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国家火炬计划(2008GH540088)
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张娜
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张洪礼
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基于更新日志的移动对象索引方法
2011年
在TPR-tree上增加一个基于内存的更新日志,实现一种支持频繁更新的移动对象索引ULTPR-tree,采用分组更新方法对移动对象记录进行批量删除,从而减少ULTPR-tree索引结构的删除维护代价。理论分析和实验结果表明,ULTPR-tree的动态更新性能优于TPR-tree和HTPR-tree。
王宝文
曹亮
陈子军
关键词:
索引机制
含伪结RNA二级结构预测的支持向量机方法
2010年
RNA二级结构预测是生物信息学的一个研究重点和难点.伪结是RNA二级结构中最难预测的一种.本文利用多分类支持向量机对含平面伪结的RNA分子二级结构进行预测.第一步,利用多分类支持向量机进行预测,输出端得到相应碱基的E-NSSEL类别标识.第二步,利用第一步的预测结果,把所有可能配对的标识是否配对通过支持向量机进行判断,并根据判断结果恢复RNA分子二级结构.实验证明,该方法能有效地提高含平面伪结的RNA分子二级结构的预测精度.
张洪礼
张娜
王常武
王宝文
刘文远
关键词:
多分类支持向量机
含伪结的RNA分子二级结构预测
2011年
预测含伪结的RNA分子二级结构是生物信息学的一个研究难点。利用多分类支持向量机结合贝叶斯神经网络针对含伪结的RNA分子二级结构进行预测。利用多分类支持向量机进行预测,输出端得到相应碱基的平面伪结结构的E-NSSEL(Ex-tend New Secondary Structure Element Label)类别标签。使用碱基已预测的结果通过贝叶斯神经网络进行修正,并恢复RNA分子二级结构。使用该方法能有效地改善含伪结的RNA分子二级结构的预测效果。
张洪礼
张娜
刘文远
王常武
关键词:
多分类支持向量机
贝叶斯神经网络
RNA二级结构
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