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国家自然科学基金(30330020)

作品数:22 被引量:53H指数:4
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文献类型

  • 21篇中文期刊文章

领域

  • 17篇生物学
  • 2篇环境科学与工...
  • 2篇农业科学
  • 1篇轻工技术与工...

主题

  • 11篇耐辐射球菌
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  • 2篇萝卜
  • 2篇类胡萝卜素
  • 2篇胡萝卜
  • 2篇胡萝卜素
  • 2篇感器
  • 2篇SBCD

机构

  • 14篇浙江大学

作者

  • 14篇华跃进
  • 7篇田兵
  • 4篇陆辉明
  • 4篇高冠军
  • 3篇许镇坚
  • 3篇黄丽芬
  • 2篇周庆
  • 2篇华孝挺
  • 2篇徐步进
  • 2篇徐虹
  • 2篇范陆
  • 2篇吴媛媛
  • 2篇张新觉
  • 2篇林军
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  • 1篇马辰宇
  • 1篇张韶文
  • 1篇王梁燕
  • 1篇陈仲中

传媒

  • 6篇科学通报
  • 6篇Scienc...
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  • 2篇中国农业科技...
  • 1篇中国科学(C...
  • 1篇核农学报
  • 1篇中国食品学报
  • 1篇Scienc...

年份

  • 1篇2012
  • 2篇2008
  • 11篇2007
  • 4篇2006
  • 3篇2005
22 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
极端耐辐射球菌sbcD基因(dr1921)功能分析被引量:1
2007年
在真核生物中,Mre11-Rad50-Nbs1(MRN)复合体处于DNA修复和细胞周期调控的关键位置.当DNA双链断裂损伤诱导后,MRN复合体可快速与损伤部位结合,参与起始的DNA末端的处理.在MRN复合体中,任何一个亚基的基因突变都会引起生物体对DNA损伤超敏感、基因组不稳定、端粒缩短和减数分裂异常.MR蛋白在进化上高度保守.Mre11和Rad50在细菌中的直系同源物分别是SbcD和SbcC.极端抗辐射的耐辐射球菌能修复大量的DNA双链断裂.其SbcD和SbcC蛋白分别由Dr1921和Dr1922基因编码.本研究应用定点反向插入突变的技术,构建了SbcD基因突变株.发现突变株对电离辐射、紫外线、过氧化氢和丝裂霉素C等DNA损伤诱变试剂敏感.同时还发现,drSbcD蛋白,无论是在细胞正常生长状态下,还是在DNA修复过程中,特别是对6000Gy电离辐射所产生的DNA双链断裂的修复有重要的作用.综上所述,drSbcD蛋白在DNA双链断裂修复的过程中扮演重要的角色.
胡沂淮马辰宇田兵林军华跃进
关键词:SBCDDNA耐辐射球菌
类核环形结构在耐辐射球菌电离辐射抗性中不起主要作用被引量:1
2007年
近来基于透射电子显微镜研究的论点“耐辐射球菌(Deinococcus radiodurans)R1类核致密的环形结构是其极端辐射抗性的关键因素”已引起广泛争议.本文在以前研究基础上系统地比较了野生型R1菌株、pprI(DR0167)基因突变株YR1及pprI基因功能补偿株在电离辐射前后的类核结构的形态差异.荧光显微镜观察结果显示:(ⅰ)具有超强电离辐射抗性的野生型菌株R1细胞类核主要呈现紧凑的环形结构,而同样有环形类核结构的pprI突变株YR1细胞却对辐射非常敏感;(ⅱ)2个pprI基因功能补偿株,YR1001(pprI全基因功能补偿株)类核绝大多数呈现絮乱松散的不规则形态,YR1002(pprI部分基因功能补偿株)呈现约60%左右的环形类核结构,这两个菌株都具有与野生型R1同样的电离辐射抗性;(ⅲ)另一pprI部分基因功能补偿株YR1004(敲除pprI基因3′端333个碱基对)对电离辐射极其敏感,其约60%左右的细胞含有环形的类核结构.上述结果表明,耐辐射球菌类核的环形结构在辐射极端抗性中不起主要作用.
高冠军陆辉明尹龙飞华跃进
关键词:电离辐射
dr1127:A novel gene of Deinococcus radiodurans responsible for oxidative stress
2007年
