贵州省农业动植物育种专项项目(2009-021)
- 作品数：13 被引量：24H指数：3
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- 相关机构：贵州大学重庆市公安局铜仁学院更多>>
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- 黑色素皮质激素受体1基因248位点多态性与中国马品种毛色的相关性分析被引量：1
- 2012年
- 在欧洲马品种中,黑色素皮质激素受体1(melanocortin receptor 1,MC1R)基因第248位碱基有C/T多态性,纯合的T248位点决定欧洲马的栗毛色。针对MC1R基因的248位点设计了2对特异性引物,采用等位基因特异性PCR技术,研究3个中国马品种MC1R基因型与栗色毛之间的关系。经扩增获得两种DNA片段,克隆测序后证明,扩增片段确为MC1R基因,两种DNA片段序列在基因的248位点的确呈现C/T多态性,但检测126份贵州矮马、西南马和新疆伊犁马血液样本,全部为杂合基因型(Ee),其中包括栗毛、黑毛、骝毛3种单毛色及3种复毛色。这些研究结果提示,MC1R基因中248位点的多态性与国内3个马品种的栗色毛之间没有直接的相关性。
- 党珍王嘉福赵星艳黄勇田松军王荣明冉雪琴
- 关键词：伊犁马毛色MC1R基因
- 贵州矮马(Equus caballus)生长激素受体基因5个单核苷酸位点的多态性研究被引量：3
- 2015年
- 旨在探究贵州矮马生长慢的根本原因,本研究采用PCR和基因克隆技术测定贵州矮马生长激素受体基因(GHR)外显子10的核苷酸序列;以伊犁马为对照,通过AS-PCR和SSCP方法研究贵州矮马群体中SNP位点的分布频率,应用群体遗传学和生物信息学方法分析基因型与体尺指标间的相关性。结果,从贵州矮马GHR外显子10中得到10个单倍型,包括10个SNPs位点,其中的5个引起氨基酸改变。与伊犁马相比,贵州矮马GHR基因1028位点的A等位基因占优势,对应较低的尻高和较粗的管围;1471位点的E等位基因在贵州矮马群体中分布较多,与胸围率较高相关;1697和1732两个位点的杂合型存在于最矮的雄性矮马(6岁)GHR基因中。1028位点引起的V343A位于UbE结构域中,1471、1697和1732位点引起的S491G、Y566C和R578G改变与GHR蛋白的磷酸化有关。这4个位点可能影响GHR的内化作用或通过磷酸化途径影响细胞内的信号传导效率。研究结果提示,贵州矮马GHR基因外显子10中的多态性变化可能影响贵州矮马的生长发育。
- 冉雪琴赵星艳王嘉福田松军魏小红
- 关键词：SNP
- 贵州矮马和西南马3种病毒性疫病的血清学分析被引量：1
- 2016年
- 为探明2012—2013年贵州省紫云县马匹大量死亡的病因,为其科学防治提供参考,采用酶联免疫吸附试验（enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA）方法对当地养殖的贵州矮马、西南马进行马传染性贫血病毒（Equine Infectious Anemia virus,EIAV）、马动脉炎病毒（Equine arteritis virus,EAV）和马疱疹病毒I型（Equine herpesvirus type-1,EHV-1）3种病毒的抗体水平检测,并与伊犁马进行比较。结果表明：3个马群中均未检测到EIAV抗体,EHV-1抗体阳性率达98.15%~100%;与伊犁马相比,贵州矮马和西南马EAV抗体的阳性率较高,分别为48.15%和19.35%,并与2个马群的血液理化指标存在一定相关性。紫云县贵州矮马和西南马存在较高比例的EAV感染,马驹和虚弱马匹感染EAV后死亡率较高,因此推测EAV可能是导致马匹死亡的原因之一。
- 薛艳邓显佑王嘉福冉雪琴田松军魏小红
- 关键词：伊犁马马传染性贫血病毒马动脉炎病毒
- 贵州矮马IGF-I启动子-529 CpG甲基化及个别核苷酸变异与贵州矮马矮小表型有关被引量：1
- 2016年
