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广西省自然科学基金(0249007)
作品数:
2
被引量:3
H指数:2
相关作者:
罗廷荣
梁燕
邓先明
李回
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相关机构:
广西大学
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广西狂犬病野毒株L基因3'端的多态性分析
被引量:2
2009年
为了解狂犬病病毒(RV)的变异情况,本研究对广西不同地区的22个RV分离株的L基因3'端片段进行克隆和测序,与国内外发表的RV街毒、固定毒株及类RV株相应部分的多态性进行了比较分析。结果表明,所测定的22个广西RV野毒分离株属于基因Ⅰ型,可分为3个群即Ⅰ群、Ⅱ群和Ⅲ群。其中13株属于Ⅰ群,其核苷酸同源性为96.9%~100.0%,氨基酸同源性为98.2%~100.0%;8株属于Ⅱ群,株核苷酸同源性为96.5%~99.7%,氨基酸同源性为97.8%~100.0%。仅1株属于Ⅲ群。22个RV分离株与RV固定毒株核苷酸和氨基酸的同源性分别为79.5%~86.9%和85.8%~96.5%,与类RV核苷酸和氨基酸的同源性分别为65.7%~70.3%和70.4%~76.5%。
曾兰
陆武
王雯
李回
梁晶晶
孟先明
潘艳
唐黄惠
罗廷荣
关键词:
狂犬病病毒
多态性分析
广西狂犬病病毒L基因聚合酶活性部位的多态性分析
被引量:2
2008年
对广西流行狂犬病病毒的L基因聚合酶活性部位进行克隆和测序,并与国外固定毒株和类狂犬病毒株进行比较分析。结果显示,广西流行毒株之间的核苷酸和推定的氨基酸同源性较高,分别为88、7%~99.8%和96.5%~100%,与国外固定毒株的核苷酸和推定的氨基酸同源性分别为84.8%~87.5%和94.5%~99.0%,与类狂犬病病毒株的核苷酸和推定的氨基酸同源性分别为75.5%~79.2%和93.5%~97.0%;通过比较推定的氨基酸序列发现,第660位为广西Ⅱ群毒株的特异性变异1660V,第771位为广西Ⅰ群毒株的特异性变异S771A,第745位点广西毒株全部为精氨酸,而国外参考毒株为丝氨酸、亮氨酸或组氨酸;4个基序高度保守,基序A保持不变,基序B、C、D只有少数氨基酸发生变异,基序C中的核心序列GDNQ在各毒株中都不变。
陆专灵
尹伟力
宋宏立
甘浪帆
张红云
邓先明
梁燕
罗廷荣
关键词:
狂犬病病毒
多态性分析
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