福建省卫生厅青年科研基金(2012-1-47)
- 作品数：4 被引量：16H指数：3
- 相关作者：曹春远张彦锋何云陈前进李美华更多>>
- 相关机构：福建医科大学龙岩市疾病预防控制中心福建省龙岩市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：福建省卫生厅青年科研基金更多>>
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- 2011年龙岩市流行株柯萨奇病毒A组16型VPl基因特征分析被引量：5
- 2014年
- 目的分析2011年龙岩市流行的柯萨奇病毒A组16（CVA16）分离株的分子生物学特征。方法对从龙岩市2011年散发的手足口病（HFMD）患者标本中分离CVA16病毒,采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增VPl基因片段全长,并对扩增产物测序。根据VPl基因核苷酸序列与国内外其他CVA16毒株序列构建进化树,并进行核苷酸和氨基酸同源性分析。结果 4株龙岩分离株CVA16核苷酸同源性为99%~100%。比较推导的氨基酸序列,VP1不存在位点差异,氨基酸序列完全相同。对分离株病毒进行VP1核苷酸序列两两差异分析,与国内其他分离株VP1基因序列的一致性为87%~100%。确定4株CVA16病毒均属于B1b基因型。结论引起2011年龙岩市HFMD流行的CVA16病毒均为B1b基因型,与目前国内其他地区流行毒株高度同源。
- 廖亦红陈前进曹春远何云张彦锋李美华郭贞钻
- 关键词：手足口病柯萨奇病毒A组16型
- 2011年龙岩市手足口病例肠道病毒通用引物核酸阳性未分型样本病原分析被引量：3
- 2014年
- 目的了解龙岩市大量判定为其他肠道病毒(EV)感染的手足口病(HFMD)样本的病原组成。方法对龙岩市2011年经Real-time RT-PCR检测判为未分型EV感染的104份HFMD咽拭子样本经RD细胞分离培养后以RT-PCR法检测EV、EV71、CoxA16,对仍不能分型的样本以187/222引物进行扩增,对扩增产物进行纯化回收、克隆、测序,并用Blast程序在线比对判定型别。同时对培养物进行Real-time RT-PCR检测EV、EV71、CoxA16。任一法检出培养物阳性即判为阳性。结果 104份样本中检出EV阳性88份(84.62%),包括29份EV71,4份EV71+CoxA16,3份CoxB5,2份CoxA10,50份仍未能分型。结论 Real-time RT-PCR检测未能分型的HFMD病例中,相当部分(37.18%)还是由EV71所致,临床不应该随意排除该类病例EV71感染的可能,同时还包含CoxB5和CoxA10病毒。
- 王炳发曹春远何云陈前进张彦锋李美华
- 关键词：手足口病
- 龙岩市手足口病病原体柯萨奇B5病毒基因特征分析被引量：5
- 2014年
- 目的了解龙岩市手足口病病原体柯萨奇B5病毒（Coxsackie virus B5,CVB5）VP1区基因特征及变异情况。方法对2011年采自确诊手足口病患者的Real-time RT-PCR法检测肠道病毒通用引物阳性而肠道病毒71型（enterovirus 71,EV 71）和柯萨奇病毒A 16型（Coxsackie virus A 16,CVA16）阴性未分型样品,经RD细胞分离肠道病毒。从培养上清中提取RNA核酸,经RT-PCR法初步鉴定病毒型别。应用187/222引物对扩增病毒株的VP1区,回收产物经克隆、筛选后测序。采用ClustalX、Mega5.0进行核苷酸及氨基酸序列同源性分析和进化树构建。结果 104份未分型样品中分离到3株CVB5。3株CVB5分离株VP1区长度为330-357个核苷酸,编码110-119个氨基酸。3株间的核苷酸同源性为97%-99%,氨基酸同源性为84%-99%。比较推导的氨基酸序列,FJLY2011126h株VP1与另外2株龙岩分离株相比有18个位点差异,核苷酸序列287-288位发生插入突变,第290、291、338、339位发生颠换,与2010年长春株JN695051的同源性最高（核苷酸同源性95%-98%,氨基酸同源性84%-99%）。结论 2011年福建省龙岩市手足口病患者中存在CVB5感染,病毒与2005年法国株和国内山东、长春、昆明、浙江病毒株属同一型别。
- 廖琳虹何云陈前进曹春远吴水新张彦锋何春荣
- 关键词：手足口病
