国家自然科学基金(30471328)
- 作品数：5 被引量：32H指数：4
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- 相关机构：上海海洋大学上海水产大学更多>>
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- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 海带染色体的DAPI染色及核型初步分析被引量：9
- 2012年
- 鉴于海带染色体比较小且数目存在分歧等原因,利用0.2%秋水仙素对海带配子体及孢子体处理10 h左右,经过卡诺试剂固定、多种酶组合处理及30 cm的高位滴片,可以获得质量比较高的海带染色体;使用灵敏度高、特异性强的DNA荧光染料DAPI进行染色,结果显示,海带雌、雄配子体的染色体各为31条,孢子体染色体为62条,大多为短杆状或者点状;雌配子体染色体的大小为0.78～2.61μm,稍大于雄配子体(大小为0.57～2.17μm)。根据染色体的大小,对海带配子体的染色体核型进行了初步分析。这些结果为分子标记的染色体定位等细胞学研究奠定了技术基础。
- 刘宇毕燕会周志刚
- 关键词：海带DAPI染色体核型孢子体
- 利用SMART技术构建海带配子体cDNA文库被引量：5
- 2006年
- 用Trizol试剂提取海带配子体总RNA，用SMARTcDNA文库构建试剂盒构建cDNA文库。经测定原始文库滴度达到1．1×10^8Pfu／ml，文库有500m体积，库容量为5．5×10^7Pfu，通过PCR检测，文库的重组率达100％，扩增出的片段主要集中在0.8—1.8kb，平均插入片段长度约为1．34kb。这些数据表明，已获得高质量的海带cDNA文库，为海带基因资源保存及新基因的克隆奠定了基础。
- 胡乐琴陆广琴刘士成王丽丽毕燕会周志刚
- 关键词：海带配子体CDNA文库噬菌体
- 海带配子体18S rRNA基因的克隆、序列分析及其作为内参基因的应用被引量：9
- 2009年
- 通过基因克隆和序列测定,获得了海带(Laminaria japonica)配子体的18S rRNA基因序列,其长度为1 716bp,GenBank登录号为EU293553。以蓝藻为外类群,采用邻接法(NJ)对分属9个门的藻类的18S rRNA基因序列进行系统发育分析。结果显示,褐藻门的海带与蓝藻门的念珠藻Nostoc sp.PCC7120、红藻门的日本凋毛藻(Griffithsia japoni-ca)、绿藻门的莱哈衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)遗传距离依次为0.819,0.303和0.219;杂色藻类中,海带与隐藻门的蓝隐藻(Rhodomonas sp.CS24)遗传距离最大为0.201,与黄藻门的Heterosigma carterae遗传距离最近为0.103。提取不同光强条件下海带配子体RNA,利用18S rRNA基因作内参,通过半定量RT-PCR研究海带配子体光捕获蛋白基因lhcf6(Light-harvesting complex containing fucoxanthin)的不同光强条件下的表达量,揭示该基因随着光强增加而增加。
- 毕燕会邹丹燕周志刚
- 关键词：海带RRNA基因
- 海带雄配子体抑制消减cDNA文库的生物信息学分析被引量：7
- 2009年
- 对海带(Laminaria japonica Aresch).雄配子体抑制消减cDNA文库进行生物信息学分析,并通过Northern印迹杂交进一步验证了雄配子体2个优先表达的基因。结果表明,(1)由627个克隆产生的618条高质量cDNA可聚类成187条非冗余序列(NRS);其中93条Contig由524条cDNA拼接而成,剩下的94条为Singleton(只有单条cDNA),冗余率达69.74%。(2)5条NRS因与rRNA基因相匹配而不进行分析;60条NRS与GenBank中注释蛋白基因显著匹配;122条NRS无显著匹配。(3)大部分已知功能的基因与物质和能量代谢(26.7%)、生长发育(13.3%)有关,其中与叶绿体光捕获蛋白复合体有关的基因有106条cDNA,所涉及的有lhcf6基因(62条cDNA)与fcp基因(12条cDNA)等。(4)经Northern印迹杂交证实lhcf6和fcp2个基因在处于营养生长期的雄配子体中优先表达。(5)90条Contig的总G+C含量平均值为52.58%,表明了密码子的使用对G、C有明显的倾向性;20个推测功能蛋白(1520密码子)密码子第三位碱基的使用偏好C(40.7%),其次是G(33.9%);终止密码子的使用偏好TGA(54.5%)。本研究为海带雌、雄配子体差异表达基因克隆、分析和功能基因组学等研究提供了信息。
- 陆广琴欧阳珑玲周志刚
- 关键词：海带配子体抑制消减杂交CDNA
- 杂色藻类褐藻素-叶绿素a/c结合蛋白的研究现状被引量：3
- 2007年
- 褐藻素-叶绿素a/c结合蛋白(FCP)由核基因家族编码,镶嵌在杂色藻类的类囊体膜中,结合褐藻素、叶绿素a和叶绿素c,起着捕获并向两个光反应中心平均分配和传递光能的作用。前体N-末端存在一个信号肽和一个转运肽,成熟FCP具3个α-螺旋跨膜区,分子量在17-22 kDa之间,结合叶绿素a的氨基酸高度保守,但结合褐藻素和叶绿素c的不太保守。fcp基因一般存在一个内含子,其蛋白编码区同源性达80%以上,而5’和3’非翻译区保守性相对较低。fcp基因表达量在红光及相对强光强下一般较高,且可能还存在日周变化。具4个α-螺旋的叶绿素a/b结合蛋白的第4个α-螺旋区缺失可能导致了具3个α-螺旋的FCP的产生。
- 毕燕会周志刚
- 关键词：基因