- 胰岛素样生长因子(insulin-like growth factors,IGFs)和生长(激)素(growth hormone,GH)是动物机体主要的促生长因子,它们的表达水平直接决定成熟个体的高度。贵州矮马的体高明显低于伊犁马等大型马,但其原因尚不清楚。本研究从贵州矮马基因组DNA中克隆了GH和IGF-I基因5'-侧翼序列,分别为239 bp和817 bp,包括部分启动子结构;进而采用生物信息学、比较基因组学方法对比分析了贵州矮马与伊犁马两个基因5'-侧翼序列/启动子的转录因子结合位点及潜在甲基化位点(Cp G岛)分布。亚硫酸氢盐PCR测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)显示,两个马群的GH基因5'-侧翼区域(239 bp)内的6个Cp G位点均发生了甲基化,甲基化频率无明显差异。然而,在IGF-I基因5'-侧翼区的148 bp片段内含有4个Cp G位点中,贵州矮马的-529 bp处Cp G位点的甲基化程度明显高于伊犁马(P<0.01),且该甲基化位点处于基本启动子邻近3'端;此外,两个马群IGF-I基因5'-侧翼区的-561 bp处检测到T、C碱基改变,导致贵州矮马的顺式调控元件/转录因子结合位点较伊犁马少1个,有可能影响IGF-I基因的转录效率。血清IGF-I浓度测定揭示,贵州矮马血清IGF-I含量极显著低于伊犁马(P<0.01)。Spearman相关性结果显示,贵州矮马及伊犁马的IGF-Ⅰ基因甲基化频率与血清IGF-I浓度呈中度负相关(r=-0.468),提示IGF-Ⅰ基因甲基化抑制其编码蛋白质的表达。结果证明,IGF-I启动子高甲基化及某些核苷酸(碱基)序列变异可能是贵州矮马个体矮小的部分原因。
- 王三铭牛熙王嘉福冉雪琴
- 关键词：生长激素胰岛素样生长因子-I甲基化酶联免疫试验
- 贵州矮马、西南马和伊犁马刺豚鼠信号蛋白基因的多态性被引量：1
- 2011年
- 为了探索贵州矮马、西南马、伊犁马刺豚鼠信号蛋白(Agouti signaling protein,ASIP)基因与马品种毛色之间的关系,采用缺口PCR技术分析了141份贵州矮马、西南马、伊犁马的ASIP基因型,并进行克隆测序。结果表明,扩增出的793 bp和385 bp 2个片段为ASIP基因,793 bp片段中缺失一段11 bp的核苷酸,定义为a基因型,385 bp片段结构完整,定义为A基因型;3个马群体中A等位基因在骝毛中占优势;但aa基因型对应的毛色只有小部分为黑毛,绝大部分为栗毛、骝毛和复色毛,与已知的aa基因型决定黑毛的规律不相符,说明aa基因型可能不是中国马品种黑毛的决定基因型。
- 党珍王嘉福赵星艳田松军黄勇冉雪琴
- 关键词：伊犁马毛色多态性
- 3个马群感染马泰勒虫的分子病原学调查被引量：7
- 2016年
- 试验采用显微镜观察、PCR和竞争性酶联免疫吸附试验（competitive enzyme-linked immunosorbentassay,cELISA）等方法对贵州矮马、西南马和伊犁马的马泰勒虫病的感染状况进行研究。结果显示,从32份新鲜的血液涂片中,观察到形态完整的马泰勒虫（Theileria equi）虫体,检出率12.5%。从贵州矮马、西南马及伊犁马3个马群血液总DNA中都检测到马泰勒虫的18SrRNA基因片段,与已知序列的同源性为97%～100%;相比之下,贵州矮马与伊犁马的阳性率相近,分别为76.62%和73.81%,西南马较低,仅为33.33%。另外,经cELISA检测,与伊犁马（31.71%）相比,贵州矮马和西南马血液中抗马泰勒虫抗体的阳性率较低,分别为24.68%和12.12%,并与两个马群的血液理化指标存在一定的联系：与中性细胞数量、γ-谷氨酰转移酶和肌酸激酶的含量呈弱正相关;与红细胞、白细胞、血小板、淋巴细胞数量及血红蛋白含量呈弱负相关。这些研究结果提示3个马群中均存在较高比例的马泰勒虫感染。
- 薛艳邓显佑王嘉福冉雪琴田松军魏小红
- 关键词：伊犁马抗体
- 贵州矮马与伊犁马基因组的RAPD分析被引量：1
- 2013年
