现出不同程度的多态性,等位基因数(Na)2~15,平均等位基因为(6?3.9)个,有效等位基因数(Ne)、平均观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别在1.919~2.485、0.343~0.465和0.381~0.483之间,平均多态信息含量(PIC)为0.348~0.465。Hardy-Weinber平衡分析显示,4个群体的大部分位点未偏离平衡。在每个群体中进行连锁不平衡分析,有18对位点间显著(P <0.05)或者极显著(P <0.01)偏离连锁平衡。遗传分化系数在0.107~0.216之间,表明4个群体的遗传分化达到了中等水平以上。分子方差分析(AMOVA)显示,湖栖鳍虾虎鱼大部分的差异来自于群体内而非群体间。
- 黄承勤黄英毅黄欣王中铎郭昱嵩
- 关键词：地理群体微卫星DNA
- 基于cox1条形码的鱼肚DNA分子鉴定被引量：7
- 2014年
- 为鉴定鱼肚的正品来源,运用一对特异性引物扩增并测定10 个不同价格（700～1 500 元/kg）鱼肚样本的线粒体DNA 细胞色素c 氧化酶Ⅰ（cox1）约660 bp 的序列.通过BLASTN 比对DNA 序列同源度,判定鱼肚所属种类分别为鲈形目石首鱼科（Sciaenidae）、马鲅科（Eleutheronema）、笛鲷科（Lutjanidae）、带鱼科（Trichiuridae）.cox1 条码序列获取便捷,基于此条码序列的物种鉴定技术可用于鱼肚种类鉴别.
- 朱惠敏连一阳王中铎郭昱嵩刘楚吾
- 关键词：鱼肚DNA条形码物种鉴定
- 基于cox1和D-loop区序列雷州半岛红树林海区2种野生弹涂鱼的遗传变异被引量：7
- 2016年
- 设计双层洞穴式弹涂鱼捕捉器,于雷州半岛红树林海区捕获弹涂鱼类野生群体,筛选出弹涂鱼(Periophthalmus modestus)、大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)2个优势种群,并获取其线粒体控制区(D-loop)和cox 1基因部分序列,进行序列变异分析及遗传分析。结果表明,cox 1基因和D-loop区碱基组成A+T含量均大于C+G。cox 1数据揭示,大弹涂鱼变异位点占总长度2.1%,弹涂鱼占2.4%,种内平均遗传距离分别为0.003、0.006,种间遗传距离为0.158,37个个体共定义22个单倍型,单倍型多样性为0.950 45。而D-loop区数据指明,大弹涂鱼变异位点占总长度4.9%,弹涂鱼占7.5%,种内平均遗传距离分别为0.012、0.019,种间距离为0.409,37个个体定义32个单倍型,单倍型多样性水平极高(0.989 49)。中性检验结果显示,2种弹涂鱼进化历程符合中性进化假设,且存在群体扩张的可能。综合cox 1基因和控制区数据显示:弹涂鱼种群遗传多样性高于大弹涂鱼。
- 廖健贺亮张顺沈自慧黄永胜龙水生黄承勤王中铎
- 关键词：红树林弹涂鱼系统进化
- 一种快速鉴定弓背青鳉遗传性别的方法被引量：8
- 2018年
- 【目的】研究快速鉴定弓背青鳉遗传性别的方法。【方法】以中国南海沿岸弓背青鳉群体为对象提取基因组DNA,根据基因组数据设计性别特异引物Ocsex-F/Ocsex-R,通过PCR方法对弓背青鳉遗传性别进行鉴定。【结果】引物Ocsex-F/Ocsex-R在雄性DNA中扩增获得959 bp和656 bp的两个DNA条带,在雌鱼中仅可扩增出959 bp的单一条带,PCR产物经电泳可清晰分辨;对汕头、湛江、钦州、文昌等南海沿岸的地理群体扩增结果一致。【结论】Ocsex-F/Ocsex-R引物可对弓背青鳉进行遗传性别鉴定,在南海沿岸不同群体中具有稳定性和通用性,可广泛用于弓背青鳉遗传性别鉴定。
