国家自然科学基金(30872040)
- 作品数：3 被引量：31H指数：2
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- 叶籽银杏GbMADS5基因的克隆与序列分析
- MADS-box基因是一类编码转录因子的基因大家族,在植物的发育过程中具有重要作用。采用RT-PCR技术从叶籽银杏(Ginkgo biloba var.epiphylla Mak.)中克隆了MADS-box基因GbMAD...
- 邢世岩王京梅李际红姚林梅
- 关键词：叶籽银杏MADS-BOX基因
- 文献传递
- 叶籽银杏matK基因序列分析及系统发育研究
- 测定了2株银杏和27株叶籽银杏的matK基因序列并利用最大简约法和邻接法构建了系统发育树。结果表明:叶籽银杏matK基因序列长度为1539bp。序列分析表明,matK基因序列T碱基含量最高且富含A/T。密码子3个位点中,...
- 邢世岩李保进
- 关键词：叶籽银杏MATK基因系统发育
- 文献传递
- 叶籽银杏trnS-G序列测定与分析
- 以不同地区的13株叶籽银杏为研究对象,通过克隆测序的方法测得其trnS-G序列并进行比较分析。结果表明,大部分序列长度为1005bp,采自山东省沂源的YZ4序列最短,为1002bp,叶籽银杏的trnS-G序列富含A/T,...
- 邢世岩董雷雷
- 关键词：叶籽银杏
- 文献传递
- 菊花节律钟输出基因CmGI(GIGANTEA)的cDNA全长克隆、序列信息及定量表达分析被引量：7
- 2012年
- 【目的】克隆菊花节律钟输出基因GIGANTEA的cDNA全长序列,进行序列信息学分析,研究其mRNA的相对定量表达。【方法】利用多聚酶链式反应(PCR)结合5′RACE、3′RACE技术,克隆节律钟输出基因GIGANTEA的cDNA全长序列,应用生物信息学软件对获得的基因核苷酸序列及编码的蛋白质序列进行分析;通过在线建模软件对蛋白质的三维结构进行建模预测;利用实时荧光定量PCR技术,用2-△△Ct法进行GIGANTEA的mRNA相对定量表达分析。【结果】从菊花品种‘Jinba’中克隆得到节律钟输出基因GIGANTEA的cDNA全长序列,核苷酸序列长度3 461 bp,开放阅读框3 453 bp,编码1 150个氨基酸。氨基酸序列分析显示,该基因编码的蛋白与植物节律钟输出基因GIGANTEA同源,命名为CmGI基因,序列提交到GenBank,登录号为JQ043439。序列比对显示与葡萄、蓖麻等的GI的相似度依次为76%、75%。构建类似蛋白系统进化树显示,菊花CmGI与拟南芥(Arabidopsis thaliana GIGANTEA,ABP96482.1)分子进化距离最近,其次是白菜(Brassica rapa GIGANTEA,AEB33730.1);预测CmGI蛋白有6个跨膜螺旋多次跨膜;为转录因子,定位在细胞核中,为非分泌性蛋白质;不具备信号肽;对CmGI三级结构建模预测表明,蛋白核心结构符合转录因子与DNA结合常见的功能域HTH、HLH;采用荧光相对定量分析,菊花CmGI的表达呈昼夜节律表达模式;不同花芽分化阶段叶片中CmGI基因mRNA水平差异大,两个高峰值分别出现在花芽分化启动期和小花原基分化中期;营养生长的组培苗、长日照条件下的叶、芽、花蕾期均是痕量表达;盛花期表达量依次为叶片>舌状花>筒状花。【结论】从菊花中克隆得到节律钟输出基因CmGI,对该基因的进一步深入研究有助于探索光周期途径菊花成花的分子调控机制,可作为切花菊花期调控分子育种的目标基因。
- 孙霞王秀峰郑成淑邢世岩束怀瑞
- 关键词：菊花花芽分化
- 叶籽银杏成熟种子脱落特性及种子形态指标分析被引量：1
- 2009年
- 以山东沂源一株叶籽银杏为试材,对其成熟种子的脱落特性和形态指标进行研究,结果表明:9月15日至10月10日,共收集落种1 109个,日均落种数为48个。种子脱落明显分为脱落前期、中期和后期,脱落中期为9月27日至10月4日。9月16日的种重是6.24 g,9月22日出核率是35.57%,10月5日出仁率是64.17%。本研究对探讨叶生种子发育生理过程有重要意义。
- 姚林梅邢世岩张芳韩晨静王京梅李秀芬
- 关键词：叶籽银杏成熟种子
- 银杏基因组DNA甲基化修饰位点的MSAP分析被引量：23
- 2011年
- 利用EcoRⅠ和HpaⅡ/MspⅠ双酶切建立适合于银杏基因组的甲基化敏感扩增多态性(methylation-sensitive amplification polymorphism,MSAP)分析体系,在全基因组水平检测银杏DNA甲基化修饰水平、模式及位点等表观遗传信息。结果显示,从54对MSAP选扩引物中,选出16对MSAP引物组合,共扩增产生454条清晰可辨且可重复的DNA条带,平均每对引物扩增获得28.38条带。在全部扩增位点中,检测到甲基化位点200个,CCGG/GGCC位点甲基化修饰比例为44%。部分银杏基因组甲基化修饰位点进行回收,最终分离了18条存在甲基化修饰的基因组DNA序列。BLASTn比对分析表明,银杏基因组中包括转录调控因子、反转录转座子、通道蛋白、启动子结合蛋白、蛋白激酶等在内的多种类型的DNA序列中均存在DNA甲基化修饰现象。
- 李际红邢世岩王聪聪张倩付茵茵
- 关键词：银杏表观遗传学DNA甲基化MSAP
- 菊花花芽分化期叶片和茎尖转录组表达分析
- 研究菊花花芽分化期转录组表达序列标签(ESTs)。以切花菊品种‘神马’为试材,从菊花不同花芽分化期叶片和茎尖中分别提取的总RNA构建cDNA文库,利用高通量EST测序技术,分析菊花花芽分化期叶片和茎尖的转录组表达序列标签...
- 孙霞郑成淑王秀峰邢世岩束怀瑞
- 关键词：菊花花芽分化转录组UNIGENE
- 文献传递