The functional analysis of dr1127,a novel gene in Deinococcus radiodurans was performed in this pa-per. The dr1127 gene was found occasionally in our microarray and 2-DE gel experiments. Mutation of the dr1127 gene decreased the γ-radiation and H2O2 resistance of D. radiodurans,and weakened the scavenging abilities of cell extracts for free radicals (superoxide anion,hydrogen peroxide,and hy-droxyl radical). Further oxidative damage assays demonstrated that the purified DR1127 protein of D. radiodurans could bind to double stranded DNA in vitro and protect DNA from oxidative damage in this way. These results suggest that the dr1127 gene is an important gene that can maintain γ-radiation and oxidative resistance in D. radiodurans and may take part in the oxidative stress process.
WU YuanYuan TIAN Bing HUA YueJint
关键词:异常基因基因突变
耐辐射球菌抗氧化系统中的一个新成员dr1127被引量:2
2007年
构建了一个耐辐射球菌(Deinococcus radioduran)未知基因dr1127的功能缺陷株MT1127.γ射线和H2O2处理R1和MT1127的结果表明,dr1127基因的缺失影响了耐辐射球菌的辐射抗性和氧化抗性.测试了指数生长期和稳定期的R1株和MT1127株的细胞提取物活性氧自由基清除能力,结果发现,无论是超氧阴离子、H2O2还是羟自由基,MT1127株均表现为更弱的自由基清除能力,这些结果与前面的生存率实验结果相吻合,也在一定程度上帮助我们理解dr1127基因的功能.同时,在大肠杆菌BL21(DE3)系统中成功表达了dr1127基因产物,纯化得到46kD的蛋白产物,利用Fe2+-H2O2氧化损伤系统,检测到DR1127蛋白在体外保护DNA免受氧化损伤的功能,并测到该蛋白能通过结合双链DNA的方式来实现保护DNA的功能.本研究揭示了dr1127基因在氧化损伤胁迫中的功能,为耐辐射球菌庞大而又复杂的抗氧化系统增添了新的成员,也为深入研究耐辐射球菌的超强辐射抗性开辟了一个新的研究思路.
吴媛媛田兵华跃进
关键词:耐辐射球菌抗氧化
Cooperation of PprI and DrRRA in response to extreme ionizing radiation in Deinococcus radiodurans被引量:7
2012年
Deinococcus radiodurans possesses extreme resistance to ionizing radiation,and has been engineered for the remediation of toxic components in radioactive environments.We have previously shown that PprI(also named IrrE)and DrRRA are essential for the DNA protection and repair pathways that respond to ionizing radiation stress in this species.Here,we investigated the combined roles of PprI and DrRRA in resistance to gamma radiation(800 Gy).The double mutant,△drRRA△pprI,was more sensitive to gamma rays than either△drRRA or△pprI single mutants,and exhibited an elevated level of intracellular protein carbonylation,an extended delay in genome reconstitution and reduced transcriptional levels of certain DNA protection and repair proteins,such as kat,sod,recA and pprA.Interestingly,the induction of DrRRA by ionizing radiation was partially inhibited by the deletion of pprI. Taken together,these results suggest that DrRRA and PprI might have collaborative roles in the response of D.radiodurans to extreme ionizing radiation.
WANG LiangYanYIN LongFeiXU GuangZhiLI MingFengZHANG HuiTIAN BinHUA YueJin
关键词:电离辐射诱导耐辐射球菌伽玛射线
