国家高技术研究发展计划(2007AA09Z443)
- 作品数：2 被引量：12H指数：2
- 相关作者：张立新裴刚刘向阳代焕琴任彪更多>>
- 相关机构：中国科学院中国科学院研究生院更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划中国科学院知识创新工程重要方向项目国际科技合作与交流专项项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 构建高质量微生物天然产物库研究策略被引量：4
- 2008年
- 微生物次级代谢产物历来是天然药物的重要来源,过去曾被称为"生物沙漠"的海洋,由于从中分离到大量新的微生物、基因及生物活性化合物,被重新认识逆转而成为一种"生物多样化的热带雨林"。构建一个高质量微生物库及其天然产物库是保证药物和其他筛选成功的前提和关键。但如何高效建立高质量微生物天然产物库仍面临很多瓶颈问题。我们拟从:(1)扩大可培养微生物的多样性及去重复化;(2)扩大基因资源多样性及去重复化;(3)扩大微生物次级代谢产物多样性及去重复化;(4)寻找崭新次级代谢产物的新技术新方法,特别是针对多靶位药物的高通量互动筛选方面提出应对的研究策略。利用上述化学微生物学策略分离生物活性化合物不仅在生物技术和制药学应用中显现重要性,也增加了我们对微生物的多样性、生态系统功能和应用生物学的理解。
- 边疆宋福行张立新
- 关键词：宏基因组技术
- 基于活性和基因从海洋微生物中筛选烯二炔类抗生素被引量：8
- 2010年
- 【目的】高质量的海洋微生物菌种库及其天然产物库是新药开发的重要来源。在本研究中我们通过筛选新的烯二炔类抗生素来对已经构建的海洋微生物天然产物库进行质量评价。【方法】首先我们根据烯二炔类抗生素能引起DNA断裂的活性构建了活性筛选模型,并对我们的天然产物库进行筛选;其次根据合成烯二炔核心结构的独特且保守的重复I型聚酮合成酶设计了引物,通过PCR扩增的方法对海洋微生物库进行序列筛选。【结果】通过活性筛选从我们的海洋微生物天然产物库中获得一个阳性的发酵产物。对该阳性菌(LS481)的系统发育学分析表明该菌属于能产生烯二炔类化合物—Dynemicin的Micromonospora chersina,对其发酵产物TLC分析证明该菌确实产生Dynemicin类化合物。通过基因筛选得到了2个具备合成烯二炔核心结构聚酮合成酶的菌株,16S rRNA基因分析显示其中一个很可能为灰色链霉菌(MS098),另外一株菌则同Streptomyces vinaceus NBRC 13425T和Streptomyces cirratus NRRLB-3250T最相近。【结论】我们的活性筛选模型能够有效获得烯二炔类物质,结合基因筛选能够进一步获得可能产生烯二炔物质的菌株。初筛结果也再一次验证了我们海洋微生物天然产物库的质量较好。
- 裴刚代焕琴任彪刘向阳张立新
- 关键词：高通量筛选
