国家高技术研究发展计划(2007AA09Z423)
- 作品数：4 被引量：31H指数：2
- 相关作者：桂建芳张义兵胡英杰吴健平李佼更多>>
- 相关机构：中国科学院华东师范大学更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学自动化与计算机技术生物学更多>>
- 病毒感染草鱼胸腺的EST分析和免疫相关基因的鉴定被引量：2
- 2009年
- 以感染草鱼(Ctenopharyngodon idellus)出血病病毒(GCHV)的草鱼胸腺为材料,构建了草鱼胸腺的SMARTcDNA文库。筛选文库获得到1933条有效EST序列。BLASTX分析显示,583条序列在公共数据库中能找到同源基因(E-value≤1.00E10-3,Identities≥30%),另外1350条序列则找不到显著同源性。已知基因按具体功能可划分为6类,大部分与细胞内的各种生理过程、细胞结构以及免疫防御相关。研究结果从分子水平上表明鱼类的胸腺在机体感染病毒的免疫反应中发挥重要作用,同时也表明胸腺组织在病毒感染后可能表达很多目前还不清楚功能的新基因。
- 李洋洋张义兵桂建芳
- 关键词：草鱼胸腺CDNA文库EST免疫相关基因
- 斑马鱼一个IFIT家族基因的鉴定及启动子分析被引量：4
- 2012年
- IFIT家族由一类受干扰素诱导表达并具有TPR结构域的蛋白组成,但是在鱼类关于IFIT基因的研究还很少。研究利用哺乳类IFIT家族基因IFI56的序列搜索斑马鱼基因组数据库鉴定出一个未知基因,该基因具有哺乳类IFIT家族保守的基因组结构,编码蛋白具有保守的TPR结构域,暂命名为IFIT-A。RT-PCR分析表明,Poly I:C能够诱导IFIT-A基因转录水平上调。与哺乳类IFIT家族基因相似,斑马鱼IFIT-A启动子存在ISG基因特有的典型ISRE结构域。荧光素酶活性实验揭示Poly I:C和重组IFN蛋白能激活斑马鱼IFIT-A启动子活性。此外,过量表达IFN调控因子IRF3和IRF7能诱导斑马鱼IFIT-A启动子活性。实验结果证明IFIT-A基因是斑马鱼IFIT家族成员,IRF3和IRF7在其诱导表中具有重要调控作用。
- 刘颖张义兵刘庭凯桂建芳
- 关键词：斑马鱼干扰素启动子
- 鲫Nub1基因的克隆及特征分析被引量：2
- 2010年
- Nub1(NEDD8 Ultimate Buster-1)是近年来发现的一种干扰素诱导表达基因,过量表达该基因能抑制细胞生长。研究通过RACE-PCR方法从产生干扰素的鲫囊胚培养细胞(Carassius auratus blastulae embryonic cells,CAB)中克隆出鲫Nub1基因。鲫Nub1全长cDNA为2298bp,编码一个由589个氨基酸残基组成的蛋白。推导的鲫NUB1蛋白具有哺乳类同源蛋白保守的结构域,包括N端的UBL结构域和C端两个UBA结构域,与已知的哺乳类包括人和小鼠、鸟类和两栖类的同源蛋白具有41%—45%的相似性。诱导表达分析显示PolyI:C和LPS均能诱导CAB细胞Nub1mRNA的上调,表明Nub1基因在鱼类的抗病免疫反应中发挥某种重要作用。
- 甘力张义兵孙钒桂建芳
- 基于TerraExplorer Pro的三维城市浏览系统开发被引量：23
- 2009年
- 信息技术的发展大大推动了传统的二维地理信息系统的研究成果向三维空间的拓展,三维城市浏览系统作为城市三维地理信息系统的重要组成部分,基于三维可视化和地理信息系统等技术实现城市的三维浏览。TerraExplorer Pro是Skyline软件中的一个组件,具有快速显示三维海量数据的优势。利用TerraExplorer Pro在三维显示、浏览及开发等方面的优势,探究构建城市三维浏览系统的方法,并基于TerraExplorer Pro二次开发三维城市浏览系统,旨在为城市三维地理信息系统搭建初步显示平台。
- 李佼吴健平胡英杰
- 关键词：三维可视化浏览系统
