河南省杰出人才创新基金(0521001900)
- 作品数：17 被引量：155H指数：10
- 相关作者：陈宏雷初朝张春雷张争锋蓝贤勇更多>>
- 相关机构：西北农林科技大学徐州师范大学山东省计算中心更多>>
- 发文基金：河南省杰出人才创新基金国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 从Cyt b基因全序列分析中国10个黄牛品种的系统进化关系被引量：27
- 2006年
- 基于Cyt b基因全长序列,对我国10个地方黄牛品种的遗传多态性和系统发育关系进行了分析.中国黄牛Cyt b基因序列富含碱基A和T,A+T平均含量为56.7%,密码子第3位点核苷酸表现出较强的碱基组成偏倚,该位点上G的含量最低,为3.5%,而A的含量最高,为44.6%,核苷酸组成偏差指数为0.45.在47个个体1 140 bp的序列中检测到30个变异位点,约占核苷酸总数的2.63%,密码子第3位点的突变率(76.7%)远高于第1位点(16.7%)和第2位点(6.6%),第2位点的非同义替代率(100%)远高于第1位点(40%)和第3位点(4.3%).定义了15种单倍型.将10个品种作为一个大的种群分析时,发现中国黄牛Cyt b基因具有较高的单倍型多样性(Hd=0.783±0.046)和一定程度的核苷酸多样性(Pi=0.00828±0.00030),这与中国黄牛地理分布广、种群庞大和起源复杂有关系.基于Kimura 2-parameter距离采用UPGMA法构建的10个黄牛品种分子系统树中将47个个体分别与瘤牛和普通牛聚在一起,说明中国黄牛主要起源于瘤牛和普通牛.北方牛受普通牛的影响较大,南方牛受瘤牛的影响较大,但是对于亲缘关系复杂的中原地区黄牛而言,瘤牛和普通牛对它们的影响力大小因品种而异,因而它们分别和北方牛和南方牛之间的亲缘关系远近程度也存在差异.不同品种之间的亲缘关系差异可能与它们的地理分布差异具有一定的关系.
- 蔡欣陈宏雷初朝王珊张志清薛恺王新庄
- 关键词：黄牛CYTB基因遗传多态性系统进化
- 郏县红牛IGF2基因多态性与生长性状关系研究被引量：8
- 2008年
- 本研究利用PCR-SSCP技术首次对郏县红牛母牛IGF2基因多态性及其与生长性状关系进行了研究。结果表明:IGF2基因第2外显子表现多态性,存在AA、AB、BB三种不同基因型。其频率分别为0.235/0.480/0.285;A/B等位基因频率分别为0.474/0.526;该位点纯合度为0.501,杂合度为0.499,位点间有效等位基因数为1.996。该基因位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。通过对郏县红牛IGF2基因第2外显子位点不同基因型与样本体重及其它体尺指标的关联分析表明:不同基因型对胸围(P<0.01)和体重(P<0.05)有显著影响,AB基因型个体的胸围和体重明显大于AA和BB型个体。说明IGF2基因可以作为标记用于郏县红牛的肉用选育。
- 毛海霞陈宏张春雷张争锋雷初朝蓝贤勇王居强
- 关键词：郏县红牛IGF2基因
- 牛BoLA-DRB_3基因的多态性与乳房炎相关性初探被引量：14
- 2006年
- 利用PCR-RFLP技术对易感乳房炎的奶牛血样24份,不易感染乳房炎的2个黄牛品种南阳牛、秦川牛血样66份共计90个个体进行牛BoL A-DRB3基因第2外显子多态性分析。结果表明:扩增大小为252 bp的片段经限制性内切酶B stU I酶切后表现多态,且奶牛AA型个体显著高于黄牛品种,提示BoL A等位基因A作为母牛乳房炎易感性的候选标记具有潜在的有效性。
- 杨东英陈宏张良志胡沈荣苏利红王新庄王居强
- 关键词：多态性
- 黄牛HESX1基因多态性及其与生长性状的关联分析
- SX1(homeobox expressed in ES cells)是成对转录因子，参与胚胎早期发育。HESX1对调控垂体前叶激素(GH、ACTH、FSH、LH等)的分泌至关重要，同时也对垂体后叶的生成有一定的调控作用...
- 赖新生陈宏蓝贤勇王鑫磊王柯忆雷初朝王居强
- 关键词：生长性状
- 中国3个牛种cyt b基因多态性及其系统发育研究被引量：15
- 2007年
- 基于mtDNA cyt b基因全长序列,对中国黄牛、牦牛和水牛的遗传多态性和系统发育关系进行了分析。结果表明,中国黄牛、牦牛和水牛cyt b基因序列中碱基A和T的含量均比较高,A+T的平均含量分别为56.6%,58.2%和56.0%。黄牛在cyt b基因全长序列具有较丰富的核苷酸多样性(Pi=0.016 84),水牛的核苷酸多样性相对贫乏(Pi=0.003 51),牦牛的核苷酸多样性介于二者之间(Pi=0.012 28)。中国黄牛与牦牛和欧洲野牛之间的亲缘关系相对较近,而与水牛间的亲缘关系则相对较远,黄牛有普通牛和瘤牛2个母系起源;中国牦牛和斑腾牛以及羯牛的亲缘关系相对较近;中国水牛和沼泽型水牛具有较近的亲缘关系,也可能有2个或者2个以上的母系起源。
- 蔡欣陈宏雷初朝胡沈荣苏利红
- 关键词：中国黄牛中国牦牛中国水牛CYT
- 郏县红牛CLPG基因PCR-SSCP研究
- 本文利用PCR-SSCP技术对113头郏县红牛CLPG基因的多态性进行了分析。发现有三个等位基因A、B、C,他们的基因频率分别为0．8673,0．0619和0．0708．仅发现AA、AB 和AC三种基因型,频率分别为0．...
