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国家重点基础研究发展计划(2006CBS04207)
作品数:
1
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周广恩
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2007
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相同来源HIV-1 Env、Gag基因序列变异和宿主基因多态性与疾病进展关系的分析
被引量:1
2007年
目的探讨HIV—1基因序列变异和宿主基因多态性与疾病进展的关系。方法PCR方法从外周血细胞中扩增HIV—1 Env、Gag区片段和测序,分析序列变异、糖基化,超突变等指标。RFLP法确定宿主基因多态性。结果未治疗组中,env基因区PCR和克隆序列平均离散率分别为0.1和0.06,差异有统计学意义,治疗组内差异没有统计学意义。V3环顶端序列在未治疗和治疗组中均以GPGQ比例最大(61.5%和39%),治疗组出现稀有多肽序列如GPGH、GQGR、GLGR、12位I/V和21位Y/H变异与疾病快速进展相关。Env区段上进展较快速组(RRP)比典型进展组(TP)的糖基化程度高(平均值分别为14.56和13.20个),差异有统计学意义。Env区段上RRP比TP组GA取代百分率和绝对数平均值都高(8.7%/6.9%和10.1/7.6),差异也有统计学意义。TP组中SDF1—3’A和CCR2V62I基因频率均高于RRP组,但差异没有统计学意义。CX3CR1 V249I/M280T与疾病快速进展没有显著相关性。结论V3区序列主要位点的氨基酸变异、Env区段糖基化程度、GA取代与疾病进展相关。SDF1—3’A、CCR2V641和CX3CR1 2491/280M与疾病进展均无显著相关性。
白立石
王开利
周广恩
孟宾
刘颜成
曾毅
关键词:
HIV-1
疾病恶化
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