海南省自然科学基金(313058)
- 作品数：5 被引量：5H指数：2
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- 相关机构：中国热带农业科学院更多>>
- 发文基金：海南省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 椰子保守microRNA预测和特征分析被引量：2
- 2014年
- 根据释放的椰子转录组序列和miRBase数据库中的microRNA （miRNA）序列信息,分析椰子中保守miRNA及其相应靶基因的特征.根据miRBase数据库中植物miRNA序列,共预测了41个miRNA,分别属于22个miRNA家族.这些miRNA家族中13个家族在植物中非常保守,miRBase至少在19个物种中检测到,而miR902、miR2673和miR414这3个家族不保守,仅在1～2个物种中检测到.这些预测的miRNA的成熟序列长度大多为21个碱基（59.5％）,而前体序列的长度大多为50～100个碱基（61.9％）.分析miR396家族前体序列时发现,成熟miRNA和成熟miRNA＊（成熟miRNA形成发卡结构互补的序列）序列很保守,但是中间的序列变异很大.此外,预测miRNA的靶基因发现保守的miRNA家族的靶基因为一些重要的转录因子家族,与植物的生长发育相关,而不太保守的miRNA家族的靶基因编码与表型控制相关的蛋白.
- 夏薇李静周丽霞杨耀东肖勇马子龙
- 关键词：椰子靶基因
- 高等生物着丝粒序列更新与进化的研究进展
- 2014年
- 综述了近年来国内外在高等生物着丝粒序列更新与进化方面的研究进展,包括着丝粒序列的进化与变异、着丝粒序列变异的分子机制(插入缺失、扩增)以及着丝粒序列的选择动力等。
- 夏薇杨耀东肖勇周丽霞李静马子龙
- 关键词：高等生物着丝粒
- 转录本选择性剪切研究进展
- 2014年
- 论述了转录本选择性剪切的类型、选择性剪切对编码蛋白的影响以及选择性剪切与生物生长发育、生物逆境的关系,阐述了基于EST序列、cDNA序列、生物芯片以及新一代测序技术分析高等生物选择性剪切事件的方法。
- 夏薇李静周丽霞杨耀东肖勇马子龙
- 关键词：选择性剪切转录本转录后调控高等生物剪切位点
- 高等植物着丝粒序列的结构与特征研究被引量：3
- 2014年
- 着丝粒是染色体的重要组成成分之一,在细胞有丝分裂和减数分裂中行使重要的生物学功能,着丝粒在不同的物1种中保持着一致的功能,即在细胞分裂中期,着丝粒在纺锤丝的牵引下使染色体向两级运动,从而完成细胞的分裂。如此保守的功能,是乎暗示着丝粒序列不同物种间具有一定的保守性,然而随着测序技术的发展,越来越多的物种的基因组序列被释放,分析发现着丝粒序列主要由重复序列和反转录转座子组成,然而不同物种着丝粒序列比对发现,它们之间的同源性极低,此外染色体的着丝粒的序列的组成和大小都相差甚远。文中回顾了近些年在着丝粒研究方面所取得的进展,探讨维持着丝粒功能稳定性的序列结构特征。
- 夏薇李静周丽霞杨耀东肖勇马子龙
- 关键词：着丝粒反转录转座子稳定性同源性
- 椰子乙酰CoA羧化酶(ACC)基因的鉴定及表达分析被引量：1
- 2017年
- [目的]克隆椰子的乙酰Co A羧化酶(ACC)基因.[方法]通过已发表的椰子转录组注释结果,鉴定潜在的椰子ACC基因.分析ACC基因在椰子果肉和嫩叶混合样转录组中的RPKM值,同时,采用实时定量PCR技术研究5个高RPKM值的ACC基因在椰子果肉发育的不同时期的表达情况.[结果]共获得21个椰子的ACC基因,这21个ACC基因在椰子果肉和嫩叶混合样品中有较高的表达量,4个ACC基因(Unigene7806、Unigene47155、Unigene7847和CL185.Contig1)在椰子果肉发育9个月时表达量最高.[结论]该研究为解析椰子脂肪酸积累的分子机制提供了前期工作基础.
- 肖勇雷新涛王永曹红星石鹏金龙飞夏薇
- 关键词：椰子实时定量PCR
