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国家科技重大专项(2012ZXl0003002-008)

作品数：1 被引量：1H指数：1
相关作者：胡忠义秦莲花高诗会赵英伟更多>>
相关机构：苏州大学上海市肺科医院更多>>
发文基金：上海市科学技术委员会资助项目国家科技重大专项更多>>
相关领域：医药卫生更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇医药卫生

主题

  • 1篇遗传学
  • 1篇菌属
  • 1篇分枝杆菌
  • 1篇分枝杆菌属
  • 1篇杆菌

机构

  • 1篇上海市肺科医...
  • 1篇苏州大学

作者

  • 1篇赵英伟
  • 1篇高诗会
  • 1篇秦莲花
  • 1篇胡忠义

传媒

  • 1篇中华结核和呼...

年份

  • 1篇2012
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
一种五联重复序列在分枝杆菌简单序列重复区间分型中的应用研究被引量：1
2012年
目的分析微卫星5联简单重复序列在分枝杆菌基因组中的分布情况，并评价其简单序列重复区间（ISSR）分型能力，为分枝杆菌的基因分型及流行病学研究提供新的研究工具。方法实验菌株为17株分枝杆菌菌株和41株MTB临床分离株，17株分枝杆菌菌株包括分枝杆菌标准株15株、MTB临床菌株1株和MTB无毒株（H37Ra）1株。利用MICdb2．0软件分析微卫星数据库收录的分枝杆菌基因组中5联简单重复序列（CAGCG）n的分布特征，并以该序列为基础设计ISSR引物（5’-CAGCGCAGCGCAGCG-3’），用于分枝杆菌种间和种内菌株的基因分型分析。结果生物信息学分析显示（CAGCG）n在数据库收录的大部分分枝杆菌基因组中均有较高含量，其中在H37Rv、CDCl551、牛分枝杆菌和鸟分枝杆菌基因组中出现的次数分别为40、39、39和33次，且主要分布在编码序列区（分别为39、36、38和30次）。ISSR引物对分枝杆菌菌种的基因分型分析显示，15种常见菌种聚为2大簇，第1簇含有2个亚型，第2簇含有4个亚型，种间表现出高度的遗传多样性；ISSR引物对MTB临床菌株的分析结果显示，41株菌株聚为2簇，各簇分别有2个亚型，提示该引物对种内菌株也表现出良好的分辨力。结论以（CAGCG）n建立的ISSR分型体系，可用于分枝杆菌种间和种内菌株的遗传多样性分析。
高诗会胡忠义赵英伟秦莲花
关键词：分枝杆菌属
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