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CTAB法提取野野村菌基因组DNA被引量：13: 2010年; 针对用常规方法难以提取野野村菌基因组DNA的问题,通过选用添加甘氨酸的不同培养基和不同培养时间获得的菌丝体,采用液氮研磨结合CTAB法提取野野村菌DNA,电泳检测及计算OD260/OD280值。结果表明,在添加0.3%甘氨酸的麦芽汁-酵母膏(YE)培养基中振荡培养培养3d的菌丝体适合于DNA提取,用CTAB法获得的基因组DNA,长度约为20kb,且OD260/OD280在1.8左右,达到基因组DNA-DNA杂交的要求。; 王凡洪葵; 关键词：DNA提取 CTAB法

耐热小双孢菌212030的初步鉴定及抗菌活性评价被引量：1: 2009年; 采用腐殖酸培养基,从海南文昌红树林中海芒果的根际土壤分离得到一株小双孢菌212030。该菌株在45℃下的生长速度比在28℃的生长速度要快,属兼性嗜热菌。菌株212030的耐盐度为0～5%,不添加NaCl的时候生长最佳。通过16S rDNA基因序列分析,菌株212030与Microbispora amethystogene JCM 3021T的相似率最高,为98.9%。菌株212030发酵液对聚团肠杆菌、金黄色葡萄球菌和耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌均有抑制作用。; 徐小雄林海鹏庄令洪葵; 关键词：抗菌活性

高效液相色谱法测定红树林放线菌DNA的(G+C)mol%含量被引量：1: 2009年; 应用高效液相色谱法测定了放线菌的(G+C)mol%,并就有关分析条件和DNA水解条件进行了优化选择。以Escherichia.coli DH5α作为标准菌株,实验室分离鉴定的8株红树林放线菌作为待测菌株,采用流动相为20mmol/LKH_2PO_4缓冲液(pH 5.6):甲醇(体积比90:10),检测波长为260 nm,流速为1 ml/min,柱温为35℃,分析时间15 min对4种碱基进行分离。结果表明:标准碱基溶液的pH值、流动相的组成和pH值是影响各碱基色谱峰分离和峰形的主要因素。在优化选择的条件下测定,DNA碱基分离效果好,无杂峰干扰,以峰面积计算得到标准菌株Escherichia coli DH5α的(G+C)mol%为54.9694%与已经报道的差异不显著;待测菌株的(G+C)mol%均在菌株所在科或属下的(G+C)mol%范围内;采用酸水解放线菌的DNA可缩短鉴定时间,步骤简明。实验结果充分显示高效液相色谱法测定放线菌(G+C)mol%快速、准确、结果稳定,是放线菌分类鉴定的一种可靠方法。; 曲直洪葵; 关键词：高效液相色谱

深海链霉菌选择性分离及活性菌株16S rRNA聚类分析被引量：3: 2009年; 选择性分离深海链霉菌,检测其抗肿瘤细胞,抗金黄色葡萄球(Staphylococcus aureus ATCC 51650),抗PTP1B和抗caspase-3活性,对活性菌株做165 rRNA聚类分析。用8种选择性培养基分离培养,检测活性和构建活性菌株16S rRNA聚类分析图。共分离到90株链霉菌,其中在RH培养基上分离到的菌株数量和类群最多,占38.9%,次之为GS1和OA培养基,而M5培养基未分离到菌株;共筛选到活性菌株44株,有抗肿瘤活性14株,抗金黄色葡萄球菌22株,抗PTP1B活性19株和抗caspase-3活性2株,其中16株至少有两种活性;16S rRNA聚类分析结果表明44株活性菌株分布在4个clade,分别是S.coelicolor,S.pactum,S.stramineus和S.restomycificus clade,以S.coelicolor和S.restomycificus clade为主,分别占66.0%和11.1%。在常温,常压下可分离培养到大量高活性和活性多相样性的深海键霉菌,RH培养基最适用于分离深海链霉菌。; 庄令庄令谢睛宜林海鹏洪葵; 关键词：活性筛选 RRNA

24株深海链霉菌耐(嗜)盐性及抗MRSA活性的初步研究被引量：1: 2009年; 对24深海链霉菌的耐(嗜)盐性及抗MRSA活性筛选,结果显示,耐NaCl盐浓度在10%以上的有23株,中等嗜盐菌2株,16株具有抗MRSA活性,占66.7%。表明深海链霉普遍能耐受10%以上的NaCl浓度,而且大多在高盐浓度下代谢抗MRSA活性物质。; 庄令庄令洪葵; 关键词：抗MRSA

微生物资源的生物勘探被引量：3: 2010年; 从传统资源研究方法和"meta-技术"两方面阐述了微生物勘探的必要性,介绍微生物勘探的主要内容与研究方法,讨论微生物勘探对微生物资源研究的意义与价值及其发展趋势。; 谢晴宜洪葵; 关键词：未培养微生物微生物资源

从红树植物根际土壤选择性分离小双孢菌被引量：11: 2009年; 从海南文昌采集23种红树植物的根际土壤,采用GA、HV作为选择性分离培养基,添加复合维生素、放线菌酮、制霉菌素和重铬酸钾,结合适当的预处理:干热120°C60min或干热100°C60min及1%氯胺-T处理30min,平板稀释涂布法(10-1、10-2、10-3)分离其中的小双孢菌。共分离得到199株放线菌,通过培养特征及显微形态观察,发现其中有链霉菌147株、非链霉菌52株。选择7株链霉菌和28株非链霉菌进行了16SrRNA基因序列分析,结果显示19株菌属于小双孢菌属,7株属于链霉菌属,4株属于野野村菌属,2株属于小单孢菌属,1株属于链孢囊菌属,1株属于阿萨诺氏菌属,1株属于小单孢菌科。结果表明红树林根际土壤中蕴含着丰富的小双孢菌资源。; 徐小雄林海鹏阮继生洪葵; 关键词：红树植物根际土壤

高效液相色谱和气相色谱在放线菌分类鉴定中的应用被引量：4: 2009年; 随着新菌株不断被分离及已有的大量菌株,快速、准确的分类鉴定及高效排重对微生物资源开发日益重要,而快速发展的色谱技术使之逐渐成为可能。以标准菌株和标准品优化了色谱技术中的高效液相色谱(HPLC)和气相色谱(GC)在放线菌的DNA(G+C)mol%、甲基萘醌和脂肪酸中的鉴定方法及测定参数。优化的色谱鉴定方法不但有利于各个指征的分析更快,更精确,也有利于高效排重,甚至也可检验已有的分类鉴定是否正确而纠正错误属、种的划分。; 曲直阮继生洪葵; 关键词：化学分类高效液相色谱甲基萘醌

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国家高技术研究发展计划(2007AA09Z415)