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紫贻贝EST-SNP的筛选及多态性检测被引量：9: 2011年; 利用EST数据库开发SNP是筛选SNP标记的重要途径。本研究利用EST数据库开发紫贻贝的SNP标记,利用QualitySNP软件对紫贻贝已有的19 709条EST序列中含有4条以上同源序列的重叠群进行分析,在含有4条以上同源序列的963个重叠群中,筛选得到候选SNP位点4 833个,SNP的平均频率为129.1 bp,其中C/T和A/G突变较多,分别占总数的28.8%和27.4%。根据候选SNP位点设计30组引物,通过等位基因特异性PCR结合溶解曲线分析,在30个野生个体中进行基因分型验证,6组引物(20%)没有扩增产物,10组引物(33%)没有多态性,14组(47%)引物具有二等位基因多态性,稀有等位基因的频率为0.083～0.446,观测杂合度和期望杂合度的范围分别为0.166 7～0.615 4和0.155 4～0.503 2。序列比对结果显示,14组引物中的12个SNP位点位于基因编码区,并且全部为同义突变。研究结果表明,EST数据库中存在大量的SNP位点,差异熔解曲线法是一种高效便捷的SNP分型方法,所筛选的SNP标记可用于紫贻贝遗传学分析。; 李宏俊梁瑜邢坤苏浩高祥刚隋立军赫崇波; 关键词：紫贻贝单核苷酸多态性表达序列标签熔解曲线

拉氏池塘苗种培育试验被引量：17: 2014年; 在辽宁凤城和辽宁盘锦分别进行了土池拉氏夏花、1龄秋片苗种培育生产性试验。夏花培育池0.27hm2,轮虫高峰期下塘拉氏水花鱼苗12.1万尾。经30d培育,鱼苗的平均全长达37.90mm,增长5.6倍,平均体质量达0.51g,增长510倍,出塘拉氏夏花7.9万尾,成活率65%。1龄秋片苗种培育试验池塘面积0.19hm2,放养夏花8万尾,平均全长4.5cm,平均体质量0.8g,经110d培育,平均全长达10.46cm,增长2.3倍,平均体质量达17.76g,增长22.2倍,最大个体20g,出塘秋片鱼种76 800万尾,1363.96kg,成活率96%,饵料系数1.6,平均7306.5kg/hm2。; 骆小年李军杨培民金广海刘义新李敬伟蒋湘辉; 关键词：苗种池塘

文蛤肠、外套膜和肝胰脏组织cDNA文库构建及其ESTs序列分析被引量：7: 2010年; 利用SMART cDNA文库构建试剂盒构建了文蛤(Meretrix meretrix)肠、外套膜和肝胰脏组织的cDNA文库。经测定原始文库滴度分别为2.10×106、1.70×106和1.60×106,重组率高于95%,肠组织文库插入片段长度均大于1000bp,外套膜和肝胰脏组织文库的插入片段长度大于1kb的占87.5%,文库质量符合标准要求。随机选取文库的3168个克隆进行5′端测序,获得高质量表达序列标签(Expressed Sequence Tags,ESTs)3029个(肠:1005,外套膜:1019,肝胰脏:1005),测序成功率95.58%。经质量控制和拼接得到1796个单基因簇(Unigene),其中306个叠联群(Contigs),1490个单一序列(Singletons)。通过Blastx搜索比对、查询和注释分析,共得到已知基因696个(肠:216,外套膜:235个;肝胰脏:245个),占总数38.75%。在1796个单基因簇(Unigene)发现微卫星序列55条,这些存在微卫星位点的序列占整个ESTs数据库的3.1%。; 高祥刚李云峰宋文涛王健傅立元刘卫东鲍相渤赫崇波; 关键词：文蛤 CDNA文库表达序列标签