耐辐射球菌DNA修复机制研究新进展被引量:3
2007年
耐辐射球菌是迄今为止发现的最耐辐射的原核生物,是研究DNA损伤与修复的模式生物。根据国内外实验室和本实验在耐辐射球菌研究上取得的最新研究成果,本文从该细菌的结构特征、分子防御机制、重要修复基因、基因组学和蛋白质组学等方面综述了耐辐射球菌在DNA修复机制方面取得的进展,探讨了未来揭示该细菌独特高效的DNA修复分子机理可能采取的途径。
黄丽芬陆辉明华孝挺华跃进
关键词:耐辐射球菌DNA修复蛋白质组学基因组学
从耐辐射球菌发酵液中提取类胡萝卜素方法的研究被引量:4
2005年
对耐辐射球菌(Deinococcusradiodurans)发酵液制取类胡萝卜素的提取方法和发酵培养条件进行了初步研究。用有机溶剂溶解菌体细胞并萃取得到类胡萝卜素;采用正交实验对发酵培养基的成分、配比进行了优化。结果表明,以甲醇为溶剂的提取效果最好,成本较低,因此采用甲醇作为提取类胡萝卜素的溶剂。4种天然培养基发酵制备类胡萝卜素的实验结果表明,以豆饼粉培养基的效果最佳,表现为菌体生物量最大,同时类胡萝卜素的产量也最高,是蛋白胨酵母提取物葡萄糖(TGY)培养基的1.563倍。正交实验的结果说明,改变各因子(添加碳源、氮源,pH值)的水平均能显著地影响耐辐射球菌的类胡萝卜素产量(添加葡萄糖和硝酸钠分别比豆饼培养基提高类胡萝卜素产量1.763倍和2.018倍)。多因素多水平实验结果表明,以A3B3C1(葡萄糖3g/L,硝酸钠1.5g/L,pH=6.0)组合的效果最优,其类胡萝卜素产量达到2.318mg/g。本研究为微生物发酵生产天然类胡萝卜素提供了一种新的可行的微生物资源,也为利用耐辐射球菌工业化生产类胡萝卜素提供了实验基础。
吴媛媛田兵张韶文华跃进
关键词:耐辐射奇球菌类胡萝卜素耐辐射球菌发酵液微生物发酵生产正交实验
耐辐射球菌DNA修复开关基因pprI缺陷性突变和功能补偿性突变株的建立被引量:5
2005年
PprI是近来在耐辐射球菌Deinococcus,radiodurans中发现的一个极其重要的DNA修复开关基因.以已测序的野生型菌株R1为材料,运用PCR突变法将克隆具有自身GroEL启动子和卡那霉素抗性基因的DNA片段反向重组到pprI基因中去,首次获得了卡那霉素抗性的、pprI功能完全破坏的突变株YR1.辐射细胞生存率结果表明,YR1对辐射异常敏感.另外,将含有GroEL启动子和卡那霉素抗性基因的DNA片段重组到质粒pRADZ3中,获得了具有卡那霉素抗性的表达质粒pRADK;再将体外克隆的具有pprI完整基因和C-末端结构域截短的PprI蛋白基因片段分别重组到pRADK中.研究结果表明,含有pprI完整基因的表达质粒在YR1中能够正常表达,并完全恢复到野生型的极端抗性;而C-末端结构域截短的PprI蛋白基因片段虽能在YR1中正常表达,但对辐射异常敏感,不能恢复其极端抗性.上述pprI基因功能缺陷性和功能补偿性突变株的建立,为深入研究细胞体内PprI蛋白质的定位、结构域与功能的关系,以及原位研究PprI蛋白质的理化特性提供了十分有效的方法.
高冠军陆辉明黄丽芬华跃进
关键词:性基因DNA修复卡那霉素抗性耐辐射球菌
耐辐射奇球菌Deinococcus radiodurans中非编码RNA被引量:3
2006年
耐辐射奇球菌(Deinococcus Radiodurans)对电离辐射、紫外线以及强氧化剂等方面具有惊人的抗性。非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)在参与转录调控、RNA的加工与修饰、mRNA的转录、蛋白质的运输与稳定性调节等方面具有非常明显的作用。本文通过概率上下文无关算法(Stochastic ContextFree Grammar,SCFG),对耐辐射奇球菌R1菌株的基因间序列进行相似二级结构预测,结果发现,在耐辐射奇球菌R1基因组的非编码区存在28个非编码RNA家族。其中IRE家族成员最多,其次是Histone3、tRNA和SECIS家族。所发现的DicF与ctRNA_pGA1t、mRNA等家族成员为细菌所特有。与其他生物比较分析结果显示,可以用这些非编码RNA来研究耐辐射奇球菌的生物学功能,并为进一步研究其DNA损伤与修复分子机制提供依据。
陈仲中王梁燕林军田兵华跃进
关键词:耐辐射奇球菌非编码RNARNA
耐辐射奇球菌光敏色素基因缺失突变株的构建及其功能研究被引量:1
2007年
利用PCR和体内同源重组技术,对耐辐射奇球菌(Deinococcus radiodurans R1)中光敏色素基因诱导缺失突变,构建了突变株bphP-。对突变株分别进行不同剂量电离辐射(IR)和不同浓度过氧化氢(H2O2)处理,并以野生株R1做对照。结果表明:与野生株相比,突变株bphP-对过氧化氢的敏感性明显上升,而对电离辐射的抗性野生型基本不变。不同性质的光照试验显示,强白光对野生菌株和光敏色素突变的耐辐射奇球菌都具有显著的抑制菌落生长作用,两者差异不明显。红光和蓝光对野生株和突变株的生长都没有明显的抑制作用。强白光照射对没有光敏色素调控体系的大肠杆菌K12菌株抑制不明显。因此,耐辐射奇球菌中光敏色素可能主要是作为氧化环境信号传递和调控的蛋白。
范陆许镇坚田兵华跃进
关键词:耐辐射奇球菌光敏色素光损伤
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