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国家自然科学基金(30125030)

作品数:5 被引量:37H指数:3
相关作者:何祖华李群田平芳曹家树李志邈更多>>
相关机构:中国科学院上海生命科学研究院北京化工大学浙江大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金中国科学院知识创新工程更多>>
相关领域:生物学农业科学更多>>

文献类型

  • 5篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 4篇生物学
  • 2篇农业科学

主题

  • 2篇英文
  • 2篇水稻
  • 2篇基因
  • 2篇PATHOG...
  • 2篇SCLERO...
  • 2篇THE_PA...
  • 2篇ARABID...
  • 2篇PHYSIO...
  • 1篇选择性
  • 1篇植物
  • 1篇指纹
  • 1篇指纹分析
  • 1篇水稻资源
  • 1篇突变体
  • 1篇突变体库
  • 1篇拟南芥
  • 1篇转录
  • 1篇转录本
  • 1篇转座
  • 1篇系统进化

机构

  • 3篇中国科学院上...
  • 2篇北京化工大学
  • 1篇复旦大学
  • 1篇浙江大学
  • 1篇浙江省农业科...

作者

  • 3篇何祖华
  • 2篇李群
  • 2篇田平芳
  • 1篇石夏荣
  • 1篇张海扩
  • 1篇王建军
  • 1篇吴刚
  • 1篇卢宝荣
  • 1篇李志邈
  • 1篇曹家树

传媒

  • 2篇植物生理与分...
  • 1篇生物化学与生...
  • 1篇Journa...
  • 1篇Journa...

