国家自然科学基金(91230204)
- 作品数：4 被引量：11H指数：2
- 相关作者：周天寿杜焰易奇志更多>>
- 相关机构：中山大学江西师范大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划江西师范大学博士启动基金更多>>
- 相关领域：生物学理学自动化与计算机技术更多>>
- 生化反应系统的二项矩和属性因子被引量：1
- 2016年
- 化学主方程对生化反应系统提供了一个建模框架,但它的分析与模拟一直是计算系统生物学的一个挑战.另一方面,矩封闭方法对化学主方程提供了一种逼近,但普通的矩当其阶趋于无穷时并不趋于0,因此具有局限性.这里,对概率密度函数引进二项矩,它具有2个突出的特点:1)当二项矩的阶充分大时二项矩趋于0;2)二项矩能够方便地用来重构相应的概率密度函数.基于二项矩,进一步引进反应物种的属性因子,它比普通的统计指标(如噪声强度、Fano因子)具有某些优势.此外,还给出了用二项矩来表示噪声强度和Fano因子的显式公式,并用简单的生物例子来说明二项矩的优势与3种统计指标的特征.
- 周天寿
- 关键词：噪声强度
- 生化参数对耦合回路的影响
- 2015年
- 网络组成的互连元件之间具有复杂的动态行为。一些子网通常被视为他们的特殊功能的网络模块。反馈回路在这些网络图案中发挥的重要作用。通过改变一个参数值,我们发现,耦合回路可以表现出丰富的动力学行为。我们通过分岔图分析两个耦合结构的动力作用,我们找出了耦合系统发生hopf分岔时的hill系数的区间和发生双稳态的时的压制参数的区间。
- 郑赟孔唯旺
- 概率主方程的研究综述被引量：8
- 2015年
- 反应网络广泛存在于自然系统中.原理上,概率主方程对任何反应网络系统的随机行为提供了最为完整的数学模型.然而,分析和模拟这种类型的方程长期以来是一项挑战性任务.至目前为止,有关问题并没有得到根本解决,相关研究仍在继续.该文对概率主方程的研究进展进行了较为系统和全面的综述,聚焦于若干常用的近似分析方法(如线性噪声逼近、普通矩封闭法、2项矩方法等)与常用的数值方法(如Gillespie随机模拟算法、有限状态映射法、矩封闭格式等).特别地,分析了概率主方程研究取得缓慢进展的主要原因,讨论并提出了可能的解决方案.
- 周天寿
- 关键词：反应网络
- 系统规模对群体行为的效果被引量：2
- 2013年
- 影响细胞群体行为的因素是多种多样的,除了以前研究的细胞通讯方式和环境因素外,还与现有文献没有或很少研究的细胞数目(即系统规模)有关.本文研究了系统规模对一类合成多细胞通讯系统的聚类行为的影响.在该系统中,单个系统是由压制振动子和基于延迟的松弛振子整合而成的振子,而振子之间通过群体感应机制相互耦合.通过分岔分析和数值模拟发现:细胞数目的增加不仅可以改变平衡态聚类稳定性区间的大小并诱导新的聚类行为,而且有利于扩大平衡态聚类的吸引域,表明细胞分化可能与系统规模有密切关系;细胞数目的增加还可以极大地丰富平衡态聚类和振动聚类的表现形式和共存方式,为生物体对环境的适应性提供了良好的基础.我们的结果不仅扩充了耦合系统的动力学行为,也为理解多细胞现象奠定了基础.
- 易奇志杜焰周天寿
- 关键词：耦合振子
