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国家自然科学基金(31201970)

作品数:7 被引量:19H指数:3
相关作者:陈炯陆新江史雨红陈强李明云更多>>
相关机构:宁波大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”浙江省自然科学基金更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 7篇中文期刊文章

领域

  • 4篇生物学
  • 4篇农业科学

主题

  • 5篇香鱼
  • 2篇荧光
  • 2篇荧光定量
  • 2篇实时荧光
  • 2篇实时荧光定量
  • 2篇实时荧光定量...
  • 2篇鳗利斯顿氏菌
  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白质
  • 1篇蛋白质组
  • 1篇蛋白质组学
  • 1篇蛋白质组学分...
  • 1篇盐度
  • 1篇应激
  • 1篇鱼体
  • 1篇肾组织
  • 1篇视黄醇结合
  • 1篇视黄醇结合蛋...
  • 1篇趋化
  • 1篇趋化因子

机构

  • 5篇宁波大学

作者

  • 5篇陈炯
  • 4篇史雨红
  • 4篇陆新江
  • 3篇陈强
  • 1篇赵桐
  • 1篇杨旦阳
  • 1篇黄左安
  • 1篇周前进
  • 1篇沈广强
  • 1篇李明云

传媒

  • 3篇生物学杂志
  • 2篇Zoolog...
  • 2篇中国细胞生物...

