自1992年大菱鲆（Scophthalmus maximus L.）被引入中国以来,在海水鱼类工厂化养殖领域取得了重大成效[1]。近年来,引进的大菱鲆在中国种质退化现象较为严重[2]。调研表明,在2000~2001年大菱鲆苗种经10个月的养成有30%可达到上市规格,现在养成10个月能达到上市规格的不到10%,
在相同的养殖条件下，选取英国、法国、丹麦和挪威4个不同群体的大菱鲆Scophthalmus maximus L．，进行了1年生长性能的比较。结果表明，在3、6、9和12月龄，群体间体长和体重的差异均较大，在每一个生长时期各群体体长和体重的差异排序相同。4个群体的大菱鲆体长以线性速度生长，体重以指数形式生长。综合0～3月龄、0～12月龄的绝对增重率和3～6、6～9、9～12月龄的绝对增重率和瞬时增重率，在生长速度上依次为法国、英国、丹麦和挪威群体，在生长差异上丹麦和挪威及英国和法国之间的差异较小，丹麦、挪威和英国、法国之间的差异较大。大菱鲆各群体在3、6、9和12月龄的体重变异系数分别为22．84％～33．48％、21．36％～30．30％、19．64％～26．97％和21．06％～35．07％，认为这4个群体的大菱鲆均可作为选育的基础群体。
采用微卫星分子标记(SSR)技术分析大菱鲆(Scophthalmus maximus L.)耐高温相关特性,为耐高温大菱鲆的分子辅助育种提供合适的分子标记。将大菱鲆经过高温实验处理,区分为耐高温组与高温敏感组,用于实验分析。采用Salah.M法抽提大菱鲆肌肉组织的DNA,根据已知的30个大菱鲆微卫星位点的侧翼保守序列设计引物,进行微卫星引物PCR(SSR-PCR)扩增。对PCR扩增出的差异条带进行个体统计,最后进行微卫星位点与耐高温性状的相关性分析。结果表明,有1个微卫星位点与大菱鲆耐高温性状存在一定的负相关性;有3个微卫星位点与大菱鲆耐高温性状存在正相关性,其中位点Sma-USC27 286 bp的等位基因片段与耐高温性状的正相关性极显著,相关系数达到0.383(P<0.01),其余2个位点为一般显著性相关。微卫星位点Sma-USC27所扩增出的差异等位基因片段可作为分子标记指导耐高温大菱鲆的辅助育种。
利用12对微卫星分子标记对大菱鲆Scophthalmus maximus 4个引进地理群体进行遗传多样性分析。结果表明,等位基因数（A）为2~10个,平均等位基因数为4.3,有效等位基因数（Ne）为1.6~6.1,平均有效等位基因数为2.7,各位点的杂合度观测值（Ho）为0.0000~0.5625,杂合度期望值（He）为0.3823~0.8416。各群体之间无偏倚杂合度期望值由小到大依次为丹麦群体、英国群体、法国群体、挪威群体,运用SPSS软件对无偏倚杂合度期望值进行Kruskal-Wallis检验,其结果（H=4.438,df=3,P=0.218）表明,4个群体的遗传多样性差异不显著。群体间平均遗传分化指数（Fst）为0.1117,各群体之间存在中度遗传分化。用UPGMA法进行聚类分析,4个群体聚为两类,挪威群体和丹麦群体聚为一类,法国群体和英国群体聚为一类。结合Hardy-Weinberg平衡和遗传偏离指数（d）,4个群体都不同程度的偏离平衡。4个群体具有一定的遗传分化、较好的遗传多样性,适合作为大规模家系选育的基础群体。
