浙江省自然科学基金(Y405553)
- 作品数：2 被引量：6H指数：2
- 相关作者：王向红张强马润年刘文斌朱翔鸥更多>>
- 相关机构：温州大学大连大学空军工程大学更多>>
- 发文基金：浙江省自然科学基金国家自然科学基金中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术理学更多>>
- 蛋白质三级结构对蛋白质内部形成紧密接触对速率的影响被引量：2
- 2008年
- 通过蛋白质分子内两残基间距的概率分布函数P(r),计算了641个蛋白质分子内近程和远程紧密接触对的形成速率.分析了不同蛋白质结构,不同紧密接触对半径以及DNA的绑定对速率的影响.结果表明:不同结构类型蛋白近程和远程紧密接触对的形成速率的变化趋势恰好相反.近程紧密接触对的形成速率kS随着n(n=|j-i|)的增大而增大,远程紧密接触对的形成速率kL随着n的增大而减小,并且远程紧密接触对的形成速率kL满足kL(n)∝n-γ的关系.γ值随着紧密接触对半径a的增大而变小,当a=0.6 nm时,全α蛋白的γ值等于0.382,α/β蛋白的γ值等于0.343,全β和α+β蛋白的γ值等于0.218.DNA的绑定使蛋白质分子内近程和远程紧密接触对的形成速率都减小.
- 施苏广王向红官铬刚
- 一种优化DNA计算模板性能的新方法被引量：4
- 2008年
- 编码问题是目前DNA计算中的重点和难点之一,该文介绍了影响编码的各种因素及模板编码的基本思想。在此基础上分析了移位杂交出现的原因,提出了提高模板结合移位距离的一种新算法。该算法一方面降低了搜索空间,另一方面筛选了那些自身移位距离性质差的序列因而提高了算法的效率。计算结果表明模板集合的性能明显提高。此外,在保持01含量基本不变的情况下,适当扩展模板集合的搜索范围可以增加模板的数量。
- 刘文斌朱翔鸥王向红张强马润年
- 关键词：DNA计算