年份

  • 1篇2016
  • 2篇2014
  • 4篇2013
7 条 记 录,以下是 1-7
排序方式:
香鱼RBP基因的克隆、组织表达特征及其与盐度应激相关的表达分析被引量:1
2013年
血浆视黄醇结合蛋白(Retinol binding protein,RBP)是体内将视黄醇从肝脏转运至靶组织的特异载体蛋白。最近研究发现在盐度升高时肾脏RBP蛋白表达量下降。为了进一步研究香鱼RBP基因mRNA和蛋白表达与盐度应激相关性,从香鱼、肝脏cDNA文库中获得RBP基因cDNA序列。香鱼RBP基因mRNA在肝脏中表达量最高,肾、肠、脑和鳃中表达次之。实时荧光定量RT-PCR结果显示,盐度升高时,RBP基因mRNA表达在不同组织中呈不同下降趋势,其中渗透压调节相关组织鳃、肾中,表达量下降最显著。Western blot实验证实,盐度升高时,香鱼血清RBP蛋白表达量也显著下降。揭示了RBP可能在香鱼盐度适应中有重要作用。
陈强赵桐史雨红陈炯
关键词:视黄醇结合蛋白克隆盐度香鱼
香鱼CCL4-like基因的克隆、序列分析及免疫相关性表达变化分析被引量:7
2013年
CC型趋化因子是一种多功能的趋化因子,是鱼类先天免疫系统的重要组成部分。该研究通过文库测序方法获得香鱼(Plecoglossus altivelis,ayu)CCL4-like(aCCL-like)基因cDNA序列。它编码一个由123个氨基酸组成的前肽,N-端22个氨基酸为信号肽序列。成熟肽包含4个半胱氨酸残基,可形成2个二硫键。系统进化树分析揭示,aCCL4-like与大西洋鲑(Salmo salar,atalantic salmon)CCL4亲缘关系最近。实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,RT-qPCR)分析揭示,aCCL4-like基因mRNA在检测的健康香鱼7个组织中均有表达,其中肝的表达量最高;在鳗利斯顿氏菌(Listonella anguillarum)感染后,各组织中aCCL4-like基因mRNA表达均显著变化,但各时间点变化不一,其中肠组织的变化最为明显。随后原核表达了aCCL4-like并制备相关抗血清,Western blot分析揭示,鳗利斯顿氏菌注射后4 h的血清中CCL4-like含量无显著变化,8 h时显著增加,此后表现为持续增加。综上,aCCL4-like基因的表达变化与鳗利斯顿氏菌的感染过程密切相关,推测aCCL4-like可能在香鱼抗病原菌感染的免疫反应过程中有重要作用。
杨旦阳陈炯陆新江史雨红李明云
关键词:香鱼鳗利斯顿氏菌实时荧光定量PCR
陆封型和洄游型香鱼体肾组织的蛋白质组学分析被引量:3
2014年
香鱼(Plecoglossus altivelis)是典型的降海洄游鱼类,由于地理原因,一些香鱼在繁殖季无法回到海中产卵,形成陆封型香鱼。陆封型和洄游型香鱼相比,其体型明显偏小。鱼类的体肾组织可以调控渗透压,从而影响生长,因此我们采用蛋白质组学的方法研究陆封型和洄游型香鱼体肾组织蛋白质组的差异。双向电泳(2-DE)分析筛选到25个差异表达蛋白点,质谱分析成功鉴定出21个蛋白。与洄游型香鱼相比,陆封型香鱼体肾组织中NADH脱氢酶、异柠檬酸脱氢酶、α-微管蛋白、热适应相关蛋白65(Wap65)、热休克蛋白60(HSP60)、丙酮酸脱氢酶(E1)、碳酸酐酶、烯醇酶和乳酸脱氢酶表达量较高。同时陆封型香鱼的β-肌动蛋白、铁蛋白、氨基酰化酶、甲硫氨酸腺苷转移酶、过氧化物酶、丙氨酸乙醛酸转移酶和磷酸烯醇丙酮酸羧激酶则表达量较低。它们主要参与能量代谢、应激反应、氨基酸代谢等过程。由于Wap65、HSP60和E1 3种蛋白在蛋白质组学结果中表达改变,且与应激和能量代谢有关,可能影响鱼类生长,因此采用荧光定量PCR(RT-PCR)验证陆封型和洄游型香鱼体肾Wap65、HSP60和E1基因mRNA表达差异,结果表明这3个基因mRNA表达均在陆封型香鱼体肾中较高,与蛋白质组学结果一致。综上,陆封型香鱼的几个糖酵解相关酶和应激蛋白表达量比洄游型香鱼高,而蛋白代谢相关酶表达量较低,揭示陆封型和洄游型香鱼在环境应激和能量代谢等层面有明显的差异。
陈强陆新江黄左安陈炯
关键词:香鱼陆封型蛋白质组学
Characterization and expression of sweetfish (Plecoglossus altivelis) cathepsin D被引量:2
2014年
Cathepsin D (CTSD) is a lysosomal acidic endoproteinase that plays an important role in immune response, In this study, we obtained sweetfish (Plecoglossus altivelis) CTSD (PaCTSD) via de-novo transcriptome sequencing of sweetfish macrophages. The full length cDNA sequence of PaCTSD was 1955 bp encoding a propeptide of 397 amino acids. The deduced protein had a calculated molecular weight of 43.17x 103. Multiple alignment with other known CTSD amino acid sequences revealed amino acid conservation through the teleosts. Phylogenetic tree analysis showed that PaCTSD grouped tightly with other fish CTSD, and was close to that of Atlantic salmon and rainbow trout. Subsequently, PaCTSD was prokaryotically expressed and refolded by the urea gradient method on a nickel-nitrilotriacetic acid column. Enzyme activity analysis showed that PaCTSD exhibited pH-dependent proteolytic activity. Quantitative real-time PCR showed that PaCTSD mRNA was expressed in all detected tissues in healthy sweetfish. The highest expression was observed in the spleen and white blood cells, followed by liver, head-kidney, kidney, intestine, gill, and muscle. After Listonella anguillarum infection, PaCTSD transcripts were up-regulated significantly in liver, spleen, white blood cells, and head-kidney of sweetfish. In summary, PaCTSD has proteolytic activity and is closely involved in the immune response of sweetfish.
