国际科技合作与交流专项项目(2006DFA32380)
- 作品数：18 被引量：117H指数：8
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- 相关机构：天津市农业科学院天津大学河北农业大学更多>>
- 发文基金：国际科技合作与交流专项项目天津市农业科学院院长基金天津市科技计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 基于Special-Base模型检测转基因作物nos/plamid构建特异性被引量：2
- 2012年
- 以转基因作物中常见的nos/plamid构建特异性序列为研究对象,通过同源性比较和焦磷酸测序dispensation order设计,建立Special-Base焦磷酸测序检测模型;利用转基因大豆Roundup Ready Soybean和转基因玉米Bt11、GA21、NK603等4种转基因作物为试验材料,针对nos/plamid构建特异性序列设计引物,经复合PCR扩增及焦磷酸测序,验证Special-Base焦磷酸测序检测模型有效性。结果表明:本研究建立的Special-Base焦磷酸测序模型能检测出样品中单一或多种转基因作物成分,提高了转基因作物检测的精确性、检测通量和自动化程度。
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- 关键词：复合PCR焦磷酸测序
- 4种食源性致病菌多重PCR检测技术的研究及应用被引量：8
- 2009年
- 为建立一种利用多重PCR技术检测和鉴定沙门氏菌(Salmonellla spp)、单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)和蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)的方法,根据沙门氏菌侵袭力蛋白A基因(invA gene)、单核细胞增生李斯特菌蛋白转录调控基因(prfA gene)、金黄色葡萄球菌自溶素基因(alt gene)、蜡样芽孢杆菌的促旋酶B亚单位基因(gyrB gene)设计引物,进行多重PCR扩增,并对多重PCR反应体系进行优化。在此基础上建立了4种致病菌的多重PCR检测体系,同时以国标法进行对比验证。结果表明,本研究建立的多重PCR检测方法简单、快速、灵敏度高,具有很好的应用前景。
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- 关键词：食源性致病菌多重PCR
- 贝母属植物叶绿体基因组候选SNP位点应用分析被引量：6
- 2020年
- 贝母属植物是中国中药材的宝库,由于形态上难以区分,在民间应用、临床应用和中药市场中还存在混淆应用、以次充好的现象,急需开发基于新型分子标记位点的精准检测方法。本研究应用多重序列比对、SNP筛选等生物信息学分析手段,对贝母属15种植物28条叶绿体基因组序列进行分析。结果发现,贝母属叶绿体基因组DNA同源性达97.22%,通过分析共发现SNP位点5879个,其中川贝母类鉴别候选位点71个,川贝母鉴别候选位点4个,瓦布贝母鉴别候选位点37个,太白贝母鉴别候选位点147个,浙贝母鉴别候选位点91个,湖北贝母鉴别候选位点271个,平贝母鉴别候选位点1393个,伊贝母鉴别候选位点89个。本研究还对SNP位点在精准鉴定、精确定量应用方面进行了讨论,可为川贝母中药资源鉴定提供技术支撑。
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- 关键词：贝母属叶绿体基因组SNP位点生物信息学分析
- 焦磷酸测序技术在4种食源性致病菌快速检测中的应用被引量：7
- 2013年
- 为建立一种利用焦磷酸测序技术检测和鉴定沙门氏菌(Salmonellla)、单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)和志贺氏菌(Shigella)的方法,通过对4种菌毒力靶基因特异性序列的同源性分析,设计出适合焦磷酸测序特异性扩增和测序的引物,摸索出最佳的焦磷酸测序反应体系和反应程序,并建立了4种食源性致病菌焦磷酸测序快速检测方法。此方法以传统国标法的前增菌为前提,而省去了后期生化验证的繁琐过程,大大缩短了检测时间,并且其准确性与传统生化验证完全一致,灵敏度可达10 CFU/mL。结果表明,作者建立的焦磷酸测序检测方法具有高效、快速、精准及操作简便等特点,为食源性致病菌的快速鉴定开辟了广阔的前景。
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- 关键词：食源性致病菌
- 转基因玉米LAMP检测体系的建立及应用被引量：13
- 2010年
- 以转基因抗虫和耐除草剂玉米Bt11为研究材料,建立Bt11环状等温扩增快速检测技术方法。利用一种具有链置换活性的BstDNA聚合酶,针对Bt11中玉米基因组与外源基因结合处序列,设计4条特异引物,并对反应温度、时间、灵敏度、结果判断方法等参数进行初步探索。结果显示,LAMP检测方法最适反应温度及反应时间分别为65℃和60min,其灵敏度为常规定性PCR的20倍。LAMP技术检测转基因玉米品系Bt11具有特异性高、快速、简便等优点,具有广阔的应用前景。
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- 关键词：转基因玉米
- 应用焦磷酸测序技术快速检测食品中沙门氏菌被引量：9
- 2013年
- 设计出适合特异性扩增引物和测序引物,采取焦磷酸测序技术对沙门氏菌invA毒力靶基因特异性序列分析,同时对焦磷酸测序反应条件进行优化,建立1种利用焦磷酸测序技术检测和鉴定沙门氏菌的方法。结果显示,此方法以传统国标法的前增菌为前提,可省去后期生化验证的繁琐过程,将检测时间由常规检测的4～7d缩短至20h,并且其准确性与传统生化验证完全一致。所建立的针对沙门氏菌的焦磷酸测序检测方法具有高效性、精准及操作简便等特点,适用于食品中沙门氏菌的快速检测。
- 朱珠王永兰青阔朱云燕余景会赵新
- 关键词：沙门氏菌
- 基于LAMP的中药材川贝母真伪鉴别方法的建立被引量：9
- 2019年
- 目的:基于荧光-环状等温扩增技术,建立川贝母快速检测方法,实现中药材川贝母的荧光可视化快速鉴定。方法:依据川贝母物种特异性序列设计5套LAMP引物,并测试方法特异性和灵敏度。结果:引物Set1扩增效率最高;使用该引物建立的川贝母LAMP检测方法仅能够在6种川贝母基源药材中扩增出扩增曲线和荧光变化,在伊贝母、浙贝母、平贝母等7种常见混淆品中无扩增产物,方法特异性良好;方法检测灵敏度为0.1%。结论:本研究建立的基于LAMP的川贝母鉴定方法具有较好的特异性和灵敏度,其快速、操作简单、易观察的优点,填补了中药材川贝母真伪快速筛查的技术空白。
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- 关键词：川贝母分子检测
- 改良Chelex-100法和CTAB法用于转基因抗草甘膦大豆检测效果的比较被引量：13
- 2008年
- 以转基因抗草甘膦大豆为研究材料,分别采用改良Chelex-100法和常规CTAB法提取基因组DNA,以提取DNA的浓度和纯度,同时以PCR扩增大豆的内源基因(lectin)及外源特异性序列(CaMV35S,nos,Cp4-epsps)的效果对两种方法进行比较和评价。结果表明:虽然改良Chelex-100法DNA提取纯度不高,但是提取效率与常规CTAB法相当,而且改良Chelex-100法能够快速在1 h之内从大豆中提取DNA,所提取的DNA可以直接用于PCR扩增反应,PCR扩增产物电泳条带清晰。因此,改良Chelex-100法可以替代CTAB法提取DNA用于转基因检测,该方法具有经济、简便、快速的特点。
- 王永兰青阔张莉赵新朱珠程奕
- 关键词：CTAB法DNA转基因检测
- 转基因大豆GTS40-3-2成分现场可视化检测方法的建立被引量：4
- 2014年
- 转基因大豆GTS40-3-2转化体是种植面积最广的转基因大豆品种,根据GTS40-3-2转化体特异性序列设计引物,应用可视化环介导等温扩增技术,对其进行快速扩增及可视化判断;同时建立转基因成分人工污染的食品模型,比较了LAMP法与定性PCR方法检测的敏感性。结果表明:该方法仅对GTS40-3-2转化体产生特异性扩增,灵敏度高达0.001%。所建立的GTS40-3-2转化体特异性现场可视化筛查方法具有较高的特异性与灵敏性,操作简单、快速,可用于转基因大豆GTS40-3-2成分污染的现场可视化检测。
- 王永兰青阔朱珠赵新陈锐郭永泽程奕
- 饲料中牛、羊源性成分现场可视化检测方法的建立被引量：4
- 2014年
- 根据牛、羊线粒体中物种特异性序列设计引物,应用可视化环状等温扩增技术(visual loop-mediate isothermal amplification,vLAMP)对牛、羊源性成分进行快速扩增及可视化判断,同时建立牛、羊源成分人工污染的饲料模型,考察vLAMP检测方法的灵敏度。结果表明,牛源性引物和羊源性引物仅分别对牛、羊源性成分产生特异性扩增,灵敏度高达0.001%。本试验所建立的牛、羊源性成分现场可视化筛查方法具有较高的特异性与灵敏度,操作简单、快速,可用于饲料中牛、羊源性成分污染和食品掺伪的现场可视化检测。
- 朱珠兰青阔赵新陈锐郭永泽王永
