海南省研究生创新科研课题(Hyb2012-4)
- 作品数:3 被引量:14H指数:3
- 相关作者:王萌覃碧郑服丛张宇林雨见更多>>
- 相关机构:中国热带农业科学院海南大学更多>>
- 发文基金:海南省研究生创新科研课题国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 巴西橡胶树HbMlo9基因克隆及其序列特征分析被引量:8
- 2013年
- Mlo基因是一类重要的抗病基因,该基因的隐性突变可赋予植物广谱持久的抗病性。本研究以葡萄Mlo9(VvMlo9)基因为探针对巴西橡胶树的EST和转录组数据库进行同源搜索,并将获得的同源EST序列进行拼接,得到巴西橡胶树Mlo9基因的cDNA序列。采用RT-PCR方法成功克隆了橡胶树的Mlo9基因,并命名为HbMlo9。序列分析结果表明,该基因的开放阅读框(ORF)为1 725 bp,编码574个氨基酸,分子量为65.35 ku,等电点为8.93。对HbMlo9蛋白结构域的分析结果发现,该蛋白具有Mlo保守结构域,包含9次跨膜结构和1个典型的N端信号肽。系统进化关系分析结果发现,Mlo是1个比较保守的蛋白家族,HbMlo9与蓖麻Mlo同源性最高,达到88%,其次是桃Mlo(79%)和葡萄VvMlo9(78%)。本研究为验证该基因在巴西橡胶树抗病中的功能奠定基础。
- 覃碧王萌林雨见郑服丛张宇
- 关键词:巴西橡胶树克隆
- 木薯Mlo基因家族成员的鉴定及其序列特征分析被引量:3
- 2013年
- Mlo基因家族是植物重要的抗病基因。本文通过系统分析木薯基因组数据库,从中共鉴定出21个Mlo成员,其中20个具有完整序列,1个只有部分序列。对其中20个具有完整序列的基因与其他物种的Mlo基因进行聚类关系分析,结果显示,可将木薯Mlo基因家族分为6类(I^VI),其中4类都包括有来自拟南芥的Mlo基因,第VI类只包括2个木薯Mlo基因,可能是木薯中特有的一类Mlo;6个木薯Mlo与已知的抗病Mlo基因分别聚在第IV和第V类,这6个基因可能是木薯基因组中具有抗病功能的Mlo。对所有的木薯Mlo蛋白进行结构分析发现,除了MeMlo20外,其他蛋白均具有6~8个跨膜结构,其中3个蛋白具有N端信号肽。
- 覃碧王萌刘巧玲郑服丛张宇
- 关键词:木薯
- 巴西橡胶树1个Mlo基因克隆及其序列特征分析被引量:7
- 2013年
- Mlo基因是植物抗病基因的重要成员。巴西橡胶树Mlo的克隆将为进一步通过转基因技术培育抗病橡胶树新品种奠定基础。本研究以大麦Mlo蛋白序列为探针对橡胶树EST和转录组数据库进行同源搜索,并对同源EST序列进行拼接,得到橡胶树Mlo的cDNA序列。进一步通过RT-PCR扩增,成功克隆了橡胶树Mlo基因,其编码区(CDS)为1668 bp,编码555个氨基酸,分子量为63.14 kDa,等电点是8.85。对所克隆的橡胶树Mlo编码蛋白结构进行分析发现,该蛋白具有Mlo保守结构域,包含8次跨膜结构。聚类分析发现,橡胶树Mlo蛋白与木薯Mlo同源性最高,达到92.1%,其次是蓖麻(87.6%);在拟南芥基因组中,与AtMlo8的相似性最高,达到67%,因此,将橡胶树中克隆的Mlo基因命名为HbMlo8。通过对HbMlo8基因分析可知,该基因属于Mlo家族成员,基因的克隆及其序列分析为进一步验证HbMlo8在橡胶树中的生物学功能奠定基础。
- 覃碧王萌薛松胡中昀郑服丛张宇
- 关键词:巴西橡胶树克隆