Yu JIAOChang-Hong LIXin-Jiang LUJiong CHEN
关键词:QRT-PCR
香鱼镉胁迫相关基因UraD的特征和表达分析被引量:1
2013年
2-氧-4-羟基-4-羧基-5-脲基咪唑啉脱羧酶(UraD)是嘌呤代谢反应酶,目前鱼类UraD基因仅在斑马鱼等少数物种得到克隆分析。从香鱼克隆获得UraD的cDNA序列,全长为967 bp,编码一个由174 aa组成的分子量为19.6kDa的蛋白,等电点为5.42。系统进化树分析显示香鱼UraD位于鱼类UraD簇中,与爬行类和哺乳类的亲缘关系较远,香鱼与斑马鱼UraD的蛋白序列相似性最高达70%。香鱼UraD表达经过反转录PCR(RT-PCR)检测发现在香鱼肝、心和肠中具有较高表达。香鱼肝组织中UraD表达量经过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测,发现镉胁迫下显著减少,香鱼UraD表达在盐度胁迫和鳗利斯顿氏菌感染下表达量保持不变。上述结果揭示香鱼UraD基因的基本特征,说明香鱼UraD基因表达与镉胁迫密切相关。
陈强陆新江陈炯史雨红
关键词:香鱼镉胁迫实时荧光定量PCR
Comparative transcriptome analysis on the alteration of gene expression in ayu (Plecoglossus altivelis)larvae associated with salinity change被引量:3
2016年
Ayu (Plecoglossus altivelis) fish, which are an amphidromous species distributed in East Asia, live in brackish water (BW) during their larval stage and in fresh water (FW) during their adult stage. In this study, we found that FW-acclimated ayu larvae exhibited a slower growth ratio compared with that of BW-acclimated larvae. However, the mechanism underlying FW acclimation on growth suppression is poorly known. We employed transcriptome analysis to investigate the differential gene expression of FW acclimation by RNA sequencing. We identified 158 upregulated and 139 downregulated transcripts in FW-acclimated ayu larvae compared with that in BW-acclimated larvae. As determined by Gene Ontology annotation and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathway mapping, functional annotation of the genes covered diverse biological functions and processes, and included neuroendo- crinology, osmotic regulation, energy metabolism, and the cytoskeleton. Transcriptional expression of several differentially expressed genes in response to FW acclimation was further confirmed by real-time quantitative PCR. In accordance with transcriptome analysis, iodothyronine deiodinase (ID), pro-opiom- elanocortin (POMC), betaine-homocysteine S-meth- yltransferase 1 (BHMT), fructose-bisphosphate aldolase B (aldolase B), tyrosine aminotransferase (TAT), and Na+-K+ ATPase (NKA) were upregulated after FW acclimation. Furthermore, the mRNA expressions of b-type natriurefic peptide (BNP) and transgelin were downregulated after FW acclimation. Our data indicate that FW acclimation reduced the growth rate of ayu larvae, which might result from the expression alteration of genes related to endocrine hormones, energy metabolism, and direct osmoregulation.
Xin-Jiang LUHao ZHANGGuan-Jun YANGMing-Yun LIJiong CHEN
香鱼IL-12B基因序列及其表达与鳗利斯顿氏菌感染的相关性分析被引量:2
2013年
白介素-12B(interleukin-12B,IL-12B)是组成IL-12分子的亚基,参与病原菌感染引起的免疫反应。该研究经香鱼(Plecoglossus altivelis)巨噬细胞转录组测序获得其IL-12B基因,包括完整的开放阅读框在内,序列大小为1 152 bp,预测编码的前体蛋白由303个氨基酸组成,N-端22个氨基酸残基为信号肽序列。序列比对及进化树分析表明,香鱼IL-12B与大西洋鲑IL-12B进化关系最近,氨基酸序列同源性达50%。香鱼IL-12B基因mRNA在健康香鱼头肾组织和外周血白细胞中表达量最高,在脾脏、腮和肠等组织也有少量表达。荧光定量PCR分析揭示,鳗利斯顿氏菌(Listonella anguillarum)感染后,香鱼头肾组织和外周血白细胞IL-12B基因mRNA表达显著上调,12 hpi(hours post infection)时达到峰值。随后原核表达了香鱼IL-12B,并制备抗血清。Western blot结果揭示,香鱼血清IL-12B含量在鳗利斯顿氏菌感染后4 hpi时尚无显著变化,8 hpi后显著上调,并表现持续增加。综上,香鱼IL-12B基因的表达变化与鳗利斯顿氏菌感染过程密切相关,揭示香鱼IL-12B基因可能在病原菌感染引起的免疫反应中发挥重要作用。
沈广强陈炯史雨红周前进陆新江
关键词:香鱼鳗利斯顿氏菌基因表达
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