辽宁省教育厅高等学校科学研究项目(20061014)
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 相关作者：张惠丹单连峰周宝森方瑾陈航更多>>
- 相关机构：中国医科大学更多>>
- 发文基金：辽宁省教育厅高等学校科学研究项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 混合法用于基因芯片数据的分类分析被引量：1
- 2009年
- 目的研究广义似然比检验(GLRT)与支持向量机(SVM)相结合的混合法在基因芯片表达数据分类研究中的应用效果。方法结合Golub研究的白血病基因表达数据,利用GLRT寻找白血病表达水平存在显著性差异的基因,再使用SVM对白血病进行分类。结果基于GLRT鉴别得到的特征基因有很强的代表性,SVM分类的效果明显优于其他方法。结论混合法在解决数据量大、维数高、样本量小、非线性问题中具有很强的优势,可以有效的用于基因芯片表达数据的分类研究。
- 单连峰张惠丹周宝森
- 关键词：白血病基因芯片广义似然比检验支持向量机
- 人大肠癌抗原基因cDNA噬菌体表达文库的构建和鉴定
- 2009年
- 目的:为获得大肠癌的特异性抗原基因,构建人大肠癌抗原基因的cDNA噬菌体表达文库。方法:从2株人大肠癌细胞CCL-187和CX-1中提取总RNA,分离纯化mRNA,并以此为模板合成第1链cDNA,用置换法合成第2链cD-NA。双链cDNA经末端削平、EcoRⅠ接头连接、XhoⅠ酶切、过柱分级分离,除去<400bp片段。收集符合需要的cDNA片段与噬菌体ZAPExpress载体连接,体外包装后获得人大肠癌抗原基因的cDNA噬菌体表达文库。结果:构建的人大肠癌抗原基因的cDNA噬菌体文库,原始库容量为2.3×109pfu/L,重组率97%。重组子插入cDNA片段平均大小1kb以上。结论:成功地构建高质量的人大肠癌抗原基因的cDNA噬菌体表达文库,为大肠癌的特异性抗原筛选奠定了基础。
- 陈航方瑾
- 关键词：人大肠癌噬菌体CDNA表达文库
