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国家自然科学基金(30370809)

作品数:4 被引量:17H指数:2
相关作者:王宏斌王金发刘兵王峰何炎明更多>>
相关机构:中山大学暨南大学国家工程研究中心更多>>
发文基金:国家自然科学基金转基因生物新品种培育专项更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 4篇中文期刊文章

领域

  • 3篇农业科学
  • 1篇生物学

主题

  • 2篇水稻
  • 2篇基因组结构
  • 1篇一步法
  • 1篇水稻细胞
  • 1篇水稻细胞质
  • 1篇水稻线粒体
  • 1篇铜锌
  • 1篇铜锌超氧化物...
  • 1篇铜锌超氧化物...
  • 1篇染色
  • 1篇染色体
  • 1篇重叠群
  • 1篇细胞质
  • 1篇酶基因
  • 1篇克隆
  • 1篇克隆分析
  • 1篇基因
  • 1篇基因注释
  • 1篇PCR
  • 1篇RNA_IN...

机构

  • 4篇中山大学
  • 1篇暨南大学
  • 1篇国家工程研究...

作者

  • 4篇王金发
  • 4篇王宏斌
  • 3篇刘兵
  • 2篇王峰
  • 1篇冯冬茹
  • 1篇黄璐圆
  • 1篇戚康标
  • 1篇黎茵
  • 1篇张党权
  • 1篇何炎明
  • 1篇仲健

传媒

  • 2篇热带亚热带植...
  • 1篇Journa...
  • 1篇中山大学学报...

年份

  • 2篇2007
  • 1篇2006
  • 1篇2005
4 条 记 录,以下是 1-4
排序方式:
水稻细胞质铜锌超氧化物歧化酶基因的序列和表达分析被引量:15
2007年
以水稻(Oryza sativa)品种Cpslo17幼穗为材料,通过RT-PCR克隆了长度为698bp的编码水稻细胞质铜锌超氧化物歧化酶基因(OsCu/Zn-SOD)。序列分析表明其覆盖基因完整编码框,编码由152个氨基酸组成的蛋白,它与玉米(Zea maize)Cu/Zn-SOD基因序列的相似率为88%。TargetP和ChloroP预测编码蛋白N端无信号肽序列,且此编码区段有8个外显子和7个内含子。利用Swiss-Model站点预测OsCu/Zn-SOD三维结构,并分析其铜锌离子结合位点的结构。RT-PCR结果表明OsCu/Zn-SOD在水稻不同品种均有表达,但表达量存在差异,OsCu/Zn-SOD在Cpslo17的分裂旺盛的幼嫩组织如幼穗、开花期花序和未成熟种子中表达量较高,而在叶片中表达量相对较低,在愈伤组织中表达微弱。
王峰王宏斌王金发
关键词:水稻铜锌超氧化物歧化酶基因组结构RT-PCR
一步法RT-PCR克隆水稻线粒体磷转运蛋白基因及其序列特征分析
2005年
以水稻广亲和品种Cpslo17幼穗为材料,用一步法RT-PCR(逆转录聚合酶链式反应)克隆了一个长度为1118bp的编码线粒体磷转运蛋白的OsMPT基因。序列分析表明其包含了基因完整的编码序列,编码由368个氨基酸组成的线粒体磷转运蛋白,它与玉米、大豆、Lotusjaponicus、Betulapendula、拟南芥的线粒体磷转运蛋白氨基酸序列相似率分别为93.5%,85.6%,83.8%,83.7%,81.1%。氨基酸疏水谱分析显示它有线粒体磷转运蛋白家族高度保守的6个跨膜结构域。水稻线粒体磷转运蛋白N端富含精氨酸(Arginine)、丙氨酸(Alanine)和丝氨酸(Serine)。iPSORT预测其蛋白N端具有定位于线粒体的信号肽序列,进一步分析表明此编码区段有6个外显子和5个内含子。RT-PCR结果表明,OsMPT基因在水稻两个亚种粳稻和籼稻的叶片中均有表达,在Cpslo17营养器官和生殖器官中都有高水平表达。水稻线粒体磷转运蛋白的克隆和表达分析将为研究其结构和生物学功能奠定基础。
王峰黄璐圆王宏斌刘兵王金发
关键词:水稻基因组结构
水稻第6染色体S5区重叠群构建、基因注释与OS-APH的克隆分析被引量:2
2006年
以通过图位克隆所获得的Cosm id克隆R2 I19序列信息为基础,构建了一个长为586 kb的粳稻第6染色体S5座位的BAC重叠群(JS5-BC)。通过生物信息学方法,对JS5-BC进行了基因注释,确定该区域含有46个基因位点。经功能预测,JS5-BC重叠群中存在3个主要的基因家族,分别是木葡聚糖岩藻糖基转移酶、脂酶和黄素氧化还原酶。JS5-BC中注释基因的一个显著特点是功能相关基因密集存在,如与植物细胞壁的合成代谢相关的3个基因、与呼吸链能量代谢的黄素氧化还原酶的4个基因等都是如此。为了验证基因注释的可靠性,克隆了广亲和品种Cp17品种的OSAPH基因的cDNA,并检测了该基因的表达模式,为注释基因提供了分子证据。
王宏斌刘兵黎茵冯冬茹何炎明戚康标王金发
关键词:SATIVA基因注释重叠群
Rice Repetitive DNA Sequence RRD3:a Plant Promoter and Its Application to RNA Interference
2007年
Previously, a moderately repetitive DNA sequence (RRD3) was cloned from rice (Oryza sativa L.) by DNA renaturation kinetics. Sequence analysis revealed several conserved promoter motifs, including four TATA-boxes and a CAAT-box, and promoter activity was shown in Escherichia coli and mammalian expression systems. Here, we inserted the RRD3 fragment into the plant promoter-capture vector, pCAMBIA1391Z, and examined whether the RRD3 fragment has promoter activity in plants. Transgenic tobacco and rice calli both showed β-glucuronidase (GUS) activity, indicating that RRD3 can act as a promoter in both monocot and dicot plants. Based on the promoter characteristic of RRD3, we designed a plant universal binary vector, pCRiRRD3, which is suitable for performing researches on plant RNA interference. This vector has two multiple cloning sites to facilitate sense and antisense cloning of the target sequence, separated by an intron fragment of 200 bp. The efficiency of the vector for gene silencing was assayed by histochemical and quantitative fluorometric GUS assays in transgenic tobacco. These research results suggested that this plant RNAi vector pCRiRRD3 can effectively perform gene silencing researches on both monocot and dicot plants.
仲健王宏斌张党权刘兵王金发
关键词:PROMOTER
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