天津市自然科学基金(13JCZDJC31100)
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- 衣壳粒蛋白稳定性的分子动力学模拟
- 2013年
- 病毒样颗粒(virus-like particle,VLP)是衣壳粒蛋白(Capsomere,Cap)形成的分子自组装体,在疫苗、基因治疗和药物输送等领域具有广阔应用前景。Cap的构象稳定性是影响VLP自组装的关键因素。因此,通过全原子分子动力学模拟考察溶液条件对Cap稳定性的影响,展示此过程的构象变化,分析溶剂结构等影响因素,确定溶液条件调控Cap稳定性的微观机理。模拟结果表明,在纯水和稳定缓冲液两种溶液中,蛋白质均通过静电相互作用吸引Na+富集于表面,使其和水分子共同形成包裹蛋白质的壳层结构。这是溶液稳定Cap的重要因素。稳定缓冲液中,大量Na+富集于蛋白质表面,并通过静电吸引诱导形成Cl-壳层。多壳层结构能够更好包裹蛋白质使Cap内部氢键作用增强,从而更好稳定Cap。研究结果初步展示溶液条件调控Cap稳定性的微观机理,为VLP自组装过程调控奠定理论基础。
- 白姝唐荣宏张麟
- 关键词：构象变化氢键分子机理