年份

  • 3篇2006
  • 3篇2005
5 条 记 录,以下是 1-6
排序方式:
受逆境诱导的水稻Rim2/Hipa假基因转录本选择性加尾和剪接(英文)被引量:3
2005年
我们以往的研究证明水稻受病原菌诱导的Rim2/Hipa 因子是水稻基因组所特有的 DNA 转座子超级家族。本实验通过对病原菌诱导的 cDNA文库的筛选和对 EST 数据库的搜索,发现在众多的 Rim2 拷贝中,只有 Rim2-42 因子被表达,其为一个TNP2类转座酶的假基因,其编码区为终止子所打断。序列分析结果表明Rim2转录本被选择性剪接和加尾,而且在两个水稻亚种中的剪接方式有差异,共形成 7 种不同转录本结构,包括一个未知功能的Rim2-XET嵌合转录本,该嵌合转录本为转录通读(read-through)所形成,而 XET 基因是可以被逆境所诱导的。这些结果说明Rim2因子家族可能已失去转座的活性。结果也初步表明Rim2-42 因子插入到了一个 XET 基因启动子的下游,该启动子带动了 Rim2 因子的诱导表达。
石夏荣李群何祖华
关键词:水稻假基因转录本
拟南芥激活标记突变体库的构建及突变体基因的克隆被引量:28
2005年
激活标记(activationtagging)技术是以功能获得突变体为研究对象,在植物功能基因组学的研究中具有重要的作用。文章以双子叶模式植物拟南芥(Arabidopsisthaliana)野生生态型植株为实验材料,以含有激活标记质粒pSKI015的农杆菌直接喷雾进行转化,并以抗除草剂Basta为筛选标记,构建了拟南芥的激活标记突变体库。结果共得到约20000个独立转化株系(T1代),其中38个株系有明显的表型变化,约占转化植株总数的千分之二。基因组DNASouthern杂交结果表明,大多数转化植株为多拷贝T-DNA插入。通过质粒拯救(plasmidrescue)和TAIL-PCR(Thermalasymmetricinterlaced-PCR)可获得T-DNA插入的基因组旁邻序列,为克隆突变体的基因奠定基础。
李志邈张海扩曹家树何祖华
关键词:拟南芥
水稻Rim2/Hipa超级家族的基因组变异和基于Rim2/Hipa展示的水稻资源的系统进化和指纹分析(英文)被引量:2
2006年
水稻Rim2/Hipa是最近鉴定的一个受逆境诱导的转座因子超级家族.研究表明,Rim2的核心序列在不同来源的水稻材料中存在显著的差异,暗示Rim2家族的长期进化历程.基于Rim2因子间的差异性以及该因子的静止状态,开发出一种利用Rim2因子展示的新的分子指纹技术,可以灵敏地区分不同水稻资源以及它们的遗传关系.仅用5对引物就可以清楚地将53个栽培稻和普通野生稻材料鉴定出来,并可将它们分为不同的系统进化组.研究表明不仅在水稻资源而且在野生稻种质间均存在明显的多样性.野生稻可以被单独分组,或者分散在粳稻中间.这种新的指纹技术还可以将水稻的杂交子代和它们的亲本区分出来,并可用于种子纯度的鉴定,在水稻基因组进化研究、水稻育种和种子生产中有很好的应用前景.
田平芳王建军吴刚李群卢宝荣何祖华
关键词:水稻系统树指纹
Physiological and Molecular Features of the Pathosystem Arabidopsis thaliana L.-Sclerotinia sclerotiorum Libert被引量:4
2006年
The fungal pathogen Sclerotinia sclerotiorum Libert causes rot diseases on many crops worldwide and large economic losses occur frequently because of a lack of resistant varieties. The pathogenesis of S. sclerotiorum and the molecular basis of plant responses to the pathogen are poorly understood. In the present investigation, the process of S. sclerotiorum infection in Arabidopsis thaliana L., a plant that is highly susceptible to this fungus, was analysed. In addition, the defense activation in the host was investigated. A convenient inoculation method using millet grain was developed for S. sclerotiorum in Arabidopsis. The fungus rapidly infected the plants, probably through ball- or cushion-like infection structures. Visible symptoms developed within 24 h and plants were killed 72 h after inoculation. Cellulase, the main enzyme that caused host tissues to rot, was secreted by S. sclerotiorum in a pH-dependent manner. Oxalic acid, another pathogenic factor secreted by the fungus, induced necrotic lesions on the leaves, infection with S. sclerotiorum strongly induced the production of the pathogenesis-related (PR) proteins β-1,3-glucanase and chitinase in Arabidopsis. Furthermore, the PR gene PDF. 1 was induced, but not PR1, indicating that the pathogen activated basal defense of jasmonic acid/ethylene dependence, which is consistent with its necrotrophic characteristics. This pathosystem for Arabidopsis-S. sclerotiorum could provide an approach for the analysis of the interactions between S. sclerotiorum and other crops, thereby facilitating genetic manipulation techniques for controlling this pathogen.
Fu-Ming DaiTong XuGerhard A. WolfZu-Hua He
关键词:DEFENSEPATHOGENESIS
Physiological and Molecular Features of the Pathosystem Arabidopsis thaliana L.-Sclerotinia sclerotiorum Libert
The fungal pathogen Sclerotinia sclerotiorum Libert causes rot diseases on many crops worldwide and large econ...
Gerhard A. Wolf
关键词:PATHOGENESIS
植物CACTA转座子的研究进展(英文)被引量:1
2006年
转座子是染色体上可移动的DNA序列,根据转座机制可将其分为:通过RNA中间体进行转座的逆转录座子(Retrotransposon)和通过DNA中间体进行转座的转座子(Transposon)。En/Spm家族转座子是后者中的一类,它的末端反向重复序列(Terminalinvertedrepeats,TIRs)具有保守的5个碱基CACTA,所以通常又称为CACTA转座子。除此之外,其靶位点一般为3bp的同向重复(Targetsiteduplication,TSD);亚末端区域分布着若干正向或反向的重复序列(Subterminrepeat,STR)。迄今为止,CACTA转座子仅发现于植物基因组。过去一直认为由于其相对保守的转座机制而拷贝较少,但最近研究发现,该因子多拷贝存在于某些禾本科植物基因组中。由于该家族在基因组中分布的广泛性,具有用作分子指纹的应用前景。本文就其结构、转座机制和应用前景等做一综述。
田平芳
关键词:转座
共1页<1>
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