- 董忠典龙水生黄承勤黄顺楷张宁应子钰郭昱嵩王中铎
- 关键词：性别鉴定分子标记
- 盐度胁迫对弓背青鳉水通道蛋白基因转录的影响被引量：1
- 2022年
- [目的]探究短期盐度胁迫对弓背青鳉(Oryzias curvinotus)水通道蛋白基因(Aquaporin family genes,aqps)转录水平的影响。[方法]以不同盐度(0、13和26)对实验室淡水养殖的弓背青鳉成鱼进行7 d的盐度胁迫,观察弓背青鳉的生存和生长,通过实时荧光定量PCR(quantitative Real-time PCR,qPCR)方法检测aqps在肝脏和鳃组织中转录水平的变化。[结果]淡水对照组和13盐度胁迫处理组弓背青鳉在实验过程中均无死亡;26盐度胁迫处理组在实验初期有2个体死亡。短期盐度胁迫未改变aqps在弓背青鳉鳃组织及aqp0、aqp1、aqp3、aqp10、aqp11在肝脏组织中的转录水平;但显著影响了aqp7和aqp12在肝脏中的转录水平:aqp12转录水平随着盐度的升高而升高,在26盐度胁迫下转录水平显著高于对照组和13盐度组(P<0.05);aqp7的转录水平则随着胁迫盐度的升高而下降,在26盐度胁迫下aqp7表达水平较对照组显著下调(P<0.05)。[结论]弓背青鳉对短期盐度胁迫具有较好的适应能力,肝脏中aqp12和aqp7可能通过调节自身转录水平参与了机体对盐度变化的适应过程。该研究有助于明晰弓背青鳉的广盐性分子机制,为将其开发成广盐性模式生物提供了基础数据。
- 黄泽胤陈月碧黎学友张宁郭昱嵩王中铎董忠典
- 关键词：盐度胁迫水通道蛋白转录水平肝脏
- 基于COI基因和D-loop区部分序列比较雷州半岛东、西岸湖栖鳍虾虎鱼群体的遗传多样性被引量：7
- 2017年
- 为比较分析雷州半岛东、西两岸湖栖鳍虾虎鱼(Gobiopterus lacustris)遗传差异,以COI基因和D-loop区部分序列为分子标记,获取雷州半岛湖栖鳍虾虎鱼群体COI序列44条(九龙山群体21条,高桥群体23条)、D-loop序列53条(九龙山群体25条,高桥群体28条)。基于COI基因部分序列分析结果显示:619 bp的44条序列中,统计的变异位点29个;T、C、A、G碱基组成分别为:27.8%、31.0%、23.7%、17.5%,且A+T(51.5%)高于C+G(48.5%);单倍型多样性比较,九龙山群体(0.695)>高桥群体(0.324);遗传分化分析表明东、西群体分化显著(Snn=0.0.591,0.01高桥群体(0.661);遗传分化分析表明东、西群体分化极显著(Snn=0.970,P<0.001),Fst为0.315(P<0.001),Nm值为0.55,Gst、Kxy、Dxy分别为:0.157、3.506、0.006;AMOVA分析揭示群体内变异程度高于群体间;聚类分析表明,基于COI基因与D-loop区部分序列构建的邻位链接法聚类树(NJ树)均存在按照采样点聚类的现象,但D-loop更为明显。综上,雷州半岛东、西两岸湖栖鳍虾虎鱼群体出现较为明显的分化现象。
- 廖健龙水生贺亮郭昱嵩刘楚吾刘丽王中铎
- 关键词：COID-LOOP
- 弓背青鳉三个地理群体表型比较与性别决定基因初探
- 青鳉属(Oryzias)是一类广泛分布于亚洲东部、东南部中南半岛及印度尼西亚群岛的小型鱼类，具有体型小、产卵多、繁殖周期短等特点，同时由于其易观察受精过程、胚胎发育快、对水质敏感等优点，因而被大量应用于发育生物学、毒理学...
- 汪淳
- 关键词：形态性状转录组性别决定
- 文献传递
- 基于线粒体cox1基因序列的弹涂鱼类系统进化关系被引量：8
- 2017年
- 于我国雷州半岛红树林海区捕获隶属于弹涂鱼属(Periophthalmus)、大弹涂鱼属(Boleophthalmus)与青弹涂鱼属(Scartelaos)的4种弹涂鱼,克隆4种弹涂鱼23个个体cox1基因序列,通过分析4种弹涂鱼与Gen Bank中12种弹涂鱼cox1基因序列的变异特征,探讨4种弹涂鱼与后者的种间亲缘关系。结果表明,16种弹涂鱼的82个体的cox1基因序列共检测到单倍型44个,核苷酸多态位点212个(占35.4%),种间平均核苷酸差异数为4(占2.01%);基于最大似然法(ML)和邻接法(NJ)构建的系统发育树显示,各弹涂鱼属多形成一独立分支,亲缘关系明显,齿弹涂鱼属(Periophthalmodon)镶嵌于弹涂鱼属内,大弹涂鱼属与青弹涂鱼属形成并列分支,亲缘关系较近。依化石记录标定的松散分子钟估算物种分歧时间,结果表明,各弹涂鱼属出现明显分化大约发生于渐新世末期至中新世早期(23.61~15.65 Ma)。
- 张顺廖健郭昱嵩王中铎刘楚吾
- 关键词：弹涂鱼线粒体DNA系统进化
- 5种虾虎鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化被引量：10
- 2016年
- 获得雷州半岛红树林海区5 种虾虎鱼稚幼鱼的45 条线粒体COI 基因序列,其T、C、A、G 碱基平均含量分别为29.9%、28.4%、23.9%、17.8%.45 条序列共定义23 个单倍型,其中检测到变异位点184 个,双带缟虾虎鱼（Tridentiger bifasciatus）单倍型比例最高（80.0%）, 湖栖鳍虾虎鱼（Gobiopterus lacustris）单倍型比例最低（18.2%）.Kimura 2-parameter 遗传距离显示,种间遗传距离为0.137 6 - 0.263 5,种内遗传距离为0.000 0 - 0.020 8.NJ 进化树及ML 进化树均表明,聚为5大支系的虾虎鱼类中,阿部氏鲻虾虎鱼（Mugilogobius abei）与诸氏鲻虾虎鱼（M. chulae）亲缘关系最近,湖栖鳍虾虎鱼与其他4 种虾虎鱼的亲缘关系稍远.基于群体内等位基因频率分布的中性检验结果表明,双带缟虾虎鱼（Tridentiger bifasciatus）、小口拟虾虎鱼（ Pseudogobius masago）、阿部氏鲻虾虎鱼、诸氏鲻虾虎鱼4 个群体存在大量低频等位基因位点,而湖栖鳍虾虎鱼群体以中等频率等位基因为主.
- 廖健张顺龙水生黄承勤郭昱嵩王中铎刘楚吾
- 关键词：虾虎鱼COI基因系统进化
- 重金属铜、铅、锌对尾草履虫的联合毒性
- 2021年
- 为了解重金属混合物对尾草履虫(Paramecium caudatum)的联合毒性,本研究采用急性静水式生物测试法,以12 h的半致死浓度(lethal concentration 50,LC_(50))作为毒性评价标准,运用水生毒理联合效应相加指数法对重金属的联合毒性进行评价,测试了铜离子(Cu^(2+))、铅离子(Pb^(2+))与锌离子(Zn^(2+))对尾草履虫的联合毒性。结果表明:Cu^(2+)、Pb^(2+)与Zn^(2+)对尾草履虫单一毒性的12 h-LC_(50)分别为0.45μmol/L(0.0288 mg/L)、1.46μmol/L(0.3025 mg/L)、3.06μmol/L(0.2001 mg/L),单一毒性作用强弱关系为:Cu^(2+)>ZnCu^(2+)>Pb^(2+);Cu^(2+)/Pb^(2+)、Cu^(2+)/Zn^(2+)、Pb^(2+)/Zn^(2+)二元联合对尾草履虫的联合毒性均表现为拮抗作用。研究结果为重金属对水生物的联合毒性提供数据,也为制定水体重金属安全浓度提供参考。
- 黄皓林晓雨张宁董忠典
- 关键词：尾草履虫重金属联合毒性