黑龙江泥鳅、北方泥鳅和泥鳅的形态差异分析被引量：17: 2010年; 运用3种多元分析方法,对黑龙江泥鳅MIsgurnus mohoity、北方泥鳅Misgurnus bipartitus和泥鳅Mis-gurnus anguillicaudatus的11个形态参数进行了综合分析。聚类分析结果表明：北方泥鳅和泥鳅聚类,亲缘关系较近,与黑龙江泥鳅群体的亲缘关系较远。主成分分析结果表明：主成分1的总方差贡献率为50.430%,主成分2的为20.880%,主成分3的为10.381%,累积贡献率为81.691%。判别分析结果表明：建立的3种泥鳅的判别函数,判别准确率P1为71.4%~100%,判别准确率P2为71.4%~100%,综合判别率为80.8%。; 李雅娟张明昭于卓庞义猛钱聪荒井克俊; 关键词：泥鳅

虾夷扇贝β-actin基因的克隆和序列分析被引量：1: 2010年; 为进一步研究虾夷扇贝功能基因的表达调控。利用SMART cDNA文库构建试剂盒成功构建了健康虾夷扇贝外套膜和肾脏两种组织的cDNA文库。对随机选取的4009个克隆进行5′端测序,比对,筛选出1条β肌动蛋白同源序列,对此EST序列两端进行扩增、测序,得到肌动蛋白基因cDNA全长序列。肌动蛋白基因cDNA全长1536bp(不包括polyA),5′端非编码区84bp,3′端非翻译区321bp,阅读框1131bp,编码377个氨基酸。在基因组DNA中,该基因被一个内含子分为两段,内含子位于第41和第42个氨基酸之间,长度为1498bp。系统发育分析显示该肌动蛋白属于β类型。本研究得到的虾夷扇贝β-肌动蛋白基因可以被用于作为定量某种虾夷扇贝mRNA的标准,这为继续研究虾夷扇贝其它功能基因,及其分子生物的进一步研究、促进其他相关分子发育和系统进化研究奠定了基础。; 傅立元高祥刚李云峰王健赫崇波; 关键词：虾夷扇贝 CDNA文库 Β-肌动蛋白基因克隆

文蛤金属硫蛋白基因的克隆与分析被引量：6: 2009年; 金属硫蛋白是一种普遍存在于生物体内的低分子量、半胱氨酸含量丰富、易于被外界刺激诱导的金属结合蛋白。采用表达序列标签(EST)法,首次获得了文蛤金属硫蛋白(Mm-MT)的全长cDNA序列,序列全长657bp,开放阅读框长度为231bp,可以编码76个氨基酸。编码的氨基酸中半胱氨酸含量丰富,达27.6%,含有软体动物等无脊椎动物金属硫蛋白的特征序列。序列特征分析表明,该序列具备金属硫蛋白的典型特征,是金属硫蛋白家族成员。; 高祥刚赫崇波李云峰王健朱丹刘卫东鲍相渤; 关键词：文蛤金属硫蛋白基因 EST CDNA文库

拉氏人工繁殖试验被引量：19: 2013年; 在河流及小型水库中收集野生拉氏,网箱或池塘暂养,于2012年在两个试验基地进行了3批次工繁殖试验,共催产亲鱼670组,获卵117万粒,平均催产率77.8%,平均受精率84.67%,平均孵化率64%,获水花55.8万尾,基本摸清拉氏的雌雄鉴别、成熟度鉴别,繁殖时期和温度,催情药物、人工授精、孵化等人工繁殖技术。; 骆小年李军金广海刘义新李敬伟杨培民蒋湘辉; 关键词：人工繁殖孵化鱼苗

文蛤(Meretrix meretrix)cDNA文库的构建及ESTs序列的初步分析: 本研究利用SMART cDNA Library Construction技术,分别构建了文蛤肠、外套膜和肝胰脏组织的cDNA文库。测定结果表明,原始文库滴度分别为2.10×10～6,1.70×10～6和1.60×10～6...; Aimin WangYan WangZhifeng GuSifa LiYaohua ShiXiming Guo李宏俊赫崇波; 关键词：文蛤 CDNA文库表达序列标签免疫基因微卫星标记; 文献传递

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辽宁省科学技术计划项目(2008203001)