中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2009HSYZX-SJ-07)
- 作品数：2 被引量：11H指数：2
- 相关作者：孙效文张晓峰薛仁余周丹杜科更多>>
- 相关机构：大连海洋大学中国水产科学研究院黑龙江水产研究所上海海洋大学更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划中央级公益性科研院所基本科研业务费专项公益性行业(农业)科研专项更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 镜鲤酸性磷酸酶的QTL分析被引量：4
- 2012年
- 利用992个微卫星标记检测了德国镜鲤(Cyprinus carpio)F1代190个个体基因组DNA进行基因型检测,共组成51个连锁群,覆盖基因组总长度为5138.2cM,标记间平均距离为5.19cM;利用软件MapQTL 6.0采用区间作图法对酸性磷酸酶性状进行数量性状基因座(QTL)定位分析。研究结果共检测到9个与酸性磷酸酶有关的QTLs,分布于8个连锁群。其中LG24连锁群LOD值最大(5.37),位于LG24连锁群,最大的可解释表型变异为13.8%。通过BLAST与斑马鱼进行序列比对,找到了与斑马鱼富含亮氨酸重复蛋白、横跨膜蛋白50a、ADP核糖化因子和细胞因子受体家族b8同源的分子标记。本研究结果对鲤鱼分子标记辅助育种和疾病调控具有重要应用价值。
- 于彬彬贾志武张晓峰郑先虎郝卓然于倩孙效文
- 关键词：镜鲤QTL酸性磷酸酶
- 鲤和斑马鱼HOX基因家族同义密码子使用偏性的分析被引量：7
- 2013年
- 运用Codon W程序计算和统计分析了鲤和斑马鱼HOX基因家族密码子组成、同义密码子使用频率。结果表明,鲤和斑马鱼HOX基因家族的最优密码子分别为6和9种。鲤和斑马鱼以A或U结尾的密码子发生强烈偏向;最优密码子的使用频率(Fop)与密码子适应指数(CAI)、密码子偏爱指数(CBI)、基因的G+C含量(GC),尤其是第三位密码子的G+C百分含量(GC3S)之间呈极显著的正相关(鲤和斑马鱼的相关系数分别为r=0.5946和0.7884、0.9772和0.9616、0.3356和0.5380、0.5424和0.8144),而与有效等位基因数ENc存在显著负相关(相关系数r=-0.1241和0.3987)。实验表明:同义密码子第三位密码子碱基含量和组成直接影响着最优密码子使用偏性,基因的表达水平越高,对密码子的使用偏性越强。
- 周丹薛仁余张晓峰杜科马吉敏顾颖孙效文
- 关键词：鲤鱼斑马鱼GC含量
