安徽高校省级自然科学研究基金(KJ2008A089)
- 作品数：8 被引量：37H指数：4
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- 相关领域：农业科学生物学文化科学更多>>
- 利用SSR分子标记鉴定“梅桥”大豆种质纯度被引量：5
- 2010年
- "梅桥"大豆是安徽省淮北地区农家菜用大豆品种,长年的连续种植导致纯度比较混杂,产量明显下降,利用SSR分子标记技术对92单株"梅桥"大豆种质纯度进行鉴定,以期为梅桥大豆的提纯复壮提供理论依据。结果表明:采用改良的CTAB方法,可以提取高质量的大豆基因组DNA;在优化SSR-PCR反应体系的基础上,筛选出8对SSR引物,平均每个引物得到条带数10.6个,条带的多态性频率为70.9%,梅桥大豆的种质纯度为38.04%。
- 盛新颖詹少华樊洪泓蔡永萍林毅
- 关键词：SSR标记大豆DNA提取
- 利用VBA查找核酸数据库DNA保守序列被引量：2
- 2011年
- 采用VBA编写了查找核酸数据库保守序列的四个相关程序,"导入DNA序列"程序可以将Fasta格式的DNA序列文本文件存放到Excel Sheet1的A列中,保留每个序列的Gi号,删除多余的注释部分;"整理DNA序列"程序可以将DNA序列Gi号存放到A列中,B列为对应Gi号的完整序列;"DNA随机序列"程序可以产生DNA随机序列;"发现DNA保守序列"程序可以将随机序列与下载的DNA序列比对,查找每一种随机序列的出现频率。以大豆基因组序列为实例,说明了这些程序的应用方法。该程序弥补了流行序列比对软件的不足,为PCR设计引物、分析基因功能以及种质资源鉴定等方面提供新的工具。
- 詹少华尹艺林蔡永萍樊洪泓林毅
- 关键词：VBA保守序列大豆
- 大豆EST序列长度与SSR特性的关系被引量：13
- 2009年
- 为了分析大豆EST-SSR的特征和比较其不同长度EST序列中的SSR特性,从NCBI下载了大豆EST序列,应用SSRIT搜索SSR,分析了20183个无冗余的EST序列,发现了1747个EST序列(8.66%)含有SSR,长度超过400bp的EST序列含SSR的比例为10.05%,而长度在400bp以下的EST序列SSR的比例为4.74%。二核苷酸和三核苷酸SSR是大豆EST-SSR的主要类型,分别的60.45%和37.04%,最常见的SSR基元是:AT、AG、AAT、AC、AAG、ACG。在1798个EST-SSR中,51.45%的长度大于12bp,13.35%长度大于20bp。推断NCBI大豆EST数据库中含有123527个SSR,大豆EST-SSR可用于大豆分子标记,具有重要的开发价值,为有针对性设计EST-SSR引物奠定基础。
- 詹少华盛新颖樊洪泓蔡永萍林毅
- 关键词：大豆表达序列标签
- 大豆基因组DNA提取纯化方法研究被引量：8
- 2008年
- [目的]通过逐步富集的方法，提高大豆DNA的纯度和质量，为其他动植物基因组DNA的提取纯化提供参考。[方法]以梅桥大豆为试验材料，在CTAB法提取大豆基因组DNA的基础上，对大豆基因组DNA进行了纯化，对纯化后的DNA进行了光密度、紫外光谱、琼脂糖电泳和RAPD—PCR等的检测。[结果]光密度和紫外光谱检测表明A260／A280介于1．678～1．722，平均为1.697，A260／A280介于1．733—2．022，平均为1.844；琼脂糖电泳检测证实DNA分子量较大、完整性好、RNA残留少；RAPD—PCR检测得到了谱带清晰、多态性丰富的电泳谱带。DNA的得率为66．969μg／g。该试验的研究方法具有DNA质量高、操作简便、试验条件要求不高的特点。[结论]该方法可以应用于其它动植物的DNA提取纯化。
- 詹少华尹艺林
- 关键词：大豆基因组DNA纯化随机扩增多态性DNA提取
- Excel平台的EST-SSR分析方法被引量：2
- 2010年
- 科学工作者在分析EST-SSR特性时需要许多手工操作,这是一个耗时而又容易出错的工作。本文介绍了以Excel平台来计算核苷酸数目、计算特定碱基数量和比例、合并SSR重复基元、筛选基元的重复记录、统计基元的总重复数、计算基元在SSR中最大或最小重复数、截取特定核苷酸序列等方法,这样可以提高分析的效率和准确性,同时对其他DNA或蛋白质序列分析有借鉴作用。
- 詹少华盛新颖蔡永萍樊洪泓林毅
- 关键词：EXCEL表EST-SSREXCEL函数
- 大豆根尖染色体制片实验的教学改革被引量：2
- 2009年
- 以大豆根尖染色体制片实验为例,探索了如何将"探究-研讨"教学模式应用到遗传学实验,同时还介绍了配合该教学模式的三项改进实验技术:垫剃须刀片法压片技术、显微镜监视染色技术、浓盐酸分段解离技术。并对教师如何适应新的教学模式下角色转变和提高自身业务素质等方面提出了建议。
- 詹少华
- 关键词：遗传学实验教学染色体制片大豆
- “探究-研讨”教学模式在高校遗传学实验中的应用被引量：2
- 2009年
- 阐述了"探究-研讨"教学模式的指导思想,举例说明了遗传学实验采用该教学模式的基本步骤:实验材料的准备→创设问题情境、激发探究需求→探究验证科学问题→交流研讨→学生成绩评价。最后我们对现阶段遗传学实验实行"探究-研讨"教学模式提出了若干建议。
- 詹少华樊洪泓林毅
- 关键词：遗传学实验教学
- 大豆二核苷酸SSR侧翼序列保守性分析被引量：4
- 2010年
- 从NCBI下载了大豆的EST和GSS序列,以SSR两侧序列各100 nt的片段作为分析材料,统计SSR数目、计算侧翼序列碱基组成,对SSR侧翼序列进行了序列比对和数据库blast搜索。结果表明:大豆SSR分布频率为1/6.67kb,侧翼序列GC含量为37.83%,二核苷重复是SSR的主要类型(65.7%),同一种重复基元的SSR存在多类型侧翼序列,同一类型的侧翼序列高度保守,不同类型的侧翼序列之间相似性较小,尤其是非SSR区域可以存在与SSR侧翼序列相同的序列。由上述结果推断SSR引物可能扩增出不含SSR的产物,易位可以产生形成新类型SSR。这一分析结果有助于提高SSR引物设计效率和进一步阐明SSR的形成机理。
- 詹少华盛新颖樊洪泓蔡永萍林毅
- 关键词：SSR引物序列保守性二核苷酸大豆侧翼序列NCBI