- 应用RAPD技术对贵州矮马的遗传多样性进行研究,并与伊犁马进行比较。以120条RAPD引物对两个马品种的混合基因组DNA进行筛选,发现6条引物可产生多态性,并用其对84份样品进行扩增,共获得123条带,其中101条为多态性条带。研究结果表明,贵州矮马与伊犁马的Nei指数分别为0.3136和0.3098,两个品种间遗传分化系数为4.74%,说明贵州矮马的遗传变异较伊犁马小,贵州矮马与伊犁马品种间的基因交流很少;计算个体的遗传相似系数并建立了系统发育树,获得9个分支,其中3个分支中两种马的分布比例相近,其他分支由1个马品种独享占主导,第4、5、6支中两种马所占的比例相近,说明两个马品种拥有共同的祖先,在较早的时间分离后单独进化。
- 雷红梅王嘉福田松军王荣明黄勇冉雪琴
- 关键词：RAPD伊犁马
- 贵州矮马体尺性状及血液理化指标分析被引量：5
- 2011年
- 贵州矮马是贵州特有的珍贵遗传资源。本文主要以贵州省紫云县境内的贵州矮马为研究对象,测定贵州矮马的体尺和血液生理生化指标,结果表明,与当地的西南马相比,成年贵州矮马的体高、体长、胸围、头宽、背高、尻高、尻长、尻宽、前肢长、前膊长、前系长、体重等12项指标明显较低,体长率、胸围率、管围率明显较高,但管围、头长、颈长、前胸宽等指标差异不显著,说明贵州矮马体格较小,但颈部长,胸部和管部发育良好。血液理化指标中,贵州矮马的红细胞比容和血钙浓度明显高于西南马(P<0.05),低密度脂蛋白水平较低。说明贵州矮马血液的运氧能力和肌肉的收缩力较强。贵州矮马修长的颈部、较低的重心、有力的管部、发育良好的心肺功能及其运氧能力是其体态匀称、爬坡性能优良、驮载能力强的主要原因。
- 周正王嘉福党珍赵星艳马荣江李升覃信忠黄勇冉雪琴
- 关键词：体尺
- 贵州矮马与伊犁马生长激素基因5’侧翼区的结构特征被引量：1
- 2012年
- 为了摸索贵州矮马生长发育的调控机制,探明贵州矮马与伊犁马生长激素基因5’侧翼区的结构特征,以4～5龄的贵州矮马和7～8龄的新疆伊犁马为研究对象,采用直接测序法从两种马基因组中克隆了生长激素(GH)基因5’侧翼区的DNA序列,并进行生物信息学分析。结果表明:1)从基因组中克隆的711bp片段为GH基因5’侧翼区序列;2)两个马品种的GH基因5’侧翼区中都存在TATA box、CAATbox、GC box和Octamer位点等真核生物启动子结构;3)从伊犁马GH基因5’侧翼区中检测到1个位于30bp处的突变位点发生了G→C颠换,由此新增了1个转录因子upstream stimulatory factor(USF)结合位点;4)从贵州矮马和伊犁马GH基因的5’侧翼区序列中发现了MZF1、CdxA、Nkx-2、AML-1a和c-Myc等19种共58个转录因子的结合位点。结论:克隆的711bp基因序列中存在大量的转录调控元件。
- 王三铭王嘉福田松军王荣明党珍冉雪琴
- 关键词：生长激素基因结构特征伊犁马
- 贵州矮马SHOX基因的鉴定及其多态性研究
- 2015年
- 矮小同源盒基因(SHOX)突变是儿童身材矮小的重要原因。贵州矮马的体高和前膊长较小,但不清楚马基因组中是否有SHOX基因。本研究采用PCR和RT-PCR方法 ,从贵州矮马血液和心脏中克隆SHOX基因F1和F2片段;经测序研究贵州矮马SHOX基因的多态性。结果表明:从贵州矮马基因组中克隆到F1片段279 bp,从心脏总RNA逆转录得到F2片段216 bp,分别对应于人SHOX基因外显子2和外显子3区域;片段F2编码72个氨基酸,其中Ser16为磷酸化位点,且含有DNA结合结构域N端的45个氨基酸;片段F1对应于马参考基因组未定位的Scaffold 118中,推测马SHOX基因可能位于X染色体的短臂末端;从SHOX基因2个片段的序列中找到6个变异位点,但贵州矮马群体中各SNP位点的分布频率与伊犁马之间没有明显差异;矮马个体中存在SHOX基因的单核苷酸变异,可能参与骨的发育调节。本研究结果表明,马基因组中存在SHOX基因,且有转录活性,SHOX基因外显子2和3的序列保守,基因的变异可能参与个体的骨发育调节。
- 冉雪琴赵星艳岑永秀徐倩王嘉福李升阮涌
- 关键词：多态性体高伊犁马
