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云南省科技厅科研基金(2012CH002)
作品数:
1
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云南边境地区禽流感H5N1亚型病毒NS基因进化分析
被引量:1
2013年
目的阐明云南边境地区禽流感H5N1亚型病毒NS1、NS2基因变异特征及遗传进化关系。方法在云南边境地区采集境外家禽和野生鸟类棉拭子样品,经H5N1亚型特异性多重RT-PCR检测,阳性样品对病毒NS基因进行扩增,克隆至pMD18-T载体测序,获得NS1、NS2基因序列,并与已知参考毒株序列进行序列比对及系统发育分析。结果自1240份样品中检出H5N1亚型阳性样品71份,阳性率为5.72%;30份代表性阳性样品病毒NS基因测序获得17种序列,存在3个不同进化(亚)分支(Ⅰ-1、Ⅰ-2、Ⅱ);NS1/NS2基因与病毒血凝素(HA)基因呈现不同进化关系;NS1蛋白涉及核定位信号区、RNA结合区、效应区及其他致病性相关的关键性氨基酸位点存在替代或突变。结论云南边境地区H5N1亚型病毒NS1/NS2基因具有遗传差异,2010年以来NS基因进化分支Ⅰ-2、Ⅱ已成为当地流行的优势毒株。
肖雪
张文东
段博芳
赵焕云
刘庆亮
胡挺松
邱薇
冯子良
郑颖
范泉水
张应国
张富强
关键词:
禽流感病毒
H5N1亚型
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