国家自然科学基金(30471238) 作品数:33 被引量:350 H指数:12 相关作者: 陈宏 雷初朝 蓝贤勇 蔡欣 刘波 更多>> 相关机构: 西北农林科技大学 徐州师范大学 贵州省农业厅 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 河南省杰出人才创新基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
航天诱变对烤烟大田期SOD活性的影响 被引量:2 2008年 对湘烟1号航天诱变材料大田期的变异株进行了SOD活性测定,并对结果进行分析,结果表明:在大田期的30、45、60、75d,3个变异株的SOD活性均比对照高;变异株大田期的SOD活性变化呈现出由低到高,在60d达顶峰,然后逐渐回落的趋势。 贺鹏 朱列书 钟波关键词:烤烟 航天诱变 SOD活性 黄牛HESX1基因多态性及其与生长性状的关联分析 SX1(homeobox expressed in ES cells)是成对转录因子,参与胚胎早期发育。HESX1对调控垂体前叶激素(GH、ACTH、FSH、LH等)的分泌至关重要,同时也对垂体后叶的生成有一定的调控作用... 赖新生 陈宏 蓝贤勇 王鑫磊 王柯忆 雷初朝 王居强关键词:生长性状 延边牛线粒体DNA D-loop序列多态性研究 被引量:7 2005年 对4头延边牛个体与GenBank中4头朝鲜牛个体的线粒体DNA(mtDNA)D环(D-loop区)910bp全序列进行了比较分析。结果发现,8头黄牛个体mtDNAD-loop序列由8种单倍型组成,单倍型比例为100%,表明2个黄牛品种mtDNA遗传多态性很丰富;在4头延边牛D-loop区序列中,共检测到核苷酸多态位点17个,核苷酸变异率为1.87%;在4头朝鲜牛中共检测到核苷酸多态位点10个,核苷酸变异率为1.10%;延边牛和朝鲜牛mtDNAD-loop全序列突变类型均为转换、颠换和插入/缺失,其中以转换为主;序列分析显示朝鲜牛与延边牛的同源性很高,达98.90%~99.67%,表明朝鲜牛和延边牛亲缘关系很近。 王朝锋 陈宏 雷初朝 孙维斌 党瑞华 张志清关键词:延边牛 MTDNA D-LOOP 单倍型 云南昭通黄牛mtDNA D-loop区遗传变异分析 被引量:8 2007年 为检测云南昭通黄牛的遗传多样性,测定并分析了云南昭通黄牛线粒体D—loop区段全序列。结果显示,D—loop序列四种碱基A、T、C、G的频率分别是:32.9%、28.6%、24.8%和13.6%;共检测到48个变异位点,平均核苷酸差异(k)为22.762,核苷酸多样度(π)为2.504%,存在6个单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.952±0.096,显示出极高的遗传多样性。检索了与昭通黄牛地理分布相近的8个黄牛品种的D—loop序列资料,统计分析发现,9个黄牛品种间的遗传距离在0.0000~0.0376之间,昭通与其他黄牛品种的遗传距离最远,提示云南黄牛有着特殊的起源地位。 周艳 陈宏 贾善刚 房兴堂从Cyt b基因全序列分析中国10个黄牛品种的系统进化关系 被引量:27 2006年 基于Cyt b基因全长序列,对我国10个地方黄牛品种的遗传多态性和系统发育关系进行了分析.中国黄牛Cyt b基因序列富含碱基A和T,A+T平均含量为56.7%,密码子第3位点核苷酸表现出较强的碱基组成偏倚,该位点上G的含量最低,为3.5%,而A的含量最高,为44.6%,核苷酸组成偏差指数为0.45.在47个个体1 140 bp的序列中检测到30个变异位点,约占核苷酸总数的2.63%,密码子第3位点的突变率(76.7%)远高于第1位点(16.7%)和第2位点(6.6%),第2位点的非同义替代率(100%)远高于第1位点(40%)和第3位点(4.3%).定义了15种单倍型.将10个品种作为一个大的种群分析时,发现中国黄牛Cyt b基因具有较高的单倍型多样性(Hd=0.783±0.046)和一定程度的核苷酸多样性(Pi=0.00828±0.00030),这与中国黄牛地理分布广、种群庞大和起源复杂有关系.基于Kimura 2-parameter距离采用UPGMA法构建的10个黄牛品种分子系统树中将47个个体分别与瘤牛和普通牛聚在一起,说明中国黄牛主要起源于瘤牛和普通牛.北方牛受普通牛的影响较大,南方牛受瘤牛的影响较大,但是对于亲缘关系复杂的中原地区黄牛而言,瘤牛和普通牛对它们的影响力大小因品种而异,因而它们分别和北方牛和南方牛之间的亲缘关系远近程度也存在差异.不同品种之间的亲缘关系差异可能与它们的地理分布差异具有一定的关系. 