河北省自然科学基金(C2008000318)
- 作品数：3 被引量：6H指数：1
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- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 山羊高繁殖力相关基因的筛选与分析被引量：5
- 2011年
- 为查找与山羊繁殖力相关的基因,进一步研究繁殖力调控的遗传机制,本研究选用12只冀中山羊,按照其繁殖记录分为高产和低产2组,应用差异显示反转录PCR(DDRT-PCR)技术,分析了山羊在发情期卵巢组织基因表达的差异。经二次扩增、反式Northern以及半定量PCR验证分析,最终得到4个表达量差异的阳性片段。所得片段经克隆测序提交至GenBank,并进行BLAST分析。结果,4个差异片段中2条为新发现的表达片段,在NCBI中未发现高度同源序列。1条与野猪中获得的克隆片段THY010003E05同源性为81%,但功能未知。另1条差异片段的序列与牛PCNP的mRNA序列的同源性为94%。结果提示,该片段所属基因应属于PCNP基因,结合对其功能的分析结果,推测PCNP可能通过参与卵细胞生成过程中的细胞周期调控影响山羊繁殖力。
- 钱丽丽贾青李雪梅李训业郑会芹冯安学
- 关键词：山羊繁殖力卵巢基因表达
- 山羊卵巢组织繁殖力相关差异表达基因片段的生物信息学分析
- 2012年
- 为考察山羊多羔性的遗传基础,以不同繁殖力的河北中部本地固有山羊为研究对象,在发情期卵巢组织用差异表达PCR方法筛查到4条基因差异片段作为山羊繁殖力性状候选基因。对这些候选基因进行同源性和转录因子结合位点分析,发现4个差异片段中2条为新发现的表达片段。1条与野猪中获得的克隆片段THY010003E05的同源性为81%,但功能未知。另1条差异片段的序列与牛pcnp的mRNA序列的同源性为94%,并据此对山羊pcnp基因进行PCR扩增、克隆及序列测定。应用生物信息学的相关软件和方法,对山羊PC-NP蛋白的理化性质、二级结构、信号肽、核定位序列、磷酸化位点、跨膜区域以及蛋白质功能域等进行预测。结果,山羊pcnp基因完整CDS序列与牛的pcnp基因完整CDS序列同源性为100%,编码区为537bp,编码179个氨基酸;推测与其他已报道的物种一样,山羊PCNP蛋白也是主要位于细胞核中的亲水蛋白,二级结构以无规则卷曲和α螺旋为主,局部为延伸链和β转角;预测出与PCNP蛋白相互作用的5种蛋白,另外还发现了3个LCR(Lowcomplexity region)区域。由此推测,PCNP在物种间相对保守,而且其最可能在细胞核中行使功能,对细胞周期或某些基因的表达产生影响,进而影响山羊繁殖力。
- 冯安学钱丽丽贾青邢增喜
- 关键词：山羊繁殖力差异表达基因生物信息学
- BMP15基因CDS序列的生物信息学分析被引量：1
- 2010年
- 为了应用比较基因组学和生物信息学方法对鼠、人、山羊、猪、牛和绵羊6个物种的34条BMP15基因完整的CDS序列进行比对分析,试验采用BioEdit、DnaSP等生物软件对该基因的遗传多样性、分子系统发育等问题进行了分析。结果表明:34条基因序列共检测到435个多态位点,共生成17个单倍型。物种间及物种内BMP15基因存在较丰富的遗传多样性。
- 钱丽丽贾青冯安学吴伟伟
- 关键词：物种