- 陈付英陈宏王新庄牛晖王居强王轶敏
- 关键词：郏县红牛PCR-SSCPPOLYMORPHISM
- 文献传递
- 郏县红牛ZAG基因多态性与生长性状的相关性被引量：4
- 2008年
- ZAG基因的功能主要是促进脂肪分解,减少脂肪含量。文章利用PCR-SSCP和DNA测序技术研究了145头郏县红牛ZAG基因编码区4个位点(Z1、Z2、Z3、Z4)的多态性,发现Z1、Z3、Z4位点存在SSCP多态。对不同SSCP带型的对应片段进行了测序分析,共发现6个新的SNP多态位点(C115T、A3257G、A4013G、T4027C、C4032T、T4120C)。Z3位点处于Hardy-Weinberg平衡状态,Z1、Z4位点处于非平衡状态。不同基因型与生长发育性状的相关性分析显示,Z4位点上,AC基因型个体的体斜长、胸围、管围、体重指标显著(P<0.05)或极显著(P<0.01),大于AA、AB基因型个体,暗示该位点有可能作为郏县红牛生长性状标记辅助选择的标记之一。
- 郭义昆陈宏张宝潘传英张良志赵苗张存芳蓝贤勇王居强
- 关键词：郏县红牛PCR-SSCP生长发育性状
- 5种家畜IGFBP3基因遗传变异研究被引量：10
- 2007年
- 利用PCR-RFLP技术对山羊(西农萨能奶山羊和关中奶山羊)、绵羊(小尾寒羊)、普通牛(南阳牛)、水牛(湖南彬洲水牛)和牦牛(青海牦牛)等5种家畜213份样品IGFBP3 Hae位点进行了遗传多样性研究,并对山羊、绵羊、普通牛和水牛IGFBP3基因序列进行了同源性分析。结果显示,5种家畜物种IGFBP3基因Hae酶切表现明显物种间多样性,在普通牛上表现多态性,而在山羊、绵羊和牦牛上未表现多态性;山羊IGFBP3基因序列与绵羊、普通牛和水牛的同源性分别为97%,93%,93%,绵羊IGFBP3基因序列与普通牛和水牛的同源性分别为93%和92%,而普通牛和水牛的IGFBP3基因序列同源性为96%;绵羊和山羊的亲缘关系最近,首先聚为一支,然后再与普通牛、水牛相聚。表明Hae酶切位点具有物种多样性,可用于物种间亲缘关系的分析。
- 于姣陈宏蓝贤勇潘传英孙维斌张润锋房兴堂刘波
- 关键词：水牛牦牛普通牛IGFBP3基因
- 南阳牛IGF2基因第2外显子多态性及其与生长发育相关性研究被引量：12
- 2007年
- 以126头纯种南阳黄牛为研究材料,利用PCR-RFLPs技术对胰岛素样生长因子2(IGF2)第2外显子的多态性及其与生长发育的相关性进行了分析。结果表明:南阳牛在该位点的遗传多态性丰富。检测到2种等位基因A和B,频率分别为0.686 5和0.313 5,A等位基因在群体中是优势等位基因;BB型个体的6、12、18、24月龄体斜长和胸围,12、18和24月龄的坐骨端宽,初生、6月龄和24月龄体重等体征性状显著地优于AA型;6月龄体斜长、12月龄的胸围、18月龄和24月龄坐骨端宽也显著优于杂合型。初步推断IGF2基因是非常有价值的辅助选择标记,可为南阳牛肉用型方向选择提供理论依据。
- 张争锋陈宏李秋玲雷初朝薛恺王新庄王轶敏牛晖
- 关键词：IGF2南阳牛PCR-RFLP生长发育
- 牛MyoG基因启动子的克隆与序列分析被引量：17
- 2006年
- 根据G enB ank中已公布的人、猪和小鼠的MyoG基因的5′侧翼和部分第一外显子序列设计PCR引物,用touch-dow n PCR技术扩增了牛MyoG基因的启动子序列,构建了重组克隆载体pGEM-T-MyoG,并通过PCR扩增、限制性酶切对阳性克隆进行了鉴定、测序及生物信息学分析。结果表明,牛MyoG基因的启动子序列(G en-bank中注册号为AY 882581)长度为672 bp,其与猪、人和小鼠相应序列的同源性分别为94%,91%和88%,且其在不同物种之间具有一定的保守性。牛MyoG基因启动子的克隆与序列分析为进一步研究牛MyoG基因的表达调控奠定了基础。
- 王珊陈宏蔡欣
- 关键词：MYOG基因启动子序列
