国家林业公益性行业科研专项(200904032)
- 作品数：1 被引量：29H指数：1
- 相关作者：王玉柱上官凌飞章镇李晓颖宁宁更多>>
- 相关机构：南京农业大学北京市农林科学院林业果树研究所更多>>
- 发文基金：北京市自然科学基金国家林业公益性行业科研专项国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 杏EST-SSR标记的开发被引量：29
- 2011年
- 利用MISA软件对NCBI上杏的15387条EST序列进行SSR位点查找,发掘出含有SSR位点的序列1073条,共有1353个SSR位点,候选SSR位点出现的频率为8.79%。二核苷酸、三核苷酸和四核苷酸重复是最主要的重复类型,分别占23.50%、38.80%和23.43%。设计了50对EST-SSR引物并进行PCR扩增,发现40对引物能扩增出理想的PCR产物,其中有25对引物能够扩增出多态性带。随机对7对引物的部分杏扩增片段进行了测序分析,发现有57.1%的片段具有相应的SSR位点,对梅DNA指纹中部分谱带的测序结果也证明是杏扩增出的相应的SSR位点。根据推算,从杏EST中开发SSR标记的开发效率为3.98%。进一步选用20对扩增效果最好的引物对24个杏品种,16个花梅品种以及8个果梅品种进行DNA指纹构建与遗传多样性分析,结果表明,来源于杏的EST-SSR引物在梅中有很高的通用性,杏和梅是遗传差异明显的两种植物,果梅与花梅在遗传上是不能分为两类的同种植物。
- 上官凌飞李晓颖宁宁王玉柱章镇房经贵
- 关键词：EST-SSR
