目的探索三种核酸扩增方法应用于临床乙脑标本检测的敏感性,建立能够适合于临床标本的检测方法,同时比较病毒核酸检测与血清学检测的相关性。方法分别采用普通逆转录PCR、逆转录套式PCR和SyBr Green I实时荧光PCR方法对48份疑似乙脑病例的血清或脑脊液标本进行检测,并比较了三种方法的检出限。结果血清学检测表明,48份标本中有18份标本IgM抗体阳性;3种病毒核酸检测,普通逆转录PCR和SyBr Green I实时荧光PCR方法未能检出阳性标本,而逆转录套式PCR检出15份阳性标本。结论三种核酸检测方法中,逆转录套式PCR最为敏感;单独依赖血清学检测会产生相当一部分假阴性,证明了临床实验室加强乙脑病毒核酸检测对临床诊断具有重要意义。