蔡欣 陈宏 雷初朝 王珊 张志清 薛恺 王新庄关键词:黄牛 CYT B基因 遗传多态性 系统进化 中国黄牛mtDNA D-loop遗传多样性及起源 被引量:14 2007年 Complete mitochondrial D-loop sequences of 140 samples obtained from 15 Chinese local cattle breeds were analyzed.The result showed 67 different haplotypes with 113 polymorphic sites.The haplotype diversity and nucleotide diversity were 0.608-1.000 and 0.002-0.028,respectively,indicating abundant genetic diversity in Chinese cattle.The constructed Neighbor-Joining(NJ) tree revealed that there were two maternal origins of Bos taurus and Bos indicus in Chinese cattle.Among them,the Bos taurus lineage had rich mtDNA genetic diversity,while Bos indicus lineage had poor mtDNA genetic diversity,respectively.It can be concluded that the cattle in Northern China originated from the Bos taurus lineage,while the cattle in Central China and Southern China originated from Bos taurus and Bos indicus lineages.In our study,two mtDNA haplotypes belonging to African cattle were detected,thus providing molecular evidence for an African lineage in Chinese cattle. 房兴堂 周艳 陈宏 蔡欣 方南洙关键词:中国黄牛 MTDNA D-LOOP 单倍型 中国3个牛种cyt b基因多态性及其系统发育研究 被引量:15 2007年 基于mtDNA cyt b基因全长序列,对中国黄牛、牦牛和水牛的遗传多态性和系统发育关系进行了分析。结果表明,中国黄牛、牦牛和水牛cyt b基因序列中碱基A和T的含量均比较高,A+T的平均含量分别为56.6%,58.2%和56.0%。黄牛在cyt b基因全长序列具有较丰富的核苷酸多样性(Pi=0.016 84),水牛的核苷酸多样性相对贫乏(Pi=0.003 51),牦牛的核苷酸多样性介于二者之间(Pi=0.012 28)。中国黄牛与牦牛和欧洲野牛之间的亲缘关系相对较近,而与水牛间的亲缘关系则相对较远,黄牛有普通牛和瘤牛2个母系起源;中国牦牛和斑腾牛以及羯牛的亲缘关系相对较近;中国水牛和沼泽型水牛具有较近的亲缘关系,也可能有2个或者2个以上的母系起源。 蔡欣 陈宏 雷初朝 胡沈荣 苏利红关键词:中国黄牛 中国牦牛 中国水牛 CYT 贵州威宁黄牛线粒体DNA D-loop区全序列分析 被引量:8 2005年 为了解贵州威宁黄牛的遗传多样性及遗传背景,测定了19个个体的线粒体DNAD-loop区全序列。威宁黄牛D-loop区全序列中,A+T平均含量为61.4%,G+C含量为38.6%。经比对,共检测到威宁黄牛D-loop区8种单倍型,核苷酸多态位点45个,其中7种为普通牛血统的单倍型,1种为瘤牛血统的单倍型,表明威宁黄牛同时受到普通牛和瘤牛的影响。在威宁黄牛19个个体中,其单倍型多样度为0.715,核苷酸歧异度(π值)为2.415%,表明威宁黄牛品种的遗传多样性丰富。 刘若余 杨公社 夏先林 刘培琼 张明忠 雷初朝关键词:威宁黄牛 线粒体DNA D-LOOP 单倍型 POU1F1基因的遗传变异对南阳牛生长发育性状的影响(英文) 被引量:12 2006年 利用PCR-RFLP技术首次研究了南阳牛群体100个个体POU1F1基因多态性及其与体重、体尺等生长性状指标之间的相关性。结果表明,南阳牛群体POU1F1基因座的451 bp的PCR产物被限制性酶HinfⅠ消化后表现多态性,它们的等位基因A/B频率为:0.465/0.535,且处于Hardy-Weinberg平衡状态。同时,南阳牛群体POU1F1-HinfⅠ基因座不同基因型与体重、体尺等生长性状指标相关分析的结果表明:南阳牛群体内BB与AB基因型个体在初生重、断奶前平均日增重、六月龄体重、体斜长和胸围以及十二月龄的体重、体高、体斜长和胸围指标上有显著差异,且BB>AB(P<0.05);群体内BB型个体在十二月龄体重指标上显著高于群体的AA型个体,即BB>AA(P<0.05),在其他各年龄段的各项体重和体尺指标上同样呈现出B等位基因高于A等位基因的一种趋势。初步认为BB基因型为优势基因型,相应地B为优势等位基因,对选择有正向效应,提示POU1F1基因的B等位基因可能与高生长发育性状有关。 薛恺 陈宏 王珊 蔡欣 刘波 张存芳 雷初朝 王新庄 王轶敏 牛晖关键词:南阳牛 PCR-RFLP POU1F1基因 多态性 生长发育性状 蒙古驴微卫星多态性分析 被引量:4 2008年 利用10对微卫星引物对94头蒙古驴进行DNA多态性分析,主要研究了有效等位基因数、多态信息含量和杂合度等指标。结果表明:10个微卫星位点中,HTG7、HTG10、AHT4、HTG6、HMS6、HMS3共6个位点具有高度多态性(PIC>0.5),HMS7位点具有中度多态性,其等位基因数、有效等位基因数、多态信息含量、杂合度最低。其余3个微卫星座位(HMS1,HTG4和HMS5)为单态,没有多态性。总体上看,蒙古驴的遗传多态性很高,有利于遗传资源的开发与利用。 蒋永青 郑惠玲 雷初朝 党瑞华 卢长吉关键词:微卫星 多态性