国家自然科学基金(30940020)
- 作品数：3 被引量：1H指数：1
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- 相关领域：生物学理学机械工程医药卫生更多>>
- 人类基因组非冗余Exon/Intron数据库的构建
- 2010年
- 以Homo.sapiensRefSeq作为原始数据库来构建EID(Exon/Intron Database)可以克服GenBank所带来的冗余问题.通过分析RefSeq基因组数据库中每个CDS(Coding Sequence,编码序列),获得构建EID的相关的数据(基因的定义、基因标识符、基因序列、蛋白质标识符、蛋白质序列、外显子和内含子的数量、大小、总数、非翻译区(UTR)内含子、内含子相位、内含子剪切位点模式).结果表明,人类24条染色体(22条常染色体和2条性染色体,共计2 870 827355 bps)中含有32 157个基因标识符(gene blocks),其中7 398个基因为假基因,4 014个基因发生了可变剪切(Al-ternative Splicing,AS),15 533个基因含有CDS内含子,765个基因含有UTR内含子,2 585个基因不含有内含子,其他的为异常基因.
- 罗冬梅金鹰邓小元刘海
- 关键词：非翻译区
- 肿瘤细胞DNA样品基于二次谐波发生(SHG)的非线性光谱学成像被引量：1
- 2012年
- 二次谐波的产生是一个二阶非线性光学过程,这个过程只发生在中心对称系数不为零的非中心对称区域。利用二次谐波显微技术可以对各种具有内源性信号的生物组织进行无损伤实时成像,如结缔组织的胶原纤维或肌细胞的肌动球蛋白。在生物化学和结构生物学中,虽然DNA是由脱氧核糖核苷酸构成而蛋白质是由氨基酸残基组成,但是DNA和蛋白质大分子高级结构的形成机制是相似的。利用光谱学成像技术对不同DNA样品进行检测,获取DNA样品的SHG信号并进行高解析度成像。这些DNA样品包括基因组DNA溶液、细胞核提取物以及培养细胞的细胞核。实验结果表明在常规条件下可以获得基因组DNA溶液和细胞核提取物的SHG信号,但几乎观测不到来自培养细胞核区的SHG信号。通过在培养基中添加少量无水乙醇(体积比小于5%),可以在培养细胞的细胞核区域检测到SHG信号。推测在培养细胞中乙醇和DNA相互作用引起DNA分子构象发生变化,这些变化可能导致了DNA分子非线性光学性质的改变。
- 罗冬梅邓小元卓双木谭淑雯庄正飞金鹰
- 关键词：基因组DNA
- 肿瘤基因组研究进展
- 2010年
- 所有的肿瘤都源自于细胞基因组DNA序列的异常。在整个生命过程中,甚至从最初的受精卵开始,人体细胞的基因组就暴露于各种突变诱变因素和自身的复制错误之中,这些不利影响可能导致任何细胞的DNA序列渐进的、细微的突变。过去的25年中,这些突变和基因异常如何调控肿瘤的成长已经越来越多地为人们所认识,在此基础上,大量获得肿瘤基因组的完整DNA序列已经成为可能。这些研究将为人类提供肿瘤发生和成长的重要线索。
- 罗冬梅邓小元金鹰
- 关键词：突变异常